第一章 烟草种质资源本底多样性及性状间相关研究 1
第一节 资源介绍及数据采集方法 2
一、烟草资源目录 2
二、数据调查方法 8
三、数据处理方法 9
第二节 烟草种质资源本底多样性概述 9
一、形态特征 9
二、农艺性状 13
三、化学成分 18
四、感官评吸 26
第三节 不同种质类型各性状多样性比较 30
一、形态性状 30
二、农艺性状 31
三、化学指标 31
四、感官评吸指标 32
第四节 烤烟和晒烟资源性状间相关分析及通径分析 32
一、烤烟 32
二、晒烟 37
第五节 本章小结 41
一、烟草种质资源本底多样性概述 41
二、不同种质类型各性状多样性比较 42
三、烤烟与晒烟资源性状间相关分析及通径分析 42
参考文献 43
第二章 烟草种质资源核心种质构建 44
第一节 材料与方法 45
一、材料 45
二、试验设计 45
三、数据调查方法 45
四、数据分析 46
第二节 农艺性状基因型及其与环境互作分析和基因型值预测 46
第三节 基于农艺性状的核心种质构建 47
一、农艺性状核心种质构建策略的筛选 48
二、4种抽样比率所得核心种质 50
三、核心种质农艺性状与分子标记遗传多样性 51
第四节 烤烟品质性状的核心种质构建 56
一、烤烟品质性状核心种质构建策略的筛选 57
二、4种抽样比率所得烤烟核心种质 59
三、烤烟核心种质品质性状遗传多样性 59
第五节 晒晾烟品质性状核心种质构建 68
一、晒晾烟品质性状核心种质构建策略的筛选 68
二、4种抽样比率所得晒晾烟核心种质 70
三、晒晾烟核心种质品质性状遗传多样性 70
第六节 本章小结 79
参考文献 79
第三章 烟草种质资源抗病性研究 80
第一节 材料与方法 81
一、材料 81
二、鉴定方法 81
第二节 贵州烟草种质资源抗病性概述 82
第三节 不同类型烟草抗性特征分析 83
一、贵州育成烤烟种质资源 83
二、贵州烤烟农家种质资源 83
三、贵州省外烤烟种质资源 83
四、国外烤烟种质资源 84
五、贵州晒烟资源 84
六、贵州省外晒烟资源 84
七、雪茄烟资源 84
八、白肋烟资源 85
九、其他烟草种质资源 85
第四节 主要病害抗源分析 85
一、青枯病 85
二、黑胫病 88
三、根结线虫 93
四、普通花叶病（TMV） 95
五、黄瓜花叶病（CMV） 99
六、马铃薯Y病毒（PVY） 100
七、赤星病 103
八、气候性斑点病 105
第五节 小结 105
一、鉴定规模 105
二、鉴定方法 105
三、鉴定结果 106
四、蚜传病毒病新抗源的发现 106
五、存在问题 106
参考文献 106
第四章 自育烤烟种质的本底多样性及育种策略 107
第一节 自育烤烟种质的本底多样性 107
一、材料与方法 108
二、自育烤烟种质形态性状本底多样性分析 108
三、自育烤烟种质农艺性状遗传多样性分析 110
四、自育烤烟种质的经济性状 111
五、自育烤烟新种质抗病性分析 112
六、自育烤烟新种质物理检测指标 112
七、自育烤烟新种质化学成分遗传多样性 113
八、自育烤烟新种质评吸指标分析 116
九、自育烤烟新种质创新点 117
第二节 烤烟育种重要农艺和经济性状遗传参数估算 118
一、材料与方法 119
二、结果与分析 119
三、讨论 120
第三节 不同杂交育种方式对拓宽烤烟种质资源遗传多样性的影响 121
一、材料与方法 121
二、结果与分析 123
三、小结与讨论 123
第四节 烤烟品质育种早期间接选择指标的初步确立 124
一、材料与方法 125
二、结果与分析 126
三、小结与讨论 128
第五节 本章小结 128
一、自育烤烟新种质是对现有烤烟种质资源的重要补充 128
二、重要育种农艺和经济性状的遗传分析 128
三、不同育种杂交方式对拓宽烤烟种质资源遗传多样性的影响 129
四、烤烟品质育种早期间接选择指标的初步确立 129
参考文献 129
第五章 烟草种质资源DNA遗传多样性分析 131
第一节 材料与方法 132
一、试验材料 132
二、DNA提取与SRAP分析 138
三、数据统计与分析 139
第二节 结果与分析 139
一、SRAP标记的多态性分析 139
二、不同亚群的遗传多样性分析 152
三、遗传相似系数和遗传距离分析 154
第三节 小结与讨论 156
一、SRAP标记具有烟草类别特异性 156
二、不同亚群间遗传多样性有差异 156
三、自育烤烟种质资源有较丰富的遗传多样性 157
参考文献 157
第六章 烟草种质资源聚类和群体结构分析 158
第一节 材料与方法 158
一、试验材料 158
二、DNA提取与SRAP分析 158
三、数据统计与分析 159
第二节 结果与分析 159
一、聚类分析 159
二、各亚群聚类分析 184
三、基于数学模型的结构分析 186
四、AMOVA分析和群体间分化 196
第三节 小结与讨论 197
一、烟草种质资源基本按照地域或类别聚类 197
二、各亚群间聚类分析 198
三、数学模型结构分析 198
四、AMOVA分析与群体间遗传分化 198
参考文献 199
第七章 烟草亚群特异性及位点与性状间关联分析 200
第一节 材料与方法 200
一、试验材料 200
二、DNA提取与SRAP分析 200
三、数据统计与分析 201
第二节 结果与分析 201
一、烟草亚群间补充等位变异数分析 201
二、烟草亚群特异性分析 203
三、自育烤烟资源性状关联分析 216
第三节 小结与讨论 227
一、烟草亚群间互补等位变异数分析 227
二、利用其他亚群种质资源增加自育烤烟资源等位变异对育种有重要价值 228
三、拓宽自育烤烟遗传背景并利用性状关联变异位点辅助选育 228
参考文献 228
第八章 云烟85多叶突变性状的遗传分析与分子标记定位 230
第一节 材料与方法 230
一、材料 230
二、杂交配组与作图群体的建立 230
三、DNA提取 230
四、建池与引物筛选 231
五、SSR扩增 231
六、SRAP扩增 238
七、扩增产物的检测 239
八、突变基因的定位 239
第二节 结果与分析 239
一、多叶突变性状的遗传 239
二、引物筛选 239
三、多叶突变性状的分子标记定位 240
第三节 讨论 241
参考文献 241
第九章 烤烟种质资源DNA甲基化多样性分析与TMV抗性分子标记初步筛选 243
第一节 材料与方法 243
一、材料 243
二、DNA提取 245
三、MSAP分析 245
四、数据分析 246
第二节 结果与分析 247
一、MSAP指纹图谱构建 247
二、多态性引物筛选 248
三、烤烟DNA甲基化水平分析 250
四、烤烟DNA甲基化聚类分析 250
五、各种质DNA甲基化特征 252
六、部分种质DNA甲基化水平与表型的相关分析 253
七、MSAP带型与TMV抗性相关分析 255
第三节 讨论 257
参考文献 258
第十章 烤烟种质资源腺毛密度及其与主要品质和抗病性状的灰色关联分析 260
第一节 材料与方法 260
一、实验材料 260
二、腺毛密度调查 262
三、数据分析 262
第二节 结果与分析 263
一、烟叶腺毛观察 263
二、腺毛密度分析 264
三、烤烟腺毛密度与相关性状的灰色关联分析 265
第三节 讨论 265
参考文献 266
第十一章 烟草诱变种质创新技术研究 267
第一节 γ射线与EMS单一及复合处理对烤烟种子活力及几种主要农艺性状的诱变效应 267
一、试验与方法 267
二、结果与分析 269
三、小结 276
第二节 γ射线与NaN3单一及复合处理对烤烟种子活力及几种主要农艺性状的诱变效应 276
一、试验与方法 276
二、结果与分析 277
三、小结 284
第三节 小结与讨论 285
参考文献 286
第十二章 烟属植物的起源、进化与分类研究的新进展 288
第一节 烟属起源与分子系统进化 288
一、烟属起源、进化和分类研究主要历程 288
二、烟属分子系统分类与传统分类的比较 290
三、分子系统学对Goodspeed分类不明确种归属的解析 297
第二节 烟属植物学分类新体系 299
一、20世纪中叶前的烟属分类 300
二、Goodspeed分类体系 300
三、烟属新种的发现与命名 301
四、Sandra Knapp对烟属中种的新划分 302
第三节 小结 307
参考文献 308
第十三章 烟草种质资源管理系统操作手册 310
一、系统界面 310
二、档案管理 311
三、系统管理 315