卷之一 1
治诸风（附脚气） 1
卷之二 29
治伤寒（附中暑） 29
卷之三 46
治一切气（附脾胃、积聚） 46
卷之四 76
治痰饮（附咳嗽） 76
卷之五 87
治诸虚（附骨蒸） 87
治痼冷（附消渴） 107
卷之六 116
治积热 116
治泻痢（附秘涩） 123
卷之七 136
治眼目疾 136
治咽喉口齿 141
卷之八 145
治杂病 145
治疮肿伤折 154
卷之九 165
产图 188
催生符 190
推妇人行年法 190
卷之十 194
诸汤 215
诸香 220
指南总论卷上 221
论处方法 221
论合和法 222
论服饵法 223
论用药法 224
论三品药畏恶相反 225
论服药食忌 227
论炮炙三品药石类例 227
指南总论卷中 236
论中风证候 236
论伤寒证候 238
论瘴疟证候 243
伤寒十劝 244
指南总论卷下 246
论诸气证候（附脾胃积聚） 246
论痰饮咳嗽 248
论诸虚证候（附痼冷） 249
论积热证候（附咽喉、口齿、眼目） 250
论泻痢证候 251
论痈疽诸证（附疮癣） 253
论妇人诸疾 253
论小儿诸疾 255