卷之首 1
集例 1
先天图 3
天地人物气候相应说 3
天地人物气候相应图 7
释方 8
历代医学姓氏 14
上古圣贤 14
儒医 15
明医 23
世医 33
德医 35
仙禅道术 38
原道统说（纂《绀珠经》） 39
阴骘 41
保养 43
天真节解（《索问》首篇） 43
茹淡论 44
阴火论 45
保养说 47
附导引法 48
运气 50
运气总论 50
内集卷之一 63
经络 63
经穴起止 63
十五络脉 93
奇经八脉 93
奇经主病 94
脏腑 94
脏腑总论 94
脏腑条分 98
观形察色问症 121
观形察色 121
听声审音 121
问症 121
诊脉 125
寸关尺定位 125
脏腑定位 126
七表八里九道脉名 126
诸脉体状 127
诸脉相类 129
诸脉主病 129
诸脉相兼主病 130
脏腑六脉诊法 141
气口人迎脉诀 153
总看三部脉法 156
伤寒脉法 162
杂病脉法 164
妇人脉法 172
成童脉法 174
痈疽脉法 174
死脉总诀 175
形色脉相应总诀 176
针灸 177
子午八法 177
附杂病穴法 180
禁针穴 198
造针法 198
煮针法 199
灸法 199
治病要穴 200
治病奇穴 203
禁灸穴 206
炼脐法 207
接命丹 208
温脐种子方 209
温脐兜肚方 209
针灸服药吉日（紧急不拘） 209
九宫尻神禁忌 210
九部人神禁忌 210
十二部人神禁忌 210
四季人神禁忌 210
逐月血忌 210
逐月血支 210
十二支人神所在禁忌 211
逐日人神所在禁忌 211
内集卷之二 213
本草引（纂《捷径》雷公） 213
本草总括 213
本草分类 221
治风门 221
治热门 240
治湿门 265
治燥门 286
治寒门 312
内集卷之三 336
治疮门 336
食治门 366
米谷部 366
菜部 374
果部 382
兽部 389
禽部 398
虫鱼部 405
附食治方 412
风 412
寒 413
暑 413
湿 414
燥 415
火（与热门参用） 415
内伤脾胃 416
气（郁同） 417
血 418
痰 419
热（忌酒） 420
阴虚（忌多饮酒） 420
阳虚 421
诸虚（通用） 421
外集卷之四 425
伤寒序 425
病机外感 425
温暑 425
一十八剂 428
伤寒 429
六经正病 430
表里阴阳汗吐下温解五法 435
正伤寒 439
类伤寒 447
伤寒初症 450
伤寒杂症 458
传阳变阴 473
瘥危死症及妇人伤寒 477
伤寒用药赋 482
汗吐下渗和解温补总方 517
阳症 517
阴症 527
病机内伤（饥饱劳役饮食积聚） 530
内外伤辨 530
内伤辨（新纂） 532
脾胃虚实传变论 534
内伤饥饱劳倦总方 538
补益 538
调理 540
分消（内湿） 542
妇人 542
小儿 543
外科 543
外集卷之五 549
杂病提纲 549
外感 549
风 549
寒 553
暑 554
湿 556
燥 557
火 558
内伤 559
调理脾胃 559
气 560
血 562
痰 564
郁 566
积热 567
诸虚 569
沉寒痼冷 571
杂病分类 573
外感 573
风类 573
寒类 594
暑类 601
湿类 607
燥类 623
火类 626
内伤 631
气类 635
血类 636
痰类 640
虚类 653
外集卷之六 670
妇人门 670
经候 670
崩漏 674
带下 676
癥瘕（与男子积聚条参看） 677
胎前 679
临产 686
产后 689
附胎杀禁忌 693
小儿门 694
观形 694
察脉 697
五脏形症虚实相乘 700
死症 701
乳子调护 702
小儿病机 702
胎毒类 702
初生 702
撮口 705
噤口 705
脐风（附胎风） 706
胎惊夜啼 707
诸惊 708
痫痓 712
客忤 714
天钓 714
内钓 714
疝气 715
变蒸 716
龟胸龟背（附解颅囱填囱陷滞颐） 717
五软五硬 718
内伤乳食类 720
吐泻 720
五疳 723
诸积 728
外感 733
诸热 735
痘 736
麻 761
外科 763
痈疽总论 763
脑颈部 770
手部 776
胸腹部 777
背腰部 780
臀腿部 782
足膝部 789
遍身部 791
外集卷之七 808
杂病用药赋（制法俱见本草） 808
外集卷之八 916
妇人小儿外科用药赋（制法见本草） 916
拾遗 972
杂病妇人小儿外科总方 977
气类 977
血类 978
痰类 979
郁类 979
通用古方诗括 980
伤寒 980
内伤 982
中风 983
头痛 985
面 986
眼 986
齿 988
痹风 989
麻木 989
感寒 990
咳 990
霍乱 991
心痛 992
暑 992
疟 993
痢 994
湿 994
痞满 995
泄泻 995
黄疸 995
水肿 995
胀满 996
浊 997
腰痛 997
寒疝 997
脚气 998
燥渴 999
火 999
胁痛 1000
淋 1000
脾胃 1001
气 1002
喘 1006
呃逆 1007
膈噎 1007
痫 1008
怔忡 1008
虚 1008
蒸热 1010
汗 1011
痿 1011
热 1011
妇人 1013
痘 1018
外科 1019
肺痈 1022
肺痿 1022
胁痈 1023
胃痈 1023
肠痈 1023
痔 1023
鹤膝风 1023
癣疥 1024
折伤 1024
伤风 1024
总方 1025
急救诸方 1025
怪疾 1029
治法 1034
水火分治 1034
标本分治 1035
标本论 1035
求本论 1036
杂治赋 1037
习医规格 1042