第1章 利用烃类的微生物及石油酵母菌的鉴定 1
1.1 利用烃类的微生物 1
1.1.1 细菌 1
1.1.2 酵母菌 1
1.1.3 霉菌 2
1.2 石油酵母菌的分类鉴定 3
1.2.1 材料与方法 3
1.2.2 鉴定方法 4
1.2.3 鉴定结果 5
参考文献 9
第2章 微生物对烷烃的摄取 10
2.1 生长于溶解的烷烃中的微生物 10
2.2 乳化的或“增溶的”烷烃的摄取 10
2.3 合成的表面活性剂对生长的影响 11
2.4 微生物因黏附而摄取烷烃 11
2.5 酵母菌摄取烷烃的机制 12
2.6 酵母菌产生的胞外烷烃乳化剂和增溶剂 13
2.6.1 解脂耶氏酵母 13
2.6.2 球拟酵母 14
2.6.3 解脂假丝酵母 14
2.7 细菌摄取烷烃的机制 14
2.8 细菌产生的胞外烷烃乳化剂和增溶剂 15
2.8.1 铜绿假单胞菌 15
2.8.2 乙酸钙不动杆菌RAG-1 16
参考文献 17
第3章 烃的氧化 20
3.1 短链烷烃的氧化 20
3.1.1 概况 20
3.1.2 代谢途径 21
3.1.3 甲烷单加氧酶 21
3.1.4 甲醇脱氢酶 23
3.1.5 甲醛的氧化 23
3.1.6 甲酸的氧化 24
3.1.7 其他短链烷烃的氧化 24
3.2 长链烷烃的氧化 26
3.2.1 末端氧化 26
3.2.2 次末端氧化 34
3.2.3 两端氧化及代谢过程 35
3.2.4 酵母菌对烷烃的代谢 36
3.3 支链烃的氧化 36
3.4 烯烃的氧化 40
3.5 脂环烃的氧化 42
3.5.1 无取代基的环烷烃的氧化 43
3.5.2 烷基取代的脂环烃的代谢及环烷酸的代谢 48
3.6 芳烃的氧化 51
3.6.1 概况 51
3.6.2 微生物降解基因的操作 51
3.6.3 相关生物化学知识 52
参考文献 78
第4章 烃代谢及发酵生产二元酸 85
4.1 烃代谢研究 85
4.1.1 代谢产物和代谢途径 85
4.1.2 二元酸形成的机制和代谢过程 87
4.1.3 基质的特异性和烷烃的相互作用 90
4.1.4 不饱和二元酸的形成及代谢 96
4.1.5 烯烃-1的代谢 102
4.1.6 其他 102
4.2 烷烃发酵生产二元酸 108
4.2.1 产二元酸菌种的筛选和诱变 108
4.2.2 发酵条件 109
4.2.3 中型发酵试验 109
4.2.4 产二元酸耐高温菌的选育 110
4.2.5 菌种产酸能力的提高 112
4.2.6 其他实验室的工作 114
4.3 国外有关研究的新进展 115
4.3.1 烷烃两端氧化机制 115
4.3.2 提高二元酸的生产 117
参考文献 121
第5章 石油发酵 126
5.1 引言 126
5.2 单细胞蛋白 128
5.2.1 单细胞蛋白生产菌的种类 129
5.2.2 作为原料的烃的比较 129
5.2.3 利用烃类生产菌体的某些问题 130
5.2.4 工艺 135
5.3 氨基酸 140
5.3.1 谷氨酸 140
5.3.2 其他氨基酸 146
5.4 有机酸 151
5.4.1 α-酮戊二酸 151
5.4.2 柠檬酸和异柠檬酸 151
5.4.3 C7-酸 153
5.4.4 富马酸、苹果酸和琥珀酸 154
5.4.5 长链二元酸 154
5.4.6 黏康酸与β-酮基己二酸 156
5.4.7 水杨酸 157
5.4.8 利用协同氧化作用生产有机酸 158
5.5 维生素、辅酶及有关的化合物 162
5.5.1 维生素B2 163
5.5.2 维生素B6 163
5.5.3 维生素B12 164
5.5.4 生物素——同效维生素 165
5.5.5 辅酶A 165
5.5.6 细胞色素C和卟啉 166
5.5.7 麦角甾醇 166
5.5.8 类胡萝卜素 166
5.5.9 辅酶Q 167
5.6 生物表面活性剂 168
5.6.1 细菌的表面活性剂 169
5.6.2 酵母菌的表面活性剂 175
5.6.3 其他真菌的表面活性剂 176
参考文献 177
第6章 烃类的厌氧代谢 186
6.1 正烷烃的厌氧代谢 187
6.1.1 正烷烃的羧化 188
6.1.2 富马酸加成 192
6.2 正烯烃的厌氧代谢 208
6.2.1 D.aliphaticivorans转化1-烯烃成脂肪酸 208
6.2.2 1-D2-1-十五烯衍生的脂肪酸 210
6.2.3 全氘化十六烯衍生的脂肪酸 210
6.2.4 存在［13C］碳酸氢钠时形成的脂肪酸 210
6.2.5 （全）氘化的脂肪醇的鉴定 211
6.3 脂环烃的厌氧代谢 212
6.3.1 菌群对基质的反应 212
6.3.2 乙基环戊烷降解的代谢物 213
6.4 单环芳烃的厌氧代谢 215
6.4.1 甲苯生物降解 216
6.4.2 苯的生物降解 225
6.4.3 乙苯的生物降解 228
6.4.4 二甲苯的生物降解 236
6.4.5 厌氧中心分解代谢途径 241
6.5 多环芳烃的厌氧代谢 245
6.5.1 厌氧代谢萘和菲的一种初始反应——羧化 245
6.5.2 厌氧降解萘的纯培养及其他 248
6.5.3 2-甲基萘的厌氧降解 248
6.5.4 萘、2-甲基萘和四氢萘厌氧降解中的环裂解 251
6.5.5 硫酸还原富集培养N47厌氧2-甲基萘降解中的基因簇 254
参考文献 256
第7章 生物降解塑料——聚羟基烷酸 261
7.1 产PHA的微生物及PHA的多样性 261
7.1.1 微生物及所产PHA的种类 261
7.1.2 短碳链聚羟基烷酸PHASCL 265
7.1.3 中碳链聚羟基烷酸P（3HA）MCL 269
7.1.4 含SCL-及MCL-HA重复单位的PHA 276
7.2 PHA的生物合成及生化基础 277
7.2.1 合成途径 277
7.2.2 PHA合酶 282
7.2.3 重组菌 287
7.3 PHA的生产 291
7.3.1 发酵过程 292
7.3.2 PHA的回收 299
7.4 近年来开发PHA的一些亮点和新进展 302
7.4.1 胞外高产聚羟基烷酸 302
7.4.2 同时产聚羟基烷酸和鼠李糖脂 307
7.4.3 利用工农业加工废料及廉价原料 312
7.4.4 非相关碳源产PHA 314
7.4.5 提高性价比 315
7.4.6 后提取 318
7.4.7 手性单体 320
参考文献 322