第一章 糖组学技术应用策略 1
第一节 糖组学研究概述 1
第二节 糖组学研究技术 7
参考文献 13
第二章 糖基因芯片技术 17
第一节 糖基因芯片的制备 18
第二节 应用实例 26
实例一 糖基因芯片在肝癌细胞中的应用研究 26
实例二 糖基因芯片在肝癌患者外周血中的应用研究 28
参考文献 30
第三章 凝集素芯片技术 31
第一节 凝集素芯片制备技术 31
第二节 应用实例 36
实例一 凝集素芯片检测TGF-β1诱导肝星状细胞活化前后糖蛋白糖链谱 36
实例二 凝集素芯片检测肝癌患者和健康志愿者唾液糖蛋白糖链谱 39
参考文献 41
第四章 凝集素组织化学技术与应用 42
第一节 凝集素组化技术 42
第二节 应用实例 48
实例一 凝集素组化技术用于分析人肝癌组织、肝硬化组织、癌旁组织糖链表达 48
实例二凝 集素组化技术用于分析小鼠纤维化肝糖链表达 51
实例三凝 集素组化技术用于分析TGF-β1诱导肝星状细胞糖链表达 53
参考文献 54
第五章 基于凝集素磁性微粒复合物的糖蛋白及其糖链的分离纯化技术 56
第一节 凝集素磁性微粒的制备 57
第二节 应用实例 71
实例一 凝集素Con A磁性微粒复合物应用于血清中糖蛋白的分离纯化及鉴定 71
实例二 凝集素磁性微粒复合物应用于细胞中糖蛋白的分离纯化及鉴定 80
实例三 凝集素磁性微粒复合物应用于活细胞表面膜糖蛋白的分离纯化及鉴定 87
参考文献 93
第六章 凝集素-磁性微粒复合物分离及其非标记的蛋白质质谱定量技术 94
参考文献 108
第七章 滤膜辅助凝集素分离糖肽及其糖基化位点分析技术 109
参考文献 124
第八章 酰肼化学法分离纯化糖蛋白／糖肽技术 125
第一节 酰肼化学法分离纯化糖蛋白／糖肽 125
第二节 酰肼功能化磁性微粒分离纯化糖蛋白／糖链 131
第三节 应用实例 133
实例 酰肼树脂法分离纯化肝癌病人与健康志愿者血清糖蛋白、糖肽、末端唾液酸化糖肽 133
参考文献 134
第九章 亲水亲和分离纯化糖蛋白技术 135
第一节 亲水亲和分离技术 135
第二节 应用实例 138
实例 亲水亲和技术分离纯化健康志愿者唾液糖蛋白 138
参考文献 145
第十章 滤膜辅助糖蛋白糖链的分离纯化及其结构质谱解析技术 146
第一节 滤膜辅助全糖蛋白N-连接糖链的分离 148
第二节 滤膜辅助糖蛋白O-连接糖链的分离 152
第三节 滤膜辅助的凝集素分离糖蛋白N-连接糖链 155
参考文献 159
第十一章 糖芯片制备技术 161
第一节 糖芯片基本原理与操作 161
第二节 应用实例 166
实例一 凝集素RCA120的结合特异性分析 166
实例二 糖芯片在TGF-β1诱导下人肝星状细胞研究中的应用 169
参考文献 173
第十二章 糖结合蛋白分离纯化技术 174
第一节 羟基化磁粒的制备 174
第二节 糖链-磁粒复合物的制备 176
第三节 糖结合蛋白的分离纯化 178
第四节 糖结合蛋白的鉴定方法 180
第五节 应用实例 188
实例 肝癌患者和健康志愿者血清中甘露糖结合蛋白的分离纯化与鉴定 188
参考文献 200
第十三章 糖结合蛋白基因芯片技术 201
第一节 糖结合蛋白基因芯片制备技术 201
第二节 应用实例 209
实例 糖结合蛋白基因芯片在肝癌研究中的应用 209
参考文献 211
第十四章 糖组学数据统计分析方法 213
第一节 引言 213
第二节 图像采集 214
第三节 数据预处理 219
第四节 寻找表达差异基因、蛋白质或糖链 222
第五节 聚类分析 224
第六节 统计分析软件及专家系统 230
参考文献 232
第十五章 用于糖组学研究的生物信息学技术 233
第一节 糖基化位点预测与鉴定方法 233
第二节 糖结合蛋白预测及分类 244
参考文献 257
第十六章 糖组学数据库 258
第一节 糖组学相关数据库 258
第二节 糖组学研究主要网络平台 266
参考文献 280
附录 282
一 糖基因列表 282
二 凝集素列表 295
三 缩略语 300
四 生物信息学相关数据库 303