第一部分：线粒体DNA复制、转录、翻译和呼吸链复合物组装 3
1．动物细胞mtDNA核状小体的生化提取&Daniel F.Bogenhagen 3
2．二维琼脂糖凝胶电泳分析线粒体DNA&Aurelio Reyes,Takehiro Yasukawa,Tricia J.Cluett,and Ian J.Holt 15
3．果蝇和人线粒体DNA复制蛋白：DNA聚合酶γ和线粒体单链DNA结合蛋白的比较纯化策略&Marcos T.Oliveira and Laurie S.Kaguni 37
4．参与人类疾病的线粒体DNA聚合酶突变体的功能分析&Sherine S.L.Chan and William C.Copeland 59
5．人类线粒体单链DNA结合蛋白的纯化制备&Matthew J.Longley,Leslie A.Smith,and William C.Copeland 73
6．评估线粒体转录因子A（TFAM）与DNA结合的方法&Atsushi Fukuoh and Dongchon Kang 87
7．线粒体DNA解旋酶在人类细胞中的诱导表达、纯化和体外功能分析&Steffi Goffart and Hans Spelbrink 103
8．人类线粒体DNA解旋酶重组蛋白的纯化策略&Tawn D.Ziebarth and Laurie S.Kaguni 121
9．用提取的蛋白组分研究线粒体转录终止的方法&Paola Loguercio Polosa,Stefania Deceglie,Marina Roberti,Maria Nicola Gadaleta,and Palmiro Cantatore 127
10．氧化磷酸化：线粒体编码蛋白的合成以及将单独的结构亚基组装成具有功能的全酶复合物&Scot C.Leary and Florin Sasarman 143
第二部分：线粒体DNA的损伤和修复 165
11．线粒体活性氧簇的生成&Adrian J.Lambert and Martin D.Brand 165
12．超螺旋敏感的qPCR方法检测mtDNA损伤&Sam W.Chan and Junjian Z.Chen 183
13．免疫荧光法定量分析线粒体DNA中氧化形式的鸟嘌呤（8-羟鸟嘌呤）&Mizuki Ohno,Sugako Oka,and Yusaku Nakabeppu 199
14．在分离的线粒体中体外检测DNA碱基切除修复能力&Melissa M.Page and Jeffrey A.Stuart 213
15．利用稳定转染、瞬时转染、病毒转导及TAT-介导的蛋白转导方法靶向哺乳动物细胞线粒体导入修复蛋白&Christopher A.Koczor,Janet W.Snyder,Inna N.Shokolenko,Allison W.Dobson,Glenn L.Wilson,and Susan P.LeDoux 233
16．一种局限线粒体DNA而非核DNA的氧化损伤修复缺陷的细胞系的构建和功能分析&Sugako Oka,Mizuki Ohno,and Yusaku Nakabeppu 251
第三部分：线粒体DNA突变 267
17．酿酒酵母中线粒体DNA的氧化损伤和突变诱变&Lyra M.Griffiths,Nicole A.Doudican,Gerald S.Shadel,and Paul W.Doetsch 267
18．基于变性高效液相色谱（DHPLC）异源双链分析法测定人类组织中DNA突变异质性&Kok Seong Lim,Robert K.Naviaux,and Richard H.Haas 287
19．利用特异识别异源双链错配位点的Surveyor核酸酶快速检测未知的异质性线粒体DNA突变&Sylvie Bannwarth,Vincent Procaccio,and Véronique Paquis-Flucklinger 301
20．用于单细胞线粒体DNA突变分析的细胞分离和收集方法&Yevgenya Kraytsberg,Natalya Bodyak,Susan Myerow,Alexander Nicholas,Konstantin Ebralidze,and Konstantin Khrapko 315
21．采用单细胞单分子PCR定量分析线粒体DNA体细胞突变&Yevgenya Kraytsberg,Natalya Bodyak,Susan Myerow,Alexander Nicholas,Konstantin Ebralidze,and Konstantin Khrapko 329
22．线粒体中DNA前体库（dNTP库）的测定&Christopher K.Mathews and Linda J.Wheeler 371
23．构建缺乏线粒体DNA的人类细胞系&Kazunari Hashiguchi and Qiu-Mei Zhang-Akiyama 383
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