绪论 1
一、分子生物学的基本含义 1
二、分子生物学的主要研究内容 1
三、分子生物学发展简史 3
四、分子生物学研究现状与发展趋势 9
五、分子生物学与农业科学的关系 10
第一章 生物大分子及其相互作用 13
第一节 生物活性物质的本质 13
一、生物活性物质的属性 13
二、生物活性分子的化学本质 14
三、生物大分子的高聚物特性 15
第二节 生物大分子内相互作用的化学力 16
一、生物大分子相互作用的化学力 16
二、生物大分子内部的共价键 17
三、氢键 18
四、离子键 19
五、二硫键 19
六、短程力 20
七、疏水作用 20
八、配位键 21
第三节 生物分子的自组装 22
一、生物分子的共价结构 22
二、生物大分子的自组装 22
三、生物大分子的构型与构象 26
四、膜的组装 28
五、复杂聚集物的自我装配 29
第四节 生物分子的相互作用 30
一、核酸与蛋白质的相互作用 30
二、蛋白质与蛋白质的相互作用 33
三、糖与蛋白质的相互作用 34
四、脂与蛋白质的相互作用 38
本章小结 39
复习思考题 39
第二章 核酸的结构与功能 40
第一节 细胞内的遗传物质 40
一、DNA是主要的遗传物质 40
二、RNA也是遗传物质 41
第二节 核酸的化学组成与共价结构 42
一、核酸的化学组成 42
二、核酸的共价结构 45
第三节 DNA的高级结构 48
一、DNA的二级结构 48
二、DNA的三级结构 59
第四节 真核生物的染色体及其组装 61
一、真核生物的染色体 61
二、染色体中的组蛋白 62
三、核小体的形成 63
四、染色质的高级结构 64
第五节 RNA的高级结构与生物学功能 65
一、tRNA的高级结构 65
二、rRNA的高级结构 67
三、mRNA的高级结构 68
四、其他RNA的高级结构 69
五、RNA的生物学功能 75
第六节 核酸的变性、复性与分子杂交 77
一、核酸的变性 77
二、核酸的复性 79
三、核酸的分子杂交 80
本章小结 81
复习思考题 83
第三章 DNA的生物合成 84
第一节 DNA复制概况 84
一、DNA复制的半保留性 84
二、DNA的半不连续复制 85
三、复制起点的结构特征 86
四、多种复制方式 86
五、RNA引物和酶体系 90
六、复制的高度忠实性 99
第二节 原核生物DNA的复制 99
一、复制的起始 100
二、复制的延伸 101
三、复制的终止 103
第三节 真核生物DNA的复制 103
一、真核生物DNA复制特点 103
二、真核生物DNA聚合酶 104
三、SV40的DNA复制 105
四、真核生物复制过程中的核小体结构 107
五、真核生物polγ和线粒体DNA复制 108
第四节 端粒及其复制 108
第五节 DNA复制的忠实性及复制调控 110
一、DNA复制的忠实性 110
二、DNA复制的调控 114
第六节 RNA的逆转录 118
一、逆转录酶的发现 118
二、逆转录酶的性质 119
三、逆转录病毒的基因组 119
四、逆转录的过程 120
五、逆转录的生物学意义 122
本章小结 123
复习思考题 124
第四章 DNA损伤、修复及重组 125
第一节 DNA的损伤 125
一、DNA的自发性损伤 125
二、物理因素导致的DNA损伤 127
三、化学因素导致的DNA损伤 128
第二节 DNA损伤的修复 130
一、直接修复 131
二、切除修复 132
三、错配修复 134
四、复制后修复 136
五、SOS修复 136
第三节 基因突变与生物进化 138
一、基因突变的类型 138
二、突变的意义 140
第四节 DNA重组 141
一、同源重组 141
二、位点专一性重组 152
三、转座重组 156
本章小结 172
复习思考题 173
第五章 RNA生物合成及其转录后加工 174
第一节 转录概述 174
第二节 参与RNA转录的模板、酶及其相关因子 175
一、转录反应的模板 175
二、DNA指导的RNA聚合酶 176
三、启动子 181
四、转录因子 185
五、终止子 188
第三节 原核生物RNA的生物合成 189
一、转录的起始阶段 189
二、转录的延伸阶段 190
三、转录的终止阶段 192
第四节 原核生物RNA的转录后加工 194
一、原核生物rRNA前体的加工 194
二、原核生物tRNA前体的加工 195
三、原核生物mRNA前体的加工 196
第五节 真核生物RNA的生物合成 197
一、真核生物RNA转录的特点 197
二、真核生物RNA聚合酶Ⅱ所催化的转录过程 197
三、RNA转录的调节控制 199
四、RNA转录的抑制作用 199
第六节 真核生物RNA的转录后加工 200
一、mRNA的转录后加工 200
二、rRNA转录后的加工 202
三、tRNA的转录后加工 202
第七节 RNA的剪接、编辑和再编码 203
一、RNA的剪接 203
二、RNA的编辑 211
三、RNA的再编码 214
第八节 RNA指导下RNA的生物合成 215
一、噬菌体QβRNA的复制 215
二、病毒RNA复制的主要方式 217
本章小结 217
复习思考题 218
第六章 蛋白质生物合成、转运与降解 219
第一节 遗传密码 219
一、遗传密码的解读 219
二、遗传密码子的特性 222
三、密码子与反密码子的相互识别 223
四、密码子的变异与使用 224
第二节 参与蛋白质合成的RNA、酶和有关装置 225
一、tRNA 225
二、rRNA和核糖体 228
三、mRNA 233
第三节 蛋白质生物合成的机制 233
一、与蛋白质合成相关的重要蛋白质因子 234
二、氨基酸的活化与转运 235
三、原核生物蛋白质生物合成机制 237
四、真核生物蛋白质生物合成机制 240
五、新生多肽链的折叠与加工 240
六、蛋白质合成的忠实性 244
七、蛋白质生物合成的调节 245
八、蛋白质生物合成的抑制物 245
第四节 蛋白质的转运 246
一、蛋白质的信号肽与跨膜运输 247
二、线粒体和叶绿体蛋白质的跨膜转运 249
三、核定位蛋白的跨膜转运 250
四、细菌蛋白质的跨膜转运 252
第五节 蛋白质的降解 253
一、非特异性降解途径 253
二、特异性降解途径 254
三、蛋白质降解的生物学意义 259
本章小结 260
复习思考题 261
第七章 系统分子生物学 262
第一节 基因、基因组与基因组学 262
一、基因 262
二、基因组与基因组学 266
三、原核生物基因组 266
四、真核生物基因组 270
五、基因组计划研究概况 281
第二节 转录组与转录组学 292
一、转录组与转录组学的定义 292
二、转录组学的主要研究内容 292
三、转录组学的研究方法 293
四、转录组学的研究进展 293
第三节 蛋白质组与蛋白质组学 295
一、蛋白质组与蛋白质组学的诞生 295
二、蛋白质组学的主要研究内容及技术路线 296
三、我国蛋白质组学的研究现状 297
四、蛋白质组学发展趋势 300
第四节 代谢组与代谢组学 300
一、代谢组与代谢组学的诞生 300
二、代谢组学的研究方法 301
三、代谢组学的应用及其发展趋势 302
第五节 系统分子生物学 304
一、系统分子生物学的主要技术平台 304
二、系统分子生物学的基本工作流程 305
三、系统分子生物学的应用 305
本章小结 306
复习思考题 307
第八章 原核生物基因表达调控 308
第一节 原核生物基因表达调控概述 308
一、基因表达调控的意义 308
二、原核生物基因表达调控的特点与方式 308
三、原核生物基因表达调控的几个重要概念 309
第二节 乳糖操纵子 314
一、乳糖操纵子的调节机制 314
二、阻遏蛋白作用机制 316
第三节 色氨酸操纵子 319
一、色氨酸操纵子的阻遏系统 320
二、色氨酸操纵子的弱化系统 321
第四节 其他操纵子 324
一、阿拉伯糖操纵子 324
二、组氨酸操纵子 326
三、基因表达的时序控制 327
第五节 转录水平其他调控方式 328
一、σ因子的调节作用 328
二、组蛋白类似蛋白的调节作用 328
三、转录调控因子的调节作用 329
四、抗终止因子的调节作用 329
第六节 转录后水平调控方式 329
一、mRNA自身结构元件对翻译起始的调节 330
二、mRNA稳定性对转录水平的影响 330
三、调节蛋白的调控作用 330
四、反义RNA的调节作用 331
五、稀有密码子对翻译的影响 331
六、重叠基因对翻译的影响 332
七、翻译的阻遏 332
八、魔斑核苷酸水平对翻译的影响 333
本章小结 333
复习思考题 334
第九章 真核生物基因表达调控 335
第一节 真核生物基因表达调控的特点 335
第二节 真核生物DNA水平上的基因表达调控 340
一、基因扩增 340
二、基因重排 341
三、基因丢失 341
第三节 真核生物转录水平上的基因表达调控 341
一、真核生物基因的基础转录调控 342
二、真核生物基因转录水平的顺式调控 343
三、真核生物基因转录水平的反式调控 346
第四节 真核生物转录后水平上的基因表达调控 356
第五节 真核生物翻译水平上的基因表达调控 356
一、翻译调控 356
二、翻译起始调节与5'-UTR结构相关 357
三、蛋白质磷酸化对翻译效率的影响 357
四、3'-UTR结构对mRNA稳定性调控 358
五、mRNA的细胞质定位 360
第六节 真核生物翻译后水平上的基因表达调控 360
本章小结 362
复习思考题 362
第十章 分子生物学技术发展及其在农业科学中的应用 363
第一节 PCR技术发展及其在农业科学中应用 363
一、基本原理 363
二、PCR技术的发展 364
三、PCR技术在农业科学中的应用 365
第二节 分子标记技术发展及其在农业科学中的应用 366
一、分子标记技术的主要特点 367
二、主要分子标记技术的基本原理 368
三、分子标记技术在农业科学中的应用 371
第三节 基因表达谱研究技术发展及其在农业科学中的应用 373
一、mRNA差异显示技术 373
二、抑制消减杂交技术 375
三、cDNA-AFLP技术 377
四、基因表达系列分析技术 379
五、微阵列技术 381
第四节 反义RNA技术发展及其在农业科学中的应用 382
一、反义RNA的概念和调控方式 382
二、反义RNA在农业科学中的应用 383
第五节 基因敲除技术发展及其在农业科学中的应用 384
一、基因敲除的概念和原理 384
二、基因敲除技术在农业科学上的应用 384
第六节v生物芯片技术发展及其在农业科学中的应用 385
一、生物芯片的主要类型 385
二、生物芯片技术的基本要点 387
三、生物芯片技术在农业科学中的应用 388
本章小结 388
复习思考题 389
附录 390
附录1 分子生物学相关诺贝尔奖获奖情况 390
附录2 主要分子生物信息学软件 393
附录3 主要分子生物信息学网站 396
附录4 分子生物学常用词英汉对照 399
主要参考文献 411