第1章 绪论 1
1.1生物化学的概念 1
1.2生物化学发展与其他相关学科发展的关系 2
1.3生命体的化学组成 3
1.3.1生命体的元素组成 4
1.3.2生物分子 5
1.4生物分子的相互作用 10
1.4.1生物分子之间的作用力 10
1.4.2分子识别和超分子 12
1.5生物体系中的水 13
1.5.1水分子的结构和特性 13
1.5.2水分子对生物大分子结构和性质的影响 16
1.5.3缓冲溶液及生物体的缓冲体系 17
习题 20
第2章 细胞和生物膜 22
2.1细胞是生命体的基本结构单元 22
2.1.1细胞的分类和结构 22
2.1.2细胞—生物分子发生化学变化的场所 24
2.2生物膜 26
2.2.1生物膜的组成和结构 27
2.2.2生物膜的功能 32
2.2.3生物膜的氧化损伤与保护 36
2.2.4生物膜的模拟——人工膜 39
习题 41
第3章 蛋白质 42
3.1氨基酸、多肽和蛋白质 42
3.2氨基酸 43
3.2.1氨基酸的结构和分类 43
3.2.2氨基酸的解离性质 46
3.2.3几种重要的不常见氨基酸 48
3.2.4氨基酸的化学性质 49
3.2.5氨基酸的化学合成 58
3.2.6氨基酸的分离与分析 63
3.3多肽 65
3.3.1肽键 66
3.3.2多肽的性质 67
3.3.3天然存在的重要多肽 69
3.4蛋白质 71
3.4.1蛋白质的分类和性质 71
3.4.2蛋白质的分离和纯化 73
3.5蛋白质的结构 80
3.5.1蛋白质的一级结构 80
3.5.2蛋白质的三维结构 86
3.5.3蛋白质结构与功能的关系 92
3.5.4几种重要的蛋白质类型 93
3.6多肽的化学合成 97
3.6.1氨基的保护方法 98
3.6.2羧基的保护方法 99
3.6.3肽键的形成方法 100
3.7蛋白质组学 105
习题 106
第4章酶 109
4.1酶—生物催化剂 109
4.1.1酶的概念 109
4.1.2酶的命名及分类 109
4.1.3酶催化作用的特性 112
4.1.4酶活力及其测定 114
4.2酶的非蛋白质组分—辅因子 115
4.2.1维生素与辅酶（辅基） 116
4.2.2酶分子中的金属离子 129
4.3酶促反应的速率和影响因素 130
4.3.1底物浓度对酶促反应速率的影响——米氏方程 130
4.3.2影响酶促反应速率的其他因素 132
4.4酶的结构和酶的催化作用机制 133
4.4.1酶分子的结构特点 133
4.4.2酶活性中心的测定方法 133
4.4.3酶与底物分子的相互作用 135
4.4.4酶的催化作用机制 139
4.4.5丝氨酸蛋白酶水解机制 145
4.5酶的抑制作用和抑制剂 149
4.5.1抑制剂的作用方式 149
4.5.2不可逆抑制剂 150
4.5.3可逆抑制剂 154
4.5.4酶抑制剂的应用 162
4.6人工合成酶的新进展 166
4.6.1抗体酶 166
4.6.2杂化酶 169
4.6.3酶模型 171
4.7酶工程 173
4.7.1化学酶工程 174
4.7.2生物酶工程 175
4.8酶在化学研究中的应用 176
4.8.1酶制剂和酶促反应介质 176
4.8.2酶在有机化学中的应用 177
4.8.3酶在高分子合成中的应用 180
4.8.4酶在环境化学中的应用 181
4.8.5酶标法 181
4.9非水介质中的酶促反应 182
4.9.1有机溶剂中的酶学性质 182
4.9.2有机溶剂中的酶促反应及其应用 185
习题 189
第5章 核酸 193
5.1核酸与生命遗传 193
5.2核酸的分类和组成 193
5.2.1核酸的分类 193
5.2.2核酸的组成 194
5.3核酸的结构 202
5.3.1核酸的一级结构——核酸碱基序列及其生物学意义 202
5.3.2 DNA的双螺旋结构及其生物学意义 203
5.3.3 Hoogsteen氢键和DNA的其他二级结构形式 206
5.3.4 RNA的结构特点 211
5.4核酸的性质 211
5.4.1含氮碱基的性质 211
5.4.2核酸的性质 215
5.5核酸的生物功能 218
5.5.1 DNA的复制与生物遗传信息的保持 218
5.5.2 RNA与生物遗传信息的表达 219
5.5.3生物遗传变异的化学本质——DNA结构变化 225
5.5.4核酸的催化性质 226
5.6多聚核苷酸的化学合成 229
5.6.1保护基 229
5.6.2磷酸二酯键的形成和多聚核苷酸的合成 232
5.6.3多聚核苷酸链的连接 235
5.7核酸化学中的几种重要技术 235
5.7.1核酸碱基序列测定法 235
5.7.2核酸的体外生物合成与PCR技术 242
5.7.3 DNA重组技术和基因工程 245
5.7.4基因敲除与定点突变技术 247
5.7.5核酸的化学标记技术 249
5.7.6定向分子进化 253
5.8化学基因组学 253
习题 255
第6章 生物氧化和生物能 258
6.1生物氧化的方式和特点 258
6.1.1生物氧化的方式 258
6.1.2生物氧化的特点 259
6.2生物能及其存在形式 260
6.2.1生物能和ATP 260
6.2.2生物体系中的高能化合物 262
6.3线粒体呼吸链和ATP合成 264
6.3.1线粒体膜的结构特点 265
6.3.2线粒体呼吸链的组成 266
6.3.3线粒体呼吸链的电子传递 267
6.3.4 ATP合成 273
6.3.5 NADH的转运 276
6.4线粒体呼吸链的电子传递与自由基的产生 277
6.5利用氧解毒的酶——细胞色素P450 278
习题 280
第7章 生物代谢 281
7.1生物代谢的特点及规律 281
7.1.1生物体内代谢反应的共同特点 281
7.1.2代谢途径的调控 283
7.1.3代谢中常见的有机化学反应 284
7.1.4研究代谢途径的方法 286
7.2糖代谢 287
7.2.1糖的酶水解 287
7.2.2葡萄糖的分解代谢 290
7.2.3其他单糖的分解代谢 309
7.2.4糖原的合成代谢 310
7.2.5糖代谢的紊乱 312
7.3光合作用 312
7.3.1叶绿体及光合色素 313
7.3.2光合作用机制 315
7.4脂类代谢 324
7.4.1脂类的消化和吸收 324
7.4.2脂肪的分解代谢 327
7.4.3脂肪的合成代谢 332
7.4.4磷脂代谢 335
7.4.5胆固醇的代谢 337
7.5蛋白质降解和氨基酸代谢 338
7.5.1蛋白质的消化和吸收 338
7.5.2氨基酸的分解代谢 340
7.5.3氨基酸的合成代谢 351
7.5.4氮循环和生物固氮作用 354
7.6核酸的降解和核苷酸的代谢 355
7.6.1核酸的降解 355
7.6.2核苷酸的分解代谢 356
7.6.3核苷酸的合成代谢 358
习题 364
第8章 生物化学过程的调控 366
8.1生物调控的概念 366
8.2信号分子的生物调控 368
8.2.1细胞间化学信号 368
8.2.2受体分子 387
8.2.3细胞信号转导途径 391
8.3基因水平的调控 397
8.3.1原核生物的基因表达调控 398
8.3.2真核生物的基因表达调控 400
8.4蛋白质水平的调控 402
8.4.1蛋白质的糖基化 403
8.4.2蛋白质的磷酸化 404
8.4.3蛋白质的乙酰化 406
8.5酶水平的调控 406
8.5.1变构调节作用 407
8.5.2共价修饰调控作用 409
8.5.3酶原的激活 410
8.6化学调控与生物活性分子的设计 411
8.6.1酶的化学激活和抑制 412
8.6.2酶活性的化学调控与生物活性分子的设计 414
习题 420