第1章 绪论 1
1.1 安装ChemDraw 1
1.1.1 安装ChemDraw对操作系统的要求 1
1.1.2 安装ChemDraw 1
1.1.3 启动程序 1
1.2 ChemDraw界面结构 1
1.2.1 文件窗口 2
1.2.2 图形工具图标板 2
1.3 菜单和操作命令 5
1.3.1 菜单中命令的选择 5
1.3.2 命令不同显示的意义 5
1.3.3 Undo和Redo命令 5
1.4 对话框 7
1.4.1 对话框中命令的操作 7
1.4.2 对话框的组成 7
1.5 默认设置的变化 8
1.5.1 Preferences命令 8
1.5.2 Document settings命令 9
1.5.3 存储定型设置 11
1.5.4 其他文件的应用设置 11
1.6 ChemDraw文件操作 11
1.6.1 ChemDraw文件的建立 11
1.6.2 打开ChemDraw文件 11
1.6.3 存储ChemDraw文件 13
1.6.4 关闭文件 14
1.6.5 快速访问文件 14
1.6.6 打印文件 15
1.6.7 退出文件 15
第2章 实例指导 16
2.1 实例指导l 反应方程式 16
2.1.1 绘制前的操作准备 16
2.1.2 绘制实例 17
2.2 实例指导2 绘制中间体结构 22
2.3 实例指导3 复杂环结构 25
2.4 实例指导4 Fischer葡萄糖结构图 27
2.5 实例指导5 绘制透视图形 30
2.6 实例指导6 Newman结构 32
第3章 化学结构的绘制 36
3.1 单键工具 36
3.1.1 实键工具 36
3.1.2 楔键和配键工具 38
3.1.3 信息区域 39
3.1.4 单击加键和拖曳加键 39
3.2 多重键的绘制 40
3.2.1 绘制双键 40
3.2.2 绘制双抉择键 40
3.2.3 绘制叁键 40
3.2.4 单键和双键实例 41
3.3 环工具 42
3.3.1 环己烷环工具的选择 42
3.3.2 绘制环己烷 42
3.3.3 环己烷凳环工具 43
3.3.4 绘制不定域共扼环 43
3.3.5 环戊二烯环和苯环工具 44
3.4 无环链 44
3.4.1 无环链工具 44
3.4.2 加链 44
3.5 绘制设置 46
3.5.1 线的宽度 46
3.5.2 黑体的宽度 46
3.5. 3 切割线间的距离 46
3.5.4 多重键的键间距离 46
3.6 编辑键 47
3.6.1 变化键的类型 47
3.6.2 楔键和配键的定位 48
3.6.3 双键线的定位 48
3.6.4 移动原子 48
3.6.5 键的前后交叉 49
第4章 文本说明和原子标记 50
4.1 文本 50
4.1.1 说明文本 50
4.1.2 说明文本的宽度 51
4.1.3 编辑说明的内容 51
4.1.4 说明文本的字体、字号和字形 52
4.1.5 格式对话框 54
4.1.6 变化默认设置 54
4.1.7 说明文本的调整和行间距 55
4.1.8 输入非罗马字体 55
4.2 原子符号的标记 56
4.2.1 原子符号的标记 56
4.2.2 原子标记的调整 59
4.2.3 原子标记行间距 62
第5章 绘制轨道和化学符号 63
5.1 轨道 63
5.1.1 轨道工具 63
5.1.2 s-轨道 63
5.1.3 o-轨道 64
5.1.4 单瓣型轨道 64
5.1.5 P-轨道 64
5.1.6 杂化轨道 65
5.1.7 d-轨道 65
5.1.8 dz-轨道 65
5.2 化学符号 65
5.2.1 化学符号工具 65
5.2.2 H-点和H-划 66
5.2.3 孤对电子 66
5.2.4 自由基 66
5.2.5 阳离子和阴离子 67
5.2.6 电荷 67
5.2.7 立体化学标旗 67
5.2.8 旋转化学符号 68
第6章 绘制箭头、弧及其他图形 69
6.1 箭头 69
6.1.1 箭头工具 69
6.1.2 绘制箭头 70
6.1.3 编辑箭头 70
6.2 基元 71
6.2.1 基元工具 71
6.2.2 方框 72
6.2.3 圆和椭圆 72
6.2.4 单括弧 73
6.2.5 对括号 73
6.2.6 线 73
6.2.7 短键 74
6.2.8 编辑结构基元 74
6.3 弧形工具 76
6.3.1 绘制弧 76
6.3.2 编辑弧 76
6.4 笔 77
6.4. 1 笔工具 77
6.4.2 单击绘制 77
6.4.3 按动绘制曲线 78
6.4.4 编辑曲线 78
6.4.5 改变图形 79
6.4.6 添加一条线段 79
6.4.7 删除一条线段 80
6.4.8 曲线不同的应用类型 80
第7章 选择应用 82
7.1 使用选择工具 82
7.1.1 选择工具 82
7.1.2 选择局部结构 83
7.1.3 选择整体结构 84
7.1.4 选择所有的结构 84
7.1.5 添加选择 84
7.1.6 取消选择 85
7.1.7 删除被选择的结构 86
7.2 移动结构 87
7.2.1 一般移动操作 87
7.2.2 利用剪贴板移动 88
7.2.3 移动原子 89
7.3 复制结构 89
7.3.1 用选择工具复制结构 89
7.3.2 复制限制在水平或竖直方向 89
7.3.3 利用剪贴板进行复制 90
7.4 旋转结构 90
7.5 调整结构尺寸 91
7.5.1 调整结构尺寸 91
7.5.2 度量对话框 92
7.5.3 拉曲被选结构 93
7.6 连接结构 93
7.6.1 化学结构以键连接 93
7.6.2 化学结构以原子连接 93
第8章 高级绘制技巧 95
8.1 用快捷键标记原子 95
8.1.1 标记最后被绘制的原子(方法1) 95
8.1.2 定位快捷标记原子(方法2) 95
8.1.3 选择工具快捷变换原子(方法3) 96
8.1.4 标记被选结构中的原子(方法4) 96
8.1.5 运用默认的快捷键(方法5) 97
8.1.6 快捷键效果(方法6) 97
8.1.7 建立快捷键 97
8.2 俗名的使用 98
8.2.1 俗名 98
8.2.2 使用俗名 98
8.2.3 定义俗名 99
8.2.4 查看俗名 100
8.2.5 删除俗名 101
8.3 多中心结构与多连接标记 101
8.3.1 多中心结构 101
8.3.2 多连接标记 102
8.3.3 给原子符号加键 103
8.3.4 展开标记 103
8.3.5 结构整理 104
8.4 检查化学结构信息 104
8.4.1 检查结构 105
8.4.2 分析信息 105
8.5 不定连接结构 107
8.6 颜色 108
8.6.1 Color菜单 108
8.6.2 给图形结构着色 108
8.6.3 给文本着色 109
8.6.4 改变调色板 109
8.6.5 给Color菜单增加颜色 111
8.6.6 删除颜色 111
第9章 绘制查询结构 113
9.1 查询结构 113
9.2 原子属性的操作 113
9.2.1 原子属性 113
9.2.2 取代基 115
9.2.3 隐含氢 116
9.2.4 环键数 116
9.2.5 不饱和度 117
9.2.6 反应变化 117
9.2.7 立体反应 118
9.2.8 特殊价态 118
9.3 键 119
9.3.1 键属性 119
9.3.2 键类型 120
9.3.3 拓扑 121
9.3.4 反应中心 121
9.4 通用俗名 122
9.5 元素列标记 123
9.6 元素非列标记 123
9.7 取代基和连接点 124
9.7.1 取代基 124
9.7.2 连接点工具 125
9.8 多连接点 126
9.9 匿名取代基 127
9.10 导出兼容性 127
第10章 模板图形 128
10.1 模板工具 128
10.2 用模板作图 130
10.3 建立模板和模板文档 131
10.3.1 建立模板窗口 131
10.3.2 建立模板图形 132
10.3.3 模板的方向 132
10.3.4 调整模板格的大小 132
10.3.5 模板面板 133
10.3.6 保存模板文档 133
第11章 反应标记 134
11.1 反应标记图 134
11.2 自动标记反应 134
11.3 手动标记 135
11.4 反应标记图的输出 136
11.5 反应标记图的清除 136
第12章 页面布局的处理 137
12.1 控制绘制区域 137
12.1.1 控制绘制区 137
12.1.2 在文档窗口内滚动 137
12.1.3 页面设置 138
12.1.4 变化透视效果 140
12.2 安排结构 141
12.2.1 使用标尺 141
12.2.2 使用交叉准线 142
12.2.3 结构图形居中页面 144
12.2.4 对齐物体 144
12.2.5 分布物体 145
12.2.6 层次排序 145
第13章 信息共享 148
13.1 ChemDraw文档之间的信息传输 148
13.1.1 拷贝传输 148
13.1.2 剪切传输 148
13.1.3 粘贴传输 148
13.1.4 按动传输 149
13.1.5 自动调节设置 150
13.2 嵌入结构图形 151
13.3 导人和导出 152
13.3.1 用剪贴板导入和导出 152
13.3.2 建立SMILES字符串 153
13.3.3 剪贴板粘贴SMILES 154
13.3.4 建立SLN字符串 154
13.4 用文件格式导入和导出 155
附录A ChemDraw的化学意义 159
A.1 必备工具概述 159
A.1.1 必备工具 159
A.1.2 惯例限制 159
A.1.3 灵活利用工具 160
A，2 ChemDraw中的化学分类 161
A.2.1 键 161
A.2.2 原子符号 161
A.2.3 化学-意义文本 162
A.2.4 电荷 163
A.2.5 同位素和元素 163
A.2.6 自由基 164
A.2.7 H-点／H-划 164
A.2.8 配合物 164
A.2.9 多中心连接 165
A.2.10 立体化学的标志 165
A.2.11 查询属性 166
A.2.12 分析信息 166
附录B 指定路径 168
B.1 Windows系统 168
B.2 Macintosh系统 169
附录C 技术支持 170
C.1 序列号 170
C.2 故障检查 171
C.2.1 启动 171
C.2.2 执行 171
C.2，3 系统崩溃 172
附录D 文件设置 173
D.1 ACS-1996 173
D.2 Can.J.Chem 173
D.3 J.Mol.Mod 174
D.4 RSC-1995 174
D.5 Svnthesis／SYNLETT 175
D.6 New Document 176
D.7 New Slide 176
附录E Apple Events(Macintosh) 177
附录F 化学文件格式 178
F.1 Connection Table格式文件 178
F.1.1 对Cyclohexanol结构文件的解释 178
F.1.2 Connection Table格式的键类型 179
F.2 Standard Molecular Data File格式文件 180
附录G Chem3D实例指导 183
G.1 利用键工具建立模型 183
G.1.1 乙烷模型 184
G.1.1.1 建立模型 184
G.1.1.2 旋转模型 184
G.1.1.3 模型结构信息 185
G.1.2 乙烯模型 186
G，1.3 环已烷模型 186
G.1.3.1 氢原子的隐含 186
G.1.3.2 添加原子 186
G.1.3.3 添加序列编号和原子符号 187
G.2 利用ReplacementText建立模型 188
G.2.1 替换元素 188
G.2.1.1 单元素变换 188
G.2.1.2 多元素变换 189
G.2.1.3 利用不同的名存储模型拷贝 190
G.2.2 利用符号建立模型 190
G.2.2.1 4-甲基-2-戊醇模型 190
G.2.2.2 1，2-双甲基环戊烷模型 191
G.2.3 利用子结构建立模型 191
G.2.3.1 硝基苯分子模型 191
G.2.3.2 Ibuprofen分子模型 192
G.2.3.3 十肽菌素分子模型 192
G.2.3，4 十二丙氨酸醇分子模型 193
G.3 检查结构能量 194
G.4 检索结构信息 198
G.5 ChemDraw与Chem3D信息转换 200
G.6 分子轨道 201
G.7 绘制表面特性 202
附录H ChemFinder实例指导 204
H.1 数据库检索 204
H.1.1 子结构检索 204
H.1.1.1 子结构检索 204
H.1.1.2 检索结果验证 206
H.1.2 文本检索 207
H.1.3 数字检索 207
H.1.4 混合检索 208
H.2 反应查询 208
H.2.1 反应物查询 209
H.2.2 产物查询 210
H.2.3 产物转变查询 210
H.3 表单的制作 211
H.3.1 绘制空白表框 212
H.3.2 建立表框标签 213
H.3.3 制作图片 214
H.3.4 用选择工具编辑数据框 214
H.3.5 删除框 215
H.3.6 储存和关闭 215
H.4 打开数据库 215
H.4.1 打开BoxProperties对话框 215
H.4.2 打开BoxProperties：Database对话框 216
H.4. 3 添加内容 217
H.5 建立自己的数据库 219
H.5.1 建立数据库表单 219
H.5.2 字段的建立 220
H.5.3 字段的分配 222
H.5. 4 数据记录 223
H.6 制作子表单 224
H.6.1 子表单数据框 224
H.6.2 分别打开主表单和子表单数据 224
H.6.3 建立主表单和子表单的数据联系 225
H.6.4 数据浏览 227