1 有机质的起源和保存 1
1.1 生物标志化合物的简介 1
1.2 生命活动的范围 1
1.3 初级生产率 4
1.4 二级生产率 6
1.5 有机质的保存 7
1.6 岩石中的有机成分 8
1.7 含氧与缺氧沉积 9
1.8 沉积速率与颗粒的大小 12
1.9 湖泊与海相沉积环境 14
1.10 烃源岩的时间和区间分布 15
2 有机化学 16
2.1 烷烃：σ键 17
2.2 烷烃：π键 17
2.3 芳香族：苯 18
2.4 结构表示法 18
2.5 三维在二维空间的投影 19
2.6 无环烷烃 20
2.7 无环烯烃 22
2.8 单环烷烃 23
2.9 多环环烷烃 24
2.10 异戊二烯法则 25
2.11 芳香烃 30
2.12 杂环芳构分子 30
2.13 立体化学及命名 33
2.14 手性 34
2.15 光学活性 35
2.16 不对称中心的命名（R、S、α和β） 36
2.17 立体异构化 40
2.18 特定生物标志物的立体化学 41
2.19 练习 46
3 生物标志化合物的生物化学 47
3.1 类脂膜 47
3.2 细胞膜类脂 49
3.3 类脂膜的流动性 52
3.4 萜类化合物的生物合成 54
3.5 生物圈和岩石圈中的藿烷类化合物和甾醇 60
3.6 光合作用下的卟啉和其他生物标志物 67
3.7 类胡萝卜素 72
4 样品的地球化学筛选 76
4.1 烃源岩的筛选：质量和数量 76
4.2 烃源岩的筛选：热成熟度 92
4.3 地球化学测井数据和生烃潜力指数 99
4.4 原始烃源岩生烃潜力的恢复 101
4.5 原生沥青的检测 104
4.6 远景储集岩中原油的检测 105
4.7 原油的筛选 105
4.8 储层的连通性和充注史 113
4.9 采用活塞岩心进行地表地球化学勘探 116
4.10 样品的质量、筛选和储存 118
4.11 岩石和原油的地球化学标准 121
4.12 附录：质量平衡公式的推导 122
5 炼制原油的检测 125
5.1 原油检测的基本方法 126
5.2 先进的原油检测方法 133
5.3 石油的炼制 135
5.4 炼制产物中的生物标志化合物 138
6 稳定同位素比值 141
6.1 标准及符号表示法 142
6.2 稳定碳同位素测定 142
6.3 稳定碳同位素分馏 143
6.4 应用不同的标准转换δ值 145
6.5 稳定碳同位素比值的应用 145
6.6 特征化合物同位素分析（CSIA） 155
6.7 硫和氢同位素 160
7 辅助性的地球化学方法 165
7.1 金刚烷类化合物 165
7.2 C7烃类分析 171
7.3 轻烃的特征化合物同位素分析 203
7.4 分子建模 205
7.5 流体包裹体 206
8 生物标志化合物的分离与分析 210
8.1 生物标志化合物实验室的构成 210
8.2 样品的清洗与分离 210
8.3 内标物及初步分析 213
8.4 沸石分子筛 214
8.5 气相色谱-质谱法 220
8.6 质谱与化合物鉴定 248
8.7 生物标志化合物的定量分析 250
9 石油的成因 260
9.1 历史背景 260
9.2 地球深部气体假说 262
9.3 非生物成因烃类气体 264
9.4 石油热成因假说 267
10 生物标志化合物在环境评价中的应用 280
10.1 环境标记物 280
10.2 原油泄漏 282
10.3 影响海洋泄油命运的过程 285
10.4 缓解原油泄漏的危害 288
10.5 海洋原油泄漏的模拟 288
10.6 陆上的原油泄漏 290
10.7 地下泄漏 290
10.8 石油的毒性 291
10.9 环境化学场与实验室的流程 293
10.10 泄漏原油的化学指纹 295
10.11 泄油研究中的生物标志化合物和多环芳香烃分析 299
10.12 生物标志化合物和多环芳香烃在原油泄漏研究中的应用 304
10.13 生物标志化合物与“埃克森·瓦尔迪兹”号泄油 310
10.14 背景成岩成因烃类的来源：煤与油苗假说的对垒 314
10.15 作为污染物的汽油及其他轻质燃料 318
10.16 作为污染物的天然气 321
10.17 烟雾中的生物标志化合物 324
11 生物标志化合物在考古学中的应用 327
11.1 人类的时代 327
11.2 古代含石油物质的起源和运输 328
11.3 考古中的树胶和树脂 333
11.4 艺术品中的生物标志化合物 338
11.5 考古中的木焦油（沥青） 340
11.6 古代饮食和农业活动 342
11.7 考古中的蜂蜡 349
11.8 生物标志化合物与施肥实践 351
11.9 考古中的脱氧核糖核酸（DNA） 352
11.10 古代蛋白质 354
11.11 考古中的麻醉剂 355
11.12 生物标志化合物及交叉学科的研究 357
参考文献 359