上册 1
卷一 本草卷 1
卷二 方剂卷 83
卷三 脏腑卷 129
卷四 经络卷 183
卷五 诊法卷（论望、闻、问诊） 209
卷六 诊法卷（脉诊） 259
卷七 运气卷（论运气） 307
卷八 形体官窍卷（论五官四肢） 347
卷九 形体官窍卷（论鼻口齿舌咽喉颈病证） 411
卷十 形体、津液病证卷（论风毒脚气、皮肉病、筋病、骨病、胸腹诸病、腰痛、痰饮病） 473
卷十一 伤寒卷（论伤寒、二阴、皮病） 551
卷十二 六淫病证卷（论风寒暑湿燥火病证） 631
下册 711
卷十三 内科卷（论咳嗽、呕吐、泄泻） 711
卷十四 内科卷（论虚劳、肿胀、噎膈、情志病、多寐、不寐、失音、呃逆、倦怠嗜卧、诸蛊毒、饮食诸毒、飞尸鬼疰、卒中暴厥、诸骨鲠、九虫） 775
卷十五 内科卷（论消渴、哮喘、黄疸、疟、厥逆、痫、瘟疫、痿、瘴气、厉风、诸气） 881
卷十六 内科卷（论霍乱、痢疾、二便闭结、淋证、血证、汗证、积聚、惊悸） 949
卷十七 妇儿科卷（论妇儿病证） 1023
卷十八 儿科卷（论痘疹） 1109
卷十九 外科卷（论疮疡、附骨疽、丹毒、疠风、疥癣、天疱疮、杨梅疮、瘿瘤、痤疿疮、火烫、冻疮、漆疮） 1155
卷二十 外科卷（论跌扑、金刃、虫兽伤病证） 1247
附录一 所引医家及著作考 1337
附录二 医学正旨择要研究 1369