第一章 中国民族地区自然环境特点 1
一、中国少数民族人口与分布特点 1
二、中国民族地区的自然环境 1
（一）地形地貌 3
（二）气候 8
（三）河流水系 12
三、中国民族地区的生物多样性保护 13
参考文献 15
第二章 植物分子生态学基本理论 16
一、生态学的基本内涵 16
（一）生态学的概念与研究对象 16
（二）生态学的发展与相关分支学科 18
二、分子生态学的基本内涵 19
三、生态因子及作用 21
（一）生态因子的作用特征 22
（二）生态因子的生态作用及生物的适应 23
四、逆境和逆境植物 26
（一）逆境与胁迫 26
（二）逆境植物及对胁迫的适应 29
五、植物应答逆境胁迫的分子机制研究 30
（一）与抗逆相关基因功能研究 31
（二）与抗逆相关的信号转导途径 35
（三）植物适应逆境的研究层次和技术 40
参考文献 43
第三章 植物抗逆分子生态学研究技术 47
一、分子标记技术 47
（一）SSR 48
（二）SNP 49
（三）EST与EST-SSR 50
（四）SRAP（SBAP）与TRAP 51
（五）DNA barcode 51
二、DNA测序技术 52
（一）第一代测序技术 52
（二）第二代测序技术 53
三、基因表达分析技术 55
（一）低通量基因表达分析技术 55
（二）高通量基因表达分析技术 58
四、基因克隆技术 60
（一）同源序列克隆技术 61
（二）图位克隆技术 61
（三）转座子标签技术 62
（四）电子克隆 62
（五）差异表达基因的克隆技术 63
五、植物转基因技术 67
（一）Ti质粒载体转化法 67
（二）基因枪转化法 68
六、植物基因敲除和基因敲减 68
（一）植物基因敲除技术 68
（二）RNA干扰（RNAi）技术 69
七、蛋白质组学技术 70
（一）双向电泳技术 71
（二）定量蛋白质组学分析技术 73
八、蛋白质互作技术 77
（一）酵母双杂交技术 77
（二）双分子荧光互补 80
（三）荧光共振能量转移 81
参考文献 82
第四章 耐盐草本植物——盐芥的分子生态学 84
一、盐芥的分布及遗传学特性 84
二、盐芥适应逆境的生理生化特征 88
（一）盐胁迫下的离子转运 89
（二）盐胁迫下的渗透调节物质 90
（三）盐胁迫下的保护酶系统 91
（四）盐胁迫下的光合作用 94
（五）盐胁迫下的内源激素变化 96
（六）盐芥中其他物质的合成 98
三、盐芥适应逆境的分子水平特征 100
（一）盐芥基因组文库构建和基因组测序 100
（二）盐芥抗逆基因表达研究 102
（三）盐芥抗逆基因克隆与功能研究 105
（四）盐芥抗逆蛋白质组学研究 115
（五）盐芥应答盐胁迫的代谢组学研究 127
（六）盐芥miRNA研究 128
参考文献 131
第五章 荒漠常绿灌木——沙冬青的分子生态学 138
一、沙冬青分布及遗传学特性 138
（一）沙冬青属植物的种类与分布 138
（二）沙冬青适应逆境的生物学特征 139
二、沙冬青适应逆境的生理生态特征 143
（一）水分生理特征 143
（二）渗透调节物质 143
（三）保护酶系统 145
（四）光合响应特点 147
（五）抗冻蛋白分离 148
三、沙冬青适应逆境的分子水平特征 149
（一）沙冬青cDNA文库的构建 149
（二）沙冬青抗逆基因克隆和功能研究 163
（三）沙冬青抗逆蛋白质组学研究 166
（四）沙冬青miRNA研究 173
四、沙冬青种质资源的价值与保护 183
（一）生态价值 183
（二）经济价值 184
（三）科学研究价值 185
（四）沙冬青种质资源的保护生物学研究 185
参考文献 186
第六章 荒漠河岸乔木——胡杨的分子生态学 191
一、胡杨的分布及遗传学特性 191
（一）胡杨的形态特征与分布 191
（二）胡杨适应逆境的生物学特征 193
（三）胡杨的遗传学特性 196
二、胡杨适应逆境的生理生态特征 198
（一）盐胁迫下的离子转运 198
（二）水分生理特征 201
（三）渗透调节物质 202
（四）保护酶系统 204
（五）光合响应特点 204
三、胡杨适应逆境的分子水平特征 205
（一）胡杨基因组文库的构建 206
（二）胡杨抗逆基因表达研究 208
（三）胡杨抗逆基因克隆与功能研究 211
（四）胡杨抗逆蛋白质组学研究 212
（五）胡杨miRNA研究 213
参考文献 213