上篇 有机质谱方法 2
1概述 2
1.1质谱法及基本术语 2
1.2质谱法简史 4
1.3质谱信息 5
1.3.1准确质量 5
1.3.2元素组成 6
1.3.3同位素丰度 7
1.3.4不饱和度 7
1.3.5氮规律 7
1.3.6质谱峰强度与质谱定量 8
参考文献 9
2离子化方法（离子源） 10
2.1电子轰击离子化（El） 10
2.2化学离子化（CI） 11
2.3激光解吸离子化（LDI） 13
2.3.1基质辅助激光解吸/离子化（MALDI） 13
2.3.2表面增强激光解吸/离子化（SELDI） 18
2.3.3表面辅助激光解吸/离子化（SALDI） 18
2.4大气压离子化（API） 19
2.4.1电喷雾离子化（ESI） 19
2.4.2大气压化学离子化（APCI） 37
2.4.3其他大气压离子化技术 38
参考文献 42
3质谱仪器（质量分析器） 44
3.1扇形磁场质谱仪 44
3.1.1原理 44
3.1.2性能及限制 45
3.2四极质谱仪和四极离子阱质谱仪 46
3.2.1基本原理——Mathieu方程 48
3.2.2离子轨道的稳定区 50
3.2.3线形离子阱（LIT） 52
3.3飞行时间质谱法（TOF MS） 52
3.3.1基本原理 53
3.3.2质量分辨率 53
3.3.3质量测定 55
3.3.4数据采集和灵敏度 55
3.3.5脉冲正交引出和连续离子源 56
3.3.6多次反射和多次旋转TOF MS 56
3.4傅里叶变换离子回旋共振质谱仪（FTICR MS） 57
3.4.1基本原理 58
3.4.2结构与实验程序 61
3.4.3性能和影响因素 65
3.5静电场轨道离子阱（Orbitrap） 68
3.5.1轨道捕获和Kingdon阱 68
3.5.2 Orbitrap质量分析器 69
3.6串联质谱法 72
3.6.1离子的活化方法 72
3.6.2串联质谱仪 75
3.6.3杂交质谱仪 80
3.7检测器 86
3.7.1电子倍增器 86
3.7.2微通道板 87
3.8进样系统及联用技术 88
3.8.1直接进样杆（DIP） 88
3.8.2加热储槽进样器 89
3.8.3气相色谱-质谱联用技术（GC-MS） 89
3.8.4液相色谱-质谱法（LC-MS） 89
3.8.5毛细管电泳-质谱联用技术（CE-MS） 94
3.8.6离子淌度谱-质谱（IMS-MS） 94
参考文献 98
4数据处理与发掘 101
4.1色谱-质谱数据处理 101
4.1.1背景扣除 101
4.1.2提取离子色谱图（EIC） 102
4.1.3产物离子过滤（PIF）及中性丢失过滤（NLF） 102
4.1.4质量差值过滤（MDF） 104
4.1.5同位素图形过滤（IPF） 107
4.1.6分子特征提取（MFE） 107
4.2数据库和质谱库检索 108
参考文献 109
5质谱解析 110
5.1分子离子和准分子离子 110
5.2基本的裂解反应及机理 110
5.2.1 α裂解 111
5.2.2 i裂解（电荷中心驱动的裂解） 111
5.3大气压离子化质谱（API MS）的解析 114
5.3.1小分子化合物API MS的解析 114
5.3.2生物聚合物的MS 126
参考文献 138
下篇 有机质谱法的应用 142
6有机质谱法在药物分析中的应用 142
6.1化学药物分析 142
6.1.1合成药物质谱分析 142
6.1.2药物的杂质分析 146
6.1.3药物代谢研究 157
6.2单克隆抗体药物分析 170
6.2.1抗体药物的质谱分析法 170
6.2.2糖苷的CE-MS分析 173
6.3中药与天然药物分析 175
6.3.1指纹图谱测定 175
6.3.2药材中生物碱和黄酮成分的分析 178
6.3.3中药挥发性成分分析 186
6.3.4中药复方活性部位分析 193
6.3.5复方制剂的药物代谢动力学 202
参考文献 207
7有机质谱法在食品安全分析中的应用 208
7.1乳制品中非法添加和农药、兽药残留分析 208
7.1.1乳制品中的双氰胺和三聚氰胺分析 208
7.1.2牛奶中的农药和兽药残留分析 210
7.2肉类和蔬菜水果中农药、兽药和毒素分析 216
7.2.1畜禽肉类中的兽药残留分析 216
7.2.2蔬菜水果中的农药残留分析 222
7.3真菌毒素和贝类毒素分析 230
7.3.1食品中的真菌毒素分析 230
7.3.2原多甲藻酸贝类毒素 235
参考文献 239
8有机质谱法在环境监测中的应用 240
8.1大气污染分析 240
8.1.1大气颗粒物（PM10， PM2.5）中的多环芳烃分析 240
8.1.2大气中的氯代和溴代二？英/呋喃分析 243
8.2沉积物/土壤有机污染物分析 249
8.2.1沉积物中多环芳烃和有机氯农药分析 249
8.2.2南极样品中有机氯农药 253
8.3水中的有机污染物分析 257
8.3.1水体中的多环芳烃分析 257
8.3.2水中的除草剂 260
8.3.3饮用水中药品和个人护理品分析 263
参考文献 269
9有机质谱法在生命科学中的应用 270
9.1蛋白质组学 270
9.1.1阿尔茨海默病的蛋白质组学 270
9.1.2半胱氨酸蛋白酶抑制剂的分析 276
9.2代谢组学 281
9.2.1儿童急性淋巴细胞白血病 282
9.2.2“通心络”预防血管内皮功能异常 287
9.3质谱成像 297
9.3.1 MALDI-MSI成像方法和技术 297
9.3.2小鼠肝组织中的磷脂类分子的分布 301
9.3.3小鼠脑下垂体中神经肽的AP-MALDI MSI 303
参考文献 306