导言 1
细菌在生物世界中的位置 1
鉴定机制 4
十九部分检索表 7
原核生物界 8
门Ⅰ 蓝细菌 8
门Ⅱ 细菌 9
第一部分 光能自养菌 10
目Ⅰ 红螺菌目 10
科Ⅰ 红螺菌科 12
属Ⅰ 红螺菌属 12
属Ⅱ 红假单胞菌属 13
属Ⅲ 红微菌属 14
科Ⅱ 着色菌科 14
属Ⅰ 着色菌属 16
属Ⅱ 囊硫菌属 17
属Ⅲ 八叠硫菌属 18
属Ⅳ 硫螺旋菌属 18
属Ⅴ 荚硫菌属 18
属Ⅵ 闪囊菌属 19
属Ⅶ 网硫菌属 19
属Ⅷ 板硫菌属 20
属Ⅸ 可变杆菌属 20
属Ⅹ 外硫红螺菌属 21
科Ⅲ 绿菌科 21
属Ⅰ 绿菌属 22
属Ⅱ 突柄绿菌属 23
属Ⅲ 绿假单胞菌属 23
属Ⅳ 暗网菌属 24
属Ⅴ 格状绿菌属 24
第二部分 滑动细菌 25
目Ⅰ 粘细菌目 25
科Ⅰ 粘球菌科 27
属Ⅰ 粘球菌属 27
科Ⅱ 原囊菌科 28
属Ⅰ 原囊菌属 28
科Ⅲ 孢囊杆菌科 29
属Ⅰ 孢囊杆菌属 29
属Ⅱ 蜂窝囊菌属 30
属Ⅲ 标桩菌属 30
科Ⅳ 多囊菌科 30
属Ⅰ 多囊菌属 31
属Ⅱ 小（侏）囊菌属 32
属Ⅲ 软骨霉状菌属 32
目Ⅱ 噬纤维菌目 33
科Ⅰ 噬纤维菌科 33
属Ⅰ 噬纤维菌属 34
属Ⅱ 屈挠杆菌属 35
属Ⅲ 滑柱菌属 36
属Ⅳ 柔发菌属 36
属Ⅴ 腐败菌属 37
属Ⅵ 生孢噬纤维菌属 37
科Ⅱ 贝日阿托氏菌科 38
属Ⅰ 贝日阿托氏菌属 38
属Ⅱ 透明颤菌属 38
属Ⅲ 辫硫菌属 39
科Ⅲ 西蒙斯氏菌科 39
属Ⅰ 西蒙斯氏菌属 40
属Ⅱ 小链菌属 40
科Ⅳ 亮发菌科 40
属Ⅰ 亮发菌属 41
属Ⅱ 发硫菌属 41
亲缘关系未定科和属 41
曲发菌属 41
无色菌科 42
无色菌属 42
泥线菌科 42
泥线菌属 43
无色线菌属 43
泥辫菌属 44
花丛菌属 45
第三部分 鞘细菌 46
球衣菌属 46
纤发菌属 47
软发菌属 48
利斯克氏菌属 49
栅状发菌属 49
泉发菌属 49
细枝发菌属 50
第四部分 生芽的和（或）有附属物的细菌 51
生丝微菌属 52
生丝单孢菌属 52
土微菌属 54
柄杆菌属 54
不粘柄菌属 56
臂微菌属 57
突柄微菌属 57
枝硫菌属 58
巴斯德氏柄菌属 58
芽生杆菌属 59
塞里伯氏菌属 59
嘉利翁氏菌属 59
涅瓦河菌属 60
浮霉状菌属 60
生金菌属 61
柄球菌属 62
库兹涅佐夫氏菌属 62
第五部分 螺旋体菌 63
目Ⅰ 螺旋体目 63
科Ⅰ 螺旋体科 63
属Ⅰ 螺旋体属 64
属Ⅱ 脊螺旋体属 65
属Ⅲ 密螺旋体属 65
属Ⅳ 疏螺旋体属 67
属Ⅴ 钓端螺旋体属 68
第六部分 螺旋状和弯曲的杆菌 70
科Ⅰ 螺菌科 70
属Ⅰ 螺菌属 70
属Ⅱ 弯曲杆菌属 75
亲缘关系未定属 76
蛭弧菌属 76
微环菌属 76
暗屈曲菌属 77
短弓菌属 77
第七部分 革兰氏阴性好氧杆菌和球菌 78
科Ⅰ 假单孢菌科 78
属Ⅰ 假单胞菌属 79
属Ⅱ 黄单胞菌属 84
属Ⅲ 动胶菌属 85
属Ⅳ 葡萄杆菌属 86
科Ⅱ 固氮菌科 87
属Ⅰ 固氮菌属 88
属Ⅱ 氮单孢菌属 89
属Ⅲ 拜叶林克氏菌属 90
属Ⅳ 德克斯氏菌属 92
科Ⅲ 根瘤菌科 92
属Ⅰ 根瘤菌属 93
属Ⅱ 土壤杆菌属 94
科Ⅳ 甲基单孢菌科 96
属Ⅰ 甲基单孢菌属 96
属Ⅱ 甲基球菌属 96
科Ⅴ 盐杆菌科 97
属Ⅰ 盐杆菌属 97
属Ⅱ 盐球菌属 99
亲缘关系未定属 99
产碱菌属 99
醋杆菌属 100
布鲁氏菌属 101
博德特氏菌属 102
弗朗西斯氏菌属 104
栖热菌属 104
第八部分 革兰氏阴性兼性厌氧杆菌 105
科Ⅰ 肠杆菌科 105
族Ⅰ 埃希氏菌族 106
属Ⅰ 埃希氏菌属 106
属Ⅱ 爱德华氏菌属 106
属Ⅲ 柠檬酸细菌属 107
属Ⅳ 沙门氏菌属 109
属Ⅴ 志贺氏菌属 110
族Ⅱ 克雷伯氏菌族 110
属Ⅵ 克雷伯氏菌属 111
属Ⅶ 肠杆菌属 111
属Ⅷ 哈夫尼菌属 112
属Ⅸ 沙雷氏菌属 112
族Ⅲ 变形菌族 113
属Ⅹ 变形菌属 113
族Ⅳ 耶尔森氏菌族 115
属Ⅺ 耶尔森氏菌属 115
族Ⅴ 欧文氏菌族 116
属Ⅻ 欧文氏菌属 116
科Ⅱ 弧菌科 121
属Ⅰ 弧菌属 122
属Ⅱ 气单胞菌属 124
属Ⅲ 邻单胞菌属 126
属Ⅳ 发光杆菌属 126
属Ⅴ 射光杆菌属 128
亲缘关系未定属 128
发酵单胞菌属 128
色杆菌属 129
黄杆菌属 130
嗜血菌属 132
阴道嗜血菌 133
巴斯德氏菌属 134
放线杆菌属 135
心杆菌属 136
链杆菌属 137
鞘杆菌属 138
野口氏菌属 138
第九部分 革兰氏阴性厌氧细菌 142
科Ⅰ 拟杆菌科 142
属Ⅰ 拟杆菌属 150
属Ⅱ 梭杆菌属 155
属Ⅲ 纤毛菌属 155
亲缘关系未定属 156
脱硫弧菌属 156
丁酸弧菌属 157
琥珀酸弧菌属 157
琥珀酸单孢菌属 157
毛螺菌属 157
月形单胞菌属 158
第十部分 革兰氏阴性球菌和球杆菌 159
科Ⅰ 奈瑟氏球菌科 159
属Ⅰ 奈瑟氏球菌属 160
属Ⅱ 布兰汉氏球菌属 161
属Ⅲ 莫拉氏菌属 162
属Ⅳ 不动杆菌属 162
亲缘关系未定属 163
副球菌属 163
俊片菌属 163
第十一部分 革兰氏阴性厌氧球菌 165
科Ⅰ 韦荣氏球菌科 165
属Ⅰ 韦荣氏球菌属 165
属Ⅱ 氨基酸球菌属 166
属Ⅲ 巨型球菌属 167
第十二部分 革兰氏阴性化能无机营养细菌 168
a．氧化氨或硝酸盐的细菌 168
科Ⅰ 硝化杆菌科 168
属Ⅰ 硝化杆菌属 169
属Ⅱ 硝化刺菌属 169
属Ⅲ 硝化球菌属 169
属Ⅳ 亚硝化单胞菌属 170
属Ⅴ 亚硝化螺菌属 170
属Ⅵ 亚硝化球菌属 170
属Ⅶ 亚硝化叶菌属 171
b．代谢硫的细菌 171
属Ⅰ 硫杆菌属 172
属Ⅱ 硫化叶菌属 174
属Ⅲ 硫小杆菌属 174
属Ⅳ 大单胞菌属 174
属Ⅴ 卵硫菌属 174
属Ⅵ 硫螺菌属 175
c．沉淀铁或镁氧化物的细菌科Ⅰ 鞘铁菌科 175
属Ⅰ 鞘铁菌属 176
属Ⅱ 淄曼氏菌属 176
属Ⅲ 赭菌属 177
属Ⅳ 铁球菌属 177
第十三部分 产甲烷细菌 178
科Ⅰ 甲烷杆菌科 178
属Ⅰ 甲烷杆菌属 178
属Ⅱ 甲烷八叠球菌属 179
属Ⅲ 甲烷球菌属 179
第十四部分 革兰氏阳性球菌 180
a．好氧和（或）兼性厌氧菌 180
科Ⅰ 微球菌科 180
属Ⅰ 微球菌属 181
属Ⅱ 葡萄球菌属 182
属Ⅲ 动性球菌属 184
科Ⅱ 链球菌科 184
属Ⅰ 链球菌属 185
属Ⅱ 明串珠菌属 190
属Ⅲ 片球菌属 192
属Ⅳ 气球菌属 193
属Ⅴ 孪生球菌属 193
b．厌氧球菌 194
科皿 消化球菌科 194
属Ⅰ 消化球菌属 194
属Ⅱ 消化链球菌属 196
属Ⅲ 瘤胃球菌属 197
属Ⅳ 八叠球菌属 198
第十五部分 芽孢杆菌和球菌 199
科Ⅰ 芽孢杆菌科 199
属Ⅰ 芽孢杆菌属 199
属Ⅱ 芽孢乳杆菌属 206
属Ⅲ 梭菌属 206
属Ⅳ 脱硫肠状菌属 215
属Ⅴ 芽孢八叠球菌属 215
亲缘关系未定属颤螺菌属 217
第十六部分 革兰氏阳性无芽孢杆状细菌 217
科Ⅰ 乳杆菌科 217
属Ⅰ 乳杆菌属 217
亲缘关系未定属 222
利斯特氏菌属 222
丹毒丝菌属 223
显核菌属 224
第十七部分 放线菌及其相关的细菌类群 225
杆状菌群 225
属Ⅰ 杆状菌属 229
a．人和动物的寄生菌和病原菌 229
b．植物致病性棒杆菌 230
c．非致病性棒杆菌 231
属Ⅱ 节杆菌属 231
亲缘关系未定属 234
短杆菌属 234
微杆菌属 234
属Ⅲ 纤维单孢菌属 235
属Ⅳ 库特氏菌属 236
科Ⅰ 丙酸杆菌科 236
属Ⅰ 丙酸杆菌属 237
属Ⅱ 真杆菌属 237
目Ⅰ 放线菌目 248
科Ⅰ 放线菌科 251
属Ⅰ 放线菌属 251
属Ⅱ 蛛网菌属 255
属Ⅲ 双歧杆菌属 256
属Ⅳ 丝杆菌属 257
属Ⅴ 罗氏菌属 257
科Ⅱ 分枝杆菌科 258
属Ⅰ 分枝杆菌属 258
科Ⅲ 弗兰克氏菌科 266
属Ⅰ 弗兰克氏菌属 266
科Ⅳ 游动放线菌科 269
属Ⅰ 游动放线菌属 271
属Ⅱ 螺孢菌属 272
属Ⅲ 链孢囊菌属 272
属Ⅳ 无定形孢囊菌属 273
属Ⅴ 小瓶菌属 274
属Ⅵ 水生角质菌属 274
属Ⅶ 游动单孢菌属 275
属Ⅷ 游动双孢菌属 275
属Ⅸ 指孢囊菌属 275
属Ⅹ 北里菌属 276
科Ⅴ 嗜皮菌科 277
属Ⅰ 嗜皮菌属 278
属Ⅱ 地嗜皮菌属 278
科Ⅵ 诺卡氏菌科 279
属Ⅰ 诺卡氏菌属 279
属Ⅱ 假诺卡氏菌属 282
科Ⅶ 链霉菌科 283
属Ⅰ 链霉菌属 283
属Ⅱ 链轮丝菌属 308
属Ⅲ 鱼孢菌属 314
属Ⅳ 小荚孢囊菌属 314
科Ⅷ 小单孢菌科 315
属Ⅰ 小单孢菌属 316
属Ⅱ 高温放线菌属 318
属Ⅲ 两歧放线菌属 318
属Ⅳ 高温单孢菌属 319
属Ⅴ 小双孢菌属 319
属Ⅵ 小多孢菌属 320
第十八部分 立克次氏体 322
目Ⅰ 立克次氏体目 322
科Ⅰ 立克次氏体科 323
族Ⅰ 立克次氏体族 323
属Ⅰ 立克次氏体属 323
属Ⅱ 罗卡利马氏体菌属 325
属Ⅲ 考克斯氏体属 325
族Ⅱ 埃里希氏体族 325
属Ⅳ 埃里希体属 326
属Ⅴ 考德里氏体属 326
属Ⅵ 新立克次氏体属 327
族Ⅲ 沃尔巴克氏体族 327
属Ⅶ 沃尔巴克氏体属 327
属Ⅷ 共生小体属 328
属Ⅸ 蟑螂杆状体属 328
属Ⅹ 立克次氏小体属 329
科Ⅱ 巴尔通氏体科 329
属Ⅰ 巴尔通氏体属 329
属Ⅱ 格拉汉氏体属 330
科Ⅲ 无形体科 330
属Ⅰ 无形体属 331
属Ⅱ 类无形体属 332
属Ⅲ 埃及小体属 332
属Ⅳ 血巴尔通氏体属 333
属Ⅴ 血虫体属 333
目Ⅱ 衣原体目 334
科Ⅰ 衣原体科 334
属Ⅰ 衣原体属 334
第十九部分 枝原体 337
纲Ⅰ 柔膜体纲 337
目Ⅰ 枝原体目 337
科Ⅰ 枝原体科 338
属Ⅰ 枝原体属 338
科Ⅱ 无胆甾原体科 341
属Ⅰ 无胆甾原体属 341
亲缘关系未定属 341
热原体属 341
螺原体属 342
附录 344
术语汇编 344