卷一 1
日记（光绪十八年正月元日迄四月初二日） 1
光绪十八年四月初二日申 2
日记（光绪十八年四月初三日迄初十日） 12
光绪十八年四月初十日申 14
日记（光绪十八年四月十一日迄二十九日） 16
光绪十八年四月二十九日申 19
日记（光绪十八年五月初一日迄十二日） 22
光绪十八年五月十二日申 24
日记（光绪十八年五月十三日迄十六日） 26
光绪十八年五月十六日申 26
日记（光绪十八年五月十七日迄二十四日） 29
光绪十八年五月二十四日申 32
日记（光绪十八年五月二十五日） 34
光绪十八年五月二十九日申 35
光绪十八年六月初九日申 37
代总理营务处司道拟详覆抚军稿 38
附录光绪十八年七月二十四日奉营务处饬知抚军批 43
光绪十八年六月禀爲条陈补益营务四端稿 43
附录光绪十八年六月二十五日奉到抚军批 46
日记（光绪十八年闰六月初三日迄八月十九日） 47
光绪十八年闰六月初八日申 49
光绪十八年闰六月二十二日申 50
光绪十八年闰六月二十五日上抚军稿 51
同日禀抚军 52
附录光绪十八年闰六月二十九日奉营务札饬抚军批 53
又奉抚军批闰六月二十七日奉到 53
光绪十八年七月初八日申 54
光绪十八年八月初五日申 55
光绪十八年八月二十日申 58
附录光绪十八年八月二十七日奉营务处札饬抚军批 60
光绪十八年八月二十四日陈请销差禀 60
附录八月二十六日奉批 61
上台湾兵备道顾 61
禀台湾臬道宪顾 62
上江苏臬宪陈舫仙廉访 64
致邵班卿 65
卷二 69
日记（光绪十八年九月初一日迄十月初五日） 69
复吴鼎卿 78
复袁行南 79
日记（光绪十八年十月初六日迄初九日） 80
禀湖南巡抚部院吴淸卿师 81
日记（光绪十八年初十日迄十一月初三日） 83
复范荔泉 89
日记（光绪十八年十一月初四至十一日） 93
禀复江苏臬宪陈舫仙廉访 97
日记（光绪十八年十一月十二日迄二十二日） 97
复范荔泉 99
复何芝生（二札） 101
日记（光绪十八年十一月二十三日迄二十七日） 102
致李丽川 103
复翁子文 103
日记（光绪十八年十一月二十八日迄十二月初二日） 104
复胡虎臣 104
日记（光绪十八年十二初三日迄初九日） 106
致范荔泉 107
复邓季垂 109
日记（光绪十八年十二月初十日迄三十日） 110
致吴鼎卿 112
致邓季垂 113
复陈子垣 114
致翁子文 114
复胡次樵 115
致苏冶生 116
复范荔泉 116
日记（光绪十九年正月元日） 118
复邵班卿 118
日记（光绪十九年正月初二日迄二十三日） 120
复吴卓臣 123
日记（光绪十九年正月二十四日迄二月初六日） 124
复童米孙 126
日记（光绪十九年二月初七日迄二十六日） 128
复范荔泉 130
复苏冶生 130
日记（光绪十九年二月二十七日迄三月初十日） 131
致翁子文程玉堂 132
致翁子文程玉堂 133
日记（光绪十九年三月十一日迄十四日） 134
致邵班卿 134
日记（光绪十九年三月十五日迄二十六日） 135
致吴鼎卿 136
复翁子文程玉堂 138
日记（光绪十九年三月二十七日迄二十八日） 140
上皖南道袁爽秋观察 140
日记（光绪十九年三月二十九日迄四月初三日） 142
复张月楼 142
日记（光绪十九年四月初四日迄十九日） 143
卷三 145
日记（光绪十九年五月一日迄六月初一日） 145
致邓季垂 151
日记（光绪十九年六月初二日迄初五日） 153
禀台湾抚藩臬道三大宪 154
致张月楼 156
日记（光绪十九年六月初六日） 156
致张经甫 157
日记（光绪十九年六月初七日迄十六日） 158
上道宪顾 159
日记（光绪十九年六月十七日迄二十日） 160
复张月楼 161
日记（光绪十九年六月二十一日迄二十六日） 163
上臬道宪顾 164
日记（光绪十九年六月二十七日迄三十日） 165
致张月楼 165
禀臬道宪顾 166
日记（光绪十九年七月初一日迄初二日） 167
致张蕊卿 168
致张聘之 168
日记（光绪十九年七月初三日迄初四日） 169
复介如四弟 169
日记（光绪十九年七月初五日） 170
致包哲臣太守 170
日记（光绪十九年七月初六日迄初十日） 171
复张蕊卿 172
日记（光绪十九年七月十一日迄十五日） 173
禀臬道宪顾 174
日记（光绪十九年七月十六日迄十七日） 176
复谢钟英 177
日记（光绪十九年七月十八日迄二十一日） 177
复谢钟英 178
复张经甫 179
日记（光绪十九年七月二十二日） 180
上吴淸卿师 180
日记（光绪十九年七月二十三日迄八月初六日） 181
上臬道宪顾 182
日记（光绪十九年八月初七日迄十二日） 183
禀臬道宪顾 184
日记（光绪十九年八月十三日迄十四日） 186
复张月楼 186
日记（光绪十九年八月十五日迄十六日） 188
禀抚宪邵 188
日记（光绪十九年八月十七日迄九月十七日） 192
禀臬道宪顾 195
日记（光绪十九年九月十八日迄二十二日） 196
禀臬道宪顾 197
日记（光绪十九年九月二十三日迄十月初三日） 199
复范荔泉 200
日记（光绪十九年十月初四日迄十二月初一日） 201
上吴淸卿师 208
日记（光绪二十年十二月初二日迄二十五日） 209
日记（光绪二十年正月元日迄七月初四日） 211
复邓季垂大令 224
日记（光绪二十年七月初五日） 226
上臬道宪顾 227
日记（光绪二十年七月初六日迄八月初二日） 228
上吴淸卿师 230
日记（光绪二十年八月初三日） 232
禀复顾廉访 232
日记（光绪二十年八月初四日迄十二月三十日） 234
日记（光绪二十一年正月元日迄二十一日） 245
禀抚宪邵 247
日记（光绪二十一年正月二十二日迄二十五日） 248
禀臬道宪顾 249
日记（光绪二十一年正月二十六日迄四月二十九日） 250
日记（光绪二十一年五月初一日迄二十八日） 260
附录一：「台湾纪录两种」的「编校后记」 267
附录二：记台湾台东州疆域道里地方情形并书后 271
附方豪先生的后记 279