导论 1
一、群体遗传学的内涵 1
（一）基本概念 1
（二）基本特性 1
二、群体遗传学的发展 1
（一）产生群体遗传学的理论前提 1
（二）群体遗传学奠基与形成 1
（三）当代群体遗传学的发展 2
三、群体遗传学在遗传学中的地位与意义 3
第一章 自然突变率 4
一、自然突变率的直接测定 4
（一）常染色体座位 4
（二）性染色体座位 6
二、自然突变率的间接估计 7
（一）显性基因 8
（二）隐性伴性基因 8
（三）常染色体隐性基因 9
三、蛋白质基因的自然演变率 10
（一）直接测定法 11
（二）蛋白质座位突变率的间接估计 13
第二章 Hardy-Weinberg平衡定律应用 18
一、Hardy-Weinberg定律的内涵 18
二、Hardy-Weinberg平衡的若干性质 19
三、斯奈德比值 21
四、母子组合频率 25
五、伴性基因的Hardy-Weinberg平衡 28
（一）伴性基因频率分布的理论分析 28
（二）对理论的检验 32
第三章 基因频率的定向变化 36
一、频发突变 36
（一）不存在回原（反突变）的频发突变 36
（二）存在回原的频发突变 37
二、迁移 40
三、淘汰 42
（一）淘汰部分隐性类型 42
（二）淘汰全部隐性类型 48
（三）淘汰部分隐性类型和部分杂合子 50
（四）涉及超显性的淘汰 53
（五）关于淘汰的小结 58
四、多因素的合并效应 60
第四章 基因频率的随机变化 66
一、遗传漂变的度量和性质 66
（一）遗传漂变 66
（二）群体有效规模 70
（三）近交增量（近交率） 71
（四）有限群体遗传变异消失的速度 71
二、始祖效应和瓶颈效应 72
（一）含义 72
（二）始祖效应和瓶颈效应对家畜种群的影响 72
第五章 基因频率分布与进化过程 74
一、基因频率的分布函数 74
二、适应进化 75
（一）Wright的“适应峰”学说 75
（二）适应进化论的基本主张 77
（三）适应进化的可能方式 77
（四）适应进化的具体演变情况 78
三、分子进化 79
（一）关于蛋白质分子进化速度的研究成果 79
（二）各种生物蛋白质电泳分析揭示的大量多型现象 81
四、关于中立说－淘汰说争论的新进展 82
第六章 群体中的遗传变异 85
一、遗传多型的一般概念与保持机制 85
（一）一般概念 85
（二）有关例证统计 85
（三）遗传多型形成的概率分析 86
（四）保持群体遗传多型状态的遗传学机制 87
二、群体遗传变异的分析 87
（一）若干基本概念 87
（二）群体遗传多样性的度量方法 88
（三）群体内孟德尔性状表型变异的鉴别 92
三、遗传负荷 97
（一）概念 97
（二）遗传负荷的一般度量方法 97
（三）遗传负荷的性质 97
（四）遗传负荷的起因 97
（五）分离负荷度量 98
四、DNA多型的含义及度量 98
（一）DNA多型的含义 98
（二）度量方法 99
五、遗传多型的进化意义 100
（一）遗传多型研究对进化理论发展的贡献 100
（二）DNA多型水平相对更高的遗传学基础和有关应用问题 101
第七章 群体结构与系统分化 103
一、群体结构模型 103
（一）平面上连续分布模型 103
（二）岛屿模型 104
（三）2级踏脚石模型 105
二、遗传分化的度量 105
（一）近交度的分解 105
（二）分化指数 106
第八章 系统分类 107
一、遗传检测的抽样方法 107
（一）几种抽样方法 107
（二）样本规模的影响 109
（三）不同抽样方法的比较 114
（四）关于抽样的实施 117
二、分类依据 118
（一）各种遗传标记的作用 118
（二）群体间相似性度量的基本数学根据 118
三、分类方法 120
（一）经典聚类分析 121
（二）模糊聚类分析 126
（三）主成分分析——多种标记的减元并用 132
（四）判别分析 138
第九章 DNA与氨基酸序列的遗传演变 144
一、DNA序列的遗传演变 144
（一）突变 144
（二）基因表达过程中密码子的使用频率 145
（三）两个DNA序列间的核苷酸差异 147
（四）核苷酸取代数的数学模型 149
二、氨基酸序列的遗传演变 155
（一）两个氨基酸序列间差异的度量 155
（二）序列间差异度量值的卜瓦松校正 156
（三）对PC距离的讨论——Γ距离 158
第十章 分子进化与“分子进化钟” 160
一、生物大分子进化的基本特点与有关学术争论 160
（一）DNA高分子进化机制的研究成果 160
（二）分子进化“中立论”与“新达尔文主义”争论 160
二、“分子钟”假说的意义和当前有关实验证据一览 161
（一）“分子钟”假说 161
（二）实验证据一览 161
三、分子进化相对速率检验方法 162
（一）以统计学模型为基础的检验 162
（二）非参数检验（不依据统计模型的检验） 164
（三）以系统发育检验“分子钟”假设的方法简介 166
第十一章 动物遗传资源保种方案的制订 169
一、动物遗传资源保护的内涵 169
二、群体遗传多样性保持的原理及保种方案的制订 170
参考文献 181