第一章 真细菌基因组 3
A 人畜病原真细菌基因组 3
中国钩端螺旋体基因组学研究进展&朱泳璋 何平 秦金红 郭晓奎 赵国屏 5
鼠疫耶尔森氏菌基因组学：进化、溯源与致病机制&宋亚军 周冬生 杨瑞馥 15
中国肠道致病菌的基因组学研究&王磊 30
中国肠道元基因组与人体健康研究进展&赵立平 45
结核分枝杆菌的基因调控网络研究进展&李雨庆 王毅 何正国 51
结核分枝杆菌基因组学和后基因组学研究&毕利军 葛峰 58
结核分枝杆菌基因组研究进展&郑华军 王升跃 68
人体呼吸道的菌群研究&周与华 郭晓奎 77
口腔微生物组研究现状&李燕 薛晶 王人可 肖晓蓉 朱硃 肖丽英 周学东 89
猪胸膜肺炎放线杆菌基因组研究进展&徐卓菲 周锐 陈焕春 98
副猪嗜血杆菌基因组研究进展&贝为成 陈焕春 周锐 付书林 乐敏 107
B 农用真细菌基因组 116
联合固氮微生物功能基因组学研究&燕永亮 张云华 林敏 119
根瘤菌的进化：核心基因组与附属基因组&田长富 陈文新 144
铜绿假单胞菌生物防治菌株M18全基因组及温度依赖性转录组分析&许煜泉 151
根瘤菌功能基因组学研究概述&李友国 王善明 彭杰丽 马彬广 166
巴斯德芽菌（Pasteuria spp.）基因组研究进展&朱军 贺乐 黄惠琴 刘敏 鲍时翔 181
苏云金芽胞杆菌基因组&邱宁 彭东海 何进 孙明 喻子牛 187
青枯雷尔氏菌基因组研究&刘波 唐唯其 林营志 车建美 朱育菁 203
C 环境真细菌基因组 219
几株重金属抗性细菌的全基因组序列分析与比较&王革娇 何敏艳 熊金波 刘红亮 黎航 221
海洋石油降解菌食烷菌基因组研究进展&邵宗泽 赖其良 王万鹏 235
海洋多环芳烃降解菌的组学研究&董纯明 邵宗泽 269
D 冶金、食品及其他真细菌基因组 298
生物冶金微生物基因组学&尤晓颜 姜成英 刘双江 301
乳酸菌基因组学研究进展&张文羿 孙志宏 张和平 320
枯草芽胞杆菌功能基因组，从新视角看老问题&邓运 孙明 331
球形芽胞杆菌基因组及进化分析&胡晓敏 袁志明 351
蜡状芽胞杆菌群基因组研究进展&朱镭 孙明 364
第二章 古生菌基因组 383
海洋古菌基因组研究进展&曾湘 姜丽晶 邵宗泽 383
嗜热菌基因组的基本特征&包其郁 周娇鹏 389
原核微生物的温度适应机制：组学视角&马彬广 郝保海 胡晓攀 王双寅 400
第三章 真核微生物基因组 417
真菌基因组学的研究与发展&王成树 417
寡孢节丛孢的基因组和蛋白质组学研究&杨金奎 季星来 张克勤 426
十字花科黑腐病菌基因组分析与病理基因组学&何勇强 唐纪良 446
木质纤维素降解真菌的基因组学研究进展&刘国栋 曲音波 486
食用菌基因组学研究进展和展望&鲍大鹏 谭琦 吴林 494
大型真菌基因组研究现状及前景&尹亚琳 余国军 孙慧 504
东方巴贝斯虫基因组序列测定与分析&贺兰 赵俊龙 526
第四章 病毒基因组 535
猪流感病毒的遗传多样性及分子进化&涂加钢 金梅林 535
我国水生动物病毒基因组的研究进展&吴淑勤 王庆 曾伟伟 刘春 付小哲 任燕 王英英 542
嗜极微生物噬菌体基因组学研究进展&魏云林 季秀玲 551
中国昆虫病毒基因组结构研究进展&胡远扬 张珈敏 周溪 568
芽胞杆菌属细菌噬菌体基因组研究进展&袁益辉 高梅影 577
第五章 微生物基因组其他研究及方法学 589
几个重要微生物基因组及其隐性基因簇的研究&刘钢 牛国清 李磊 刘波 田宇清 谭华荣 589
中国放线菌功能基因组研究&白林泉 601
基因组尺度代谢网络模型&郝彤 马红武 赵学明 609
海洋微生物元基因组研究方法及进展&李志勇 624
基于代谢组学的抗菌药物靶标发现&王忠义 张红雨 638
基于比较基因组学的细菌基因组岛识别与功能分析&欧竑宇 646
植物病原细菌基因组重新注释及重要功能基因识别&高俊祥 高娜 雷阳 徐锡文 陈玲玲 660
原核生物的转录组学研究&王阶平 何进 喻子牛 670