《现代遗传学丛书》序 1
序 1
前言 1
第一章引言 1
第一节植物遗传改良与数量性状 1
目 录 1
第二节 植物育种性状的遗传体系与育种方法 2
第三节数量性状遗传体系的检测方法和本书的目的与内容 4
第一节数量遗传学的形成与发展 8
第二章植物数量性状遗传研究的发展 8
第二节植物数量遗传研究的主要内容及其在植物育种中的应用 10
一、植物数量遗传研究的主要内容 10
二、植物数量遗传理论在育种中的应用 14
第三节植物数量性状遗传体系及其检测 17
一、关于植物数量性状遗传体系的认识 17
二、检测数量性状主基因＋多基因混合遗传模型的研究 19
三、植物数量性状遗传体系主基因＋多基因混合遗传模型分离分析方法 22
第一节遗传模型及世代平均数的遗传组成 26
一、一对等位基因的加性显性遗传模型 26
第三章数量性状主基因－多基因遗传体系分离分析的遗传学基础 26
二、两对或多对基因的加性－显性遗传模型 27
三、势能比值 27
四、杂种自交世代及回交世代平均数的遗传组成 28
五、加性显性遗传模型的适合性测验 31
第二节加性显性遗传模型下各世代的遗传方差组成 34
一、遗传方差组成的期望值 34
二、遗传方差组成的实验估计 39
三、狭义遗传率与显性程度 42
一、F2:3家系对F2单株的协方差及回归 44
第三节亲属间的协方差 44
二、F4与F3世代间的协方差 46
第四节有效因子数的估计 46
一、利用双亲差数的Castle-Wright公式及Mather公式 46
二、利用遗传方差的Panse公式 47
第五节具有基因互作（上位性）效应的遗传模型 48
一、加性显性－上位性遗传模型下世代平均数的组成 48
二、加性显性－上位性遗传模型下世代方差和协方差的组成 55
三、连锁条件下的世代平均数与方差 56
第六节分子标记与分离分析 61
一、经典数量遗传分析中的一些假定 63
第四章数量性状分离分析法的混合分布理论 63
第一节数量性状遗传体系的基本假定 63
二、数量性状遗传体系分离分析的主要遗传假定及其真实性分析 64
第二节分离分析的混合分布理论 64
一、混合模型的研究历史 65
二、混合模型的应用 65
三、分离分析法中混合分布的一般理论 66
第三节分离世代各种遗传体系的理论图形分析 71
一、主基因－多基因性状在F2世代的表型分布特征 71
二、主基因＋多基因性状在回交世代和F2:3家系世代的表型分布特征 82
三、利用分离世代的图形分析初步鉴定数量性状的遗传体系 85
第四节遗传数据与混合分布的相符性及数据变换 88
第五节 由实验数据估计分布参数——极大似然估计 89
一、极大似然估计的定义 90
二、极大似然估计的统计性质 91
第六节混合模型中参数极大似然估计的算法 91
一、EM算法 91
二、ECM算法 93
三、IECM算法 93
第七节分离世代个体的后验概率 94
一、F2群体的遗传模型及其混合分布 96
第五章单个分离世代的数量性状分离分析 96
第一节 单个分离世代群体的遗传模型及其混合分布 96
二、BC1F1的遗传模型及其混合分布 102
三、F2:3家系群体的遗传模型及其混合分布 106
四、回交衍生家系BC1F1:2群体的遗传模型及其混合分布 113
五、DH或RIL群体的遗传模型及其混合分布 120
第二节 单世代数量性状分离分析两步法 127
一、混合分布的样本似然函数和成分分布个数的估计 127
二、主基因＋多基因混合遗传模型的遗传分析 128
一、主要步骤 129
第三节单世代数量性状分离分析的一步法 129
二、极大似然估计的计算 130
三、家系重复试验资料的主基因＋多基因混合遗传分析 151
四、由分布参数估计遗传参数的方法 152
第四节实例分析 153
一、利用单个分离世代检测数量性状遗传体系两步法应用举例 153
二、利用单个分离世代检测数量性状遗传体系一步法应用举例 158
第五节 单个分离世代与不分离世代的联合分析 164
一、单个分离世代的局限性及加进P1、P2和F1世代的增益 164
二、应用实例 166
第六章 多世代联合的数量性状分离分析Ⅰ——P1、F1、P2、F2和F2:3联合分析 169
第一节遗传模型和各世代的混合分布 170
一、一对主基因遗传模型 170
二、两对主基因遗传模型 172
三、多基因遗传模型 176
四、一对主基因＋多基因混合遗传模型 177
五、两对主基因＋多基因混合遗传模型 179
第二节似然函数中分布参数极大似然估计的计算 189
一、一对主基因遗传模型 189
二、两对主基因遗传模型 191
三、多基因遗传模型 198
四、一对主基因＋多基因遗传模型 199
五、二对主基因＋多基因遗传模型 203
第三节实例分析 215
一、大豆对豆秆黑潜蝇抗性遗传的研究实例 215
二、大豆对食叶性害虫抗性发育的遗传研究实例 219
第七章多世代联合的数量性状分离分析Ⅱ——P1、F1、P2、B1、B2和F2联合分析 224
第一节遗传模型和各世代的混合分布 224
一、一对主基因遗传模型 224
二、两对主基因遗传模型 225
三、多基因遗传模型 229
四、一对主基因＋多基因混合遗传模型 230
五、两对主基因＋多基因混合遗传模型 233
第二节似然函数中分布参数极大似然估计的计算 242
一、一对主基因遗传模型 242
二、两对主基因 244
三、多基因遗传模型 248
四、一对主基因＋多基因混合遗传模型 248
五、两对主基因＋多基因混合遗传模型 252
一、应用实例 258
第三节实例分析 258
二、MonteCarlo模拟研究 260
第八章六家系世代联合重复试验的数量性状分离分析——P1、F1、P2、B1:2、B2:2和F2:3联合分析 266
第一节遗传模型和各世代的混合分布 266
一、一对主基因遗传模型 266
二、两对主基因遗传模型 268
三、多基因遗传模型 272
四、一对主基因＋多基因混合遗传模型 273
五、两对主基因＋多基因混合遗传模型 276
一、 一对主基因遗传模型 286
第二节 似然函数中分布参数的极大似然估计的计算 286
二、两对主基因遗传模型 288
三、多基因遗传模型 293
四、一对主基因＋多基因混合遗传模型 294
五、两对主基因＋多基因混合遗传模型 297
第三节实例分析 304
一、无重复试验的六家系世代联合的分离分析 304
二、有重复试验的六家系世代联合分离分析 307
第四节数量性状分离分析中遗传参数标准误的估计 310
一、确定遗传参数估计值标准误的Jackknife法 311
二、确定遗传参数估计值标准误的Bootstrap抽样法 312
第九章QTL遗传体系分离分析方法的应用 316
第一节各种世代类型间分离分析方法的比较 316
一、各种世代类型的归纳 316
二、基本假定 317
三、遗传信息 318
四、精确度 319
第二节植物数量性状遗传体系分离分析方法的应用 319
第三节应用中发现的问题与改进途径 322
一、试验的精确度 322
二、分离比及其推论 324
三、单世代分离分析与多世代联合分离分析的一致性 325
四、分离分析法应用的扩展 326
五、遗传模型的命名体系 327
第四节数量性状遗传体系分离分析法和分子标记法的比较与配合 328
一、在大豆上做的实验与比较 328
二、实验群体与理论群体相符性的检测与调整 341
第十章数量性状分离分析的操作方法与算法程序 351
第一节遗传试验设计与数据结构 351
一、遗传试验设计 351
第二节分布参数估计与模型适合性测验 353
二、试验数据的结构 353
三、数据文件的建立 353
第三节遗传参数估计 362
第四节 后验概率与主基因型归类 365
第五节软件包的结构与使用 367
一、单个分离世代数量性状分离分析的算法程序 367
二、多个分离世代联合数量性状基因座遗传体系分析算法程序 369
参考文献 371
中文索引 377
英文索引 379