第一章 绪论：怎样写生物学史 1
1.1 主观性和偏见 6
1.2 为什么要研究生物学史 12
第二章 生物学在科学中的地位及其概念结构 15
2.1 科学的本质 15
2.2 科学的方法 17
2.3 生物学在科学中的地位 22
2.4 生物学怎么不同和为什么不同 25
2.5 生物有机体的特征 35
2.6 还原论与生物学 40
2.7 突现（Emergence） 43
2.8 生物学的概念结构 45
2.9 生物学的新哲学 49
第三章 变化中的生物学理性背景 56
3.1 古代 56
3.2 基督教的世界观 61
3.3 文艺复兴 63
3.4 多样性的发现 66
3.5 启蒙运动与生物学 71
3.6 17世纪到19世纪科学的兴起 72
3.7 19世纪生物学的分裂 74
3.8 20世纪的生物学 79
3.9 生物学史上的主要时代 82
3.10 生物学和哲学 84
3.11 现代生物学 86
第一篇 生命的多样性 100
第四章 宏观分类学，关于分类的科学 100
4.1 亚里士多德 101
4.2 古代人和草药医生的植物分类 104
4.3 逻辑分类的下行分类 107
4.4 林奈以前的动物学家 112
4.5 林奈 115
4.6 布丰 120
4.7 动物分类学的复苏 122
4.8 分类学性状 124
4.9 按经验归类的上行分类（Upward Classification By Empirical Grouping） 127
4.10 过渡时期（1758—1859） 130
4.11 等级结构分类（Hierarchical Classifications） 136
第五章 按照共同祖先分类 139
5.1 宏观分类学的衰微 144
5.2 数值分类（Numerical Phenetics） 147
5.3 支序分类（Cladistics） 150
5.4 传统的或进化的分类方法 154
5.5 新的分类学性状 156
5.6 信息检索的简易化 158
5.7 多样性研究 162
第六章 微观分类学，关于物种的科学 165
6.1 早期的物种概念 167
6.2 本质论者的物种概念 168
6.3 唯名论者的物种概念 173
6.4 达尔文的物种概念 174
6.5 生物学物种概念的萌芽 177
6.6 生物学物种概念在多因次（多维）物种分类单位中的运用 187
6.7 物种在生物学中的重要意义 193
第二篇 进化 198
第七章 非进化的起源观念 198
7.1 进化思想的萌芽 204
7.2 法国启蒙运动 211
第八章 达尔文以前的进化思想 226
8.1 拉马克 226
8.2 居维叶 239
8.3 英国 244
8.4 莱伊尔与均变论（uniformitarianism） 247
8.5 德国 254
第九章 查尔斯·达尔文 259
9.1 达尔文与进化 263
9.2 华莱士 274
9.3 《物种起源》的出版 278
第十章 达尔文关于进化和共同祖先学说的证据 280
10.1 关于生物进化的证据 281
10.2 关于共同祖先学说的证据 286
10.3 形态学作为进化与共同祖先学说的证据 300
10.4 胚胎学作为进化与共同祖先的证据 309
第十一章 进化的原因：自然选择 315
11.1 自然选择学说的主要组成部分 318
11.2 自然选择概念的来源 322
11.3 达尔文革命的影响 330
11.4 对自然选择学说的抵制 337
11.5 其他的进化学说 347
第十二章 进化思想的多样性与综合 354
12.1 进化论者之间日益扩大的分歧 357
12.2 进化遗传学的进展 364
12.3 进化系统学的进展 370
12.4 进化综合 374
第十三章 综合后的发展 378
13.1 分子生物学 380
13.2 自然选择 386
13.3 自然选择还没有解决的问题 390
13.4 物种形成的方式 396
13.5 宏观进化（Macroevolution） 400
13.6 人类的进化 409
13.7 现代思维的进化 412
第三篇 变异及其遗传 419
第十四章 早期的遗传学说和育种实验 419
14.1 古代的遗传学说 420
14.2 孟德尔的先驱 424
第十五章 生殖细胞，遗传载体 431
15.1 施旺—施莱登细胞学说 433
15.2 性别和受精作用的意义 435
15.3 变异和遗传的物质基础 441
15.4 染色体及其功能 445
第十六章 遗传的本质 451
16.1 达尔文与变异 451
16.2 魏斯曼 462
16.3 德弗里 467
16.4 孟德尔 469
第十七章 孟德尔遗传学的成长 481
17.1 重新发现孟德尔的生物学家 481
17.2 孟德尔遗传学的黄金时代 484
17.3 新变异（突变）的起源 488
17.4 现代遗传学的兴起 492
17.5 瑟顿—波弗利（Sutton-Boveri）染色体学说 495
17.6 性别决定 496
17.7 摩根与他的果蝇实验室 498
17.8 减数分裂（成熟分裂，Meiosis） 503
17.9 摩根与染色体学说 509
第十八章 关于基因的各种学说 514
18.1 有关遗传的各种相互竞争的学说 518
18.2 孟德尔主义对连续变异的解释 522
第十九章 遗传的化学基础 534
19.1 种质的实质 537
19.2 遗传现象的核酸学说 539
19.3 双螺旋的发现 543
19.4 现代观念中的遗传学 546
第二十章 结束语：关于科学学 548
20.1 科学家和科学环境 549
20.2 学说和概念的成熟 554
20.3 学说和概念成熟过程中的障碍 557
20.4 科学与外部环境 560
20.5 科学的进步 564
原注 566
索引 596
译后小记 619
编辑后记 621