第一篇 树鼩基础生物学 3
第一章 树鼩进化分类地位的分子证据 3
第一节 前言 3
第二节 树鼩的传统分类地位 4
一、树鼩归类于攀鼩目 4
二、争论不休的攀鼩目 4
第三节 基于分子证据界定树鼩的进化地位 6
一、基于分子证据界定物种进化地位的方法——系统发育研究方法 6
二、线粒体DNA数据揭示树鼩与兔形目动物是“近亲” 7
三、核基因数据分析 9
第四节 结语 13
第二章 树鼩群体遗传多样性 17
第一节 前言 17
第二节 遗传多样性概述 17
一、遗传多样性的概念 17
二、研究遗传多样性的主要指标 18
三、研究遗传多样性的主要方法 19
第三节 攀鼩目动物的系统分类与地理分布 20
第四节 树鼩表型多态性 23
第五节 群体间遗传多样性 25
一、微卫星位点的分析 25
二、线粒体DNA的研究 26
三、基于其它分子标记的研究 29
第六节 树鼩群体遗传多样性研究和资源利用与保护 29
第三章 树鼩基因组测定与特点概述 32
第一节 前言 32
第二节 基因与基因组 32
第三节 树鼩基因组测序 33
一、中美测定的树鼩基因组整体质量比较 33
二、树鼩基因组测序与组装 34
第四节 树鼩基因组的特点 36
一、树鼩的转座因子与分散重复序列 36
二、蛋白质编码基因 38
三、非编码RNA 38
第五节 树鼩基因组的进化 39
第六节 树鼩的功能基因 46
一、树鼩的假基因 46
二、树鼩特有的缺失基因 51
三、树鼩与灵长类特有的共同基因 52
四、树鼩的神经系统基因 55
五、树鼩的免疫系统基因 61
六、树鼩的代谢系统基因 64
七、树鼩运动系统相关基因 66
第七节 树鼩药物靶点基因 66
一、树鼩细胞色素P450（CYP）家族 67
二、树鼩肝炎药靶基因 67
第八节 树鼩转录组学研究 68
一、树鼩转录组测序 68
二、树鼩基因表达信息 69
第九节 树鼩基因组数据库的开发 70
第十节 展望 71
第四章 树鼩主要组织相容性复合物（MHC）的研究 76
第一节 前言 76
第二节 MHC基因和分子的结构及功能 76
一、MHC基因及分子结构 77
二、MHCⅠ和Ⅱ类分子的功能 79
第三节 树鼩MHC的结构 81
一、树鼩MHCⅠ类基因及分子结构 81
二、树鼩MHCⅡ类基因及分子结构 84
第四节 树鼩MHC基因的遗传学特点 86
一、多态性 86
二、单倍型遗传 87
三、连锁不平衡 88
第五节 结语与展望 89
第五章 树鼩病毒限制因子TRIM5α/TRIMCyp的研究 91
第一节 病毒限制因子TRIM5α 91
一、宿主限制因子TRIM5α的发现 91
二、TRIM5基因及其转录本结构 92
三、TRIM5α各个结构域的功能 92
四、TRIM5αmRNA的组织分布 93
五、TRIM5α限制逆转录病毒的可能机制 93
六、TRIM5α以物种特异性的方式限制逆转录病毒 94
七、TRIM5的进化特征 94
八、TRIM5α参与天然免疫通路 95
第二节 病毒限制因子TRIMCyp 96
一、亲环素A及其逆转座子 96
二、灵长类动物TRIMCyp 97
第三节 树鼩TRIM5的研究 99
一、树鼩TRIM5基因及其转录本结构 99
二、树鼩TRIM5的组织分布和功能 100
第四节 树鼩TRIMCyp的研究 102
一、树鼩TRIMCyp形成模式 102
二、树鼩TRIMCyp在攀鼩目与灵长目／皮翼目分化后产生并固定 104
三、树鼩TRIMCyp的组织分布 105
四、树鼩TRIMCyp的RBCC结构域与TRIM5的RBCC结构域所受选择压力不同 106
五、树鼩TRIMCyp不能限制HIV-1和SIVmac 106
六、树鼩TRIMCyp参与天然免疫调控 108
第五节 结语与展望 109
第六章 树鼩肿瘤相关基因介绍 114
第一节 前言 114
第二节 树鼩肿瘤相关基因比较分析 114
一、肿瘤相关基因来源及比较方法 114
二、同源性比对结果 115
三、树鼩-人同源性比小鼠-人同源性高10％以上的基因介绍 120
四、树鼩特有同源基因介绍 133
五、树鼩特有同源基因及树鼩-人同源性较高的肿瘤相关基因信号通路聚类分析 140
第三节 肿瘤动物模型情况概述 143
第四节 结语与展望 143
第七章 树鼩的脑形态 146
第一节 树鼩脑的大体形态 146
第二节 树鼩脑的演化 147
第三节 树鼩脑中一些特化较大的结构 148
一、树鼩脑的皮层下结构 148
二、大脑及大脑皮层 149
第四节 树鼩脑功能解剖 150
一、视觉系统 150
二、听觉系统 152
三、体感系统 152
四、树鼩的锥体和锥体外运动系 153
第八章 树鼩脑活体T2加权MRI立体定位图谱 156
第一节 前言 156
第二节 T2加权MRI树鼩大脑核团与白质结构标定 156
一、动物准备与数据采集 156
二、数据处理 157
三、树鼩脑MRI的表面解剖 157
四、主要核团和白质结构标注 158
第三节 结语 163
第九章 树鼩脑结构的演化与行为 165
第一节 前言 165
第二节 脑结构、功能及其演化 166
一、脑外观的基本形态和结构 166
二、树鼩脑的演化地位 167
第三节 感知觉及相关行为 168
一、视觉 168
二、痛觉与行为 169
三、嗅觉和听觉 169
第四节 学习与记忆 170
第五节 应激及情绪行为 172
第六节 昼夜节律 173
第十章 树鼩情绪相关脑区肽能神经元分布 175
第一节 树鼩情绪相关脑区的解剖结构 175
一、下丘脑 175
二、内侧前额叶和扣带回皮层 177
三、杏仁核体 177
四、海马结构 178
五、隔区 179
六、终纹床核 179
第二节 树鼩情绪相关脑区中肽能神经元分布 180
一、加压素神经元在情绪相关脑区中分布 180
二、催产素神经元在情绪相关脑区中分布 184
三、促肾上腺皮质激素释放激素神经元在情绪相关脑区中分布 188
四、血管活性肠肽神经元在情绪相关脑区中分布 192
五、神经肽Y神经元在情绪相关脑区中分布 194
第十一章 树鼩基础生理学数据 207
第一节 前言 207
第二节 驯养树鼩常规形态和解剖学数据 208
一、体尺指标数据 208
二、主要脏器指标数据 210
三、脑容量数据 211
第三节 驯养树鼩的基础生理学指标 212
一、基础身体指标 212
二、脑电 214
三、生理节律 215
四、糖代谢指标 215
五、应激内分泌学指标 216
第四节 存在问题与展望 217
第十二章 树鼩基础生理代谢 220
第一节 树鼩基础生理代谢 220
一、树鼩体重、空腹血糖、性别和年龄的关系 220
二、树鼩肥胖与糖脂代谢 223
三、温度和季节对树鼩生理代谢的影响 224
第二节 树鼩肝脏和肌肉蛋白质组学 224
第三节 树鼩脂代谢相关基因研究 225
一、树鼩脂代谢基因比较基因组学 225
二、树鼩FABP家族 227
三、硬脂酰辅酶A去饱和酶基因 228
第十三章 树鼩的血液生理生化 233
第一节 树鼩的常用血液生物化学指标 233
第二节 树鼩的常用血液学指标 237
一、骨髓细胞形态学分析 237
二、外周血细胞数量检测 241
第十四章 树鼩乳腺生物学 245
第一节 树鼩乳腺的正常发育 245
一、树鼩乳腺的特征 245
二、树鼩乳腺发育过程中的激素变化 250
第二节 树鼩乳腺相关疾病 251
一、树鼩乳腺自发肿瘤 251
二、树鼩乳腺寄生虫 255
第三节 树鼩乳腺相关基因克隆和分析 255
一、激素受体ESR基因 255
二、生长因子受体 257
三、原癌基因和抑癌基因信号途径 259
第十五章 树鼩共生微生物 265
第一节 微生物与微生物学基础理论 265
一、微生物与微生物学 265
二、微生物的种类与分布 265
三、微生物的特点 266
第二节 动物与微生物的关系 267
一、有益微生物 267
二、条件致病微生物 267
三、病原微生物 267
第三节 树鼩共生微生物情况分析 267
一、体表共生微生物 268
二、口腔共生微生物 269
三、呼吸道共生微生物 269
四、肠道共生微生物 270
五、肛门共生微生物 271
第四节 树鼩共生微生物对树鼩资源的开发利用与标准化研究的意义 272
一、人工驯养繁殖对树鼩共生微生物的影响 272
二、树鼩的共生微生物研究推进其实验动物化进程 273
三、树鼩的人工驯养繁殖和实验树鼩标准化的推进 273
第十六章 树鼩正常组织学及图解 275
第一节 神经系统 275
第二节 循环系统 278
第三节 呼吸系统 279
第四节 消化系统 281
一、消化管 281
二、消化腺 281
第五节 泌尿系统 287
第六节 生殖系统 289
第七节 内分泌系统 291
第八节 免疫系统 293
第九节 肌肉、皮肤和脂肪 295
第十七章 树鼩生殖生理与辅助生殖 297
第一节 树鼩生殖器官解剖结构及生理特性 297
一、雄性生殖器官解剖结构及生理特性 297
二、雌性生殖器官解剖结构及生理特性 302
第二节 树鼩生殖内分泌学研究 309
一、妊娠期孕酮的分泌范型 309
二、雄性树鼩发育中雄激素分泌的范型 309
第三节 树鼩人工辅助生殖技术 310
一、树鼩精液采集和冷冻保存 310
二、胚胎移植 324
第十八章 树鼩规范化人工繁育 330
第一节 树鼩饲养环境和设备 330
一、饲养环境 330
二、树鼩的饲养笼具 331
第二节 树鼩的饲料和饮水 332
一、饲料和饮水 332
二、应用效果 333
第三节 树鼩规范化人工繁育 334
一、树鼩的引进和检疫 334
二、树鼩繁殖群的管理 335
三、仔树鼩的培育 339
第四节 树鼩常见疾病及其防治 341
一、传染性胃肠炎 341
二、肺炎 342
三、外伤性创伤 342
第二篇 疾病树鼩模型 347
第十九章 抑郁症树鼩模型 347
第一节 抑郁症 347
第二节 抑郁症发病机理假说简介 347
一、“单胺类神经递质”假说 348
二、“神经营养因子”假说 348
三、“成年海马神经元新生”假说 348
四、“奖励缺失”假说 348
五、“应激”假说 348
六、“神经可塑性”假说 348
七、“谷氨酸受体功能”假说 349
第三节 抑郁症的动物模型 349
第四节 对现有抑郁症动物模型的评述 351
第五节 抑郁症动物模型的科学意义 352
第六节 抑郁症的树鼩模型研究进展 352
一、树鼩作为模型动物的潜在优势 352
二、树鼩抑郁症动物模型的研究进展 353
第七节 树鼩抑郁症动物模型研究现状及展望 355
一、树鼩抑郁症动物模型的研究现状 355
二、存在问题的分析与未来发展方向的展望 357
第二十章 树鼩与药物成瘾 363
第一节 药物成瘾及常用研究方法 363
第二节 树鼩的药物成瘾研究现状和初步结果 364
一、戒断症状 366
二、部分树鼩可建立纳洛酮催瘾所致条件化位置厌恶 367
三、结合相邻饲养检测树鼩是否形成吗啡条件化位置偏好 368
第三节 树鼩建立吗啡依赖模型的局限性 369
第二十一章 情绪相关精神疾患的树鼩模型 371
第一节 前言 371
第二节 抑郁症模型 372
一、社会挫败模型 373
二、习得性无助模型 375
三、慢性不可预见性温和应激模型 376
第三节 树鼩的药物成瘾模型 377
一、自我给药模型 377
二、条件位置偏爱模型 378
第四节 树鼩的创伤后应激障碍模型 379
第五节 慢性痛模型 381
第六节 树鼩的攻击行为 382
第七节 研究展望 382
第二十二章 树鼩病毒感染模型的研究 385
第一节 前言 385
第二节 乙型肝炎病毒树鼩感染模型的研究 385
一、乙型肝炎病毒 385
二、乙型肝炎病毒的树鼩原代肝细胞培养模型 388
三、乙型肝炎病毒的树鼩体内感染模型 389
第三节 丙型肝炎病毒树鼩感染模型的研究 391
一、丙型肝炎病毒 391
二、丙型肝炎病毒的原代树鼩肝细胞培养模型 392
三、丙型肝炎病毒的树鼩体内感染模型 393
四、与丙型肝炎病毒相关的树鼩基因组学研究 393
第四节 其它病毒树鼩感染模型的研究 393
第五节 结语与展望 394
第二十三章 树鼩细菌感染模型 399
第一节 细菌感染疾病及其动物模型 399
第二节 几种树鼩细菌感染模型的建立 401
一、树鼩生物材料细菌感染模型 401
二、树鼩皮肤烧伤金黄色葡萄球菌感染模型 402
三、模型特点及应用 404
四、免疫抑制的树鼩绿脓杆菌肺炎模型 404
五、树鼩盲肠结扎与穿孔导致的多种细菌感染模型 406
六、树鼩对细菌内毒素（LPS）的免疫反应 407
第三节 结语与展望 408
第二十四章 树鼩乳腺癌模型研究 411
第一节 动物模型在乳腺癌研究中的意义 411
一、乳腺癌的发生发展过程 411
二、乳腺癌动物模型类型 412
三、乳腺癌动物模型存在的困境 413
第二节 致癌剂DMBA联合MPA创建树鼩乳腺癌模型 414
一、研究背景 414
二、树鼩乳腺癌诱发过程 414
三、肿瘤组织的检测 416
四、基因突变分析 418
五、讨论 419
第三节 PyMT慢病毒诱导创建树鼩乳腺癌模型 420
一、研究背景 420
二、慢病毒诱导树鼩乳腺肿瘤过程 421
三、慢病毒诱导乳腺肿瘤病理检测 422
四、讨论 423
第二十五章 树鼩胶质母细胞瘤模型 427
第一节 胶质母细胞瘤概述 427
一、胶质母细胞瘤简介 427
二、人类胶质母细胞瘤的遗传学变异 428
三、人类胶质母细胞瘤组织病理学特征 428
四、胶质母细胞瘤治疗及前景 429
第二节 脑胶质瘤动物模型的研究及进展 430
一、非确定基因改变策略 430
二、确定基因改变策略 431
第三节 树鼩胶质母细胞瘤模型的研究 432
第四节 结语与展望 435
第二十六章 树鼩血栓疾病动物模型 438
第一节 血栓疾病研究概况 438
一、血栓概念及发病情况 438
二、血栓形成机制的研究 440
三、抗血栓药物研究情况 441
第二节 血栓疾病动物模型 442
一、人类疾病与动物模型 442
二、血栓疾病动物模型的研究情况 442
第三节 树鼩血栓模型 444
一、树鼩作为动物疾病模型的优势 444
二、树鼩颈部动静脉旁路血栓模型的构建 445
第四节 结语 447
第二十七章 树鼩代谢性疾病模型 451
第一节 树鼩糖尿病动物模型 451
一、树鼩自发糖尿病 452
二、树鼩1型糖尿病动物模型 453
三、树鼩2型糖尿病动物模型 453
第二节 树鼩非酒精性脂肪肝模型 458
一、高热量食物诱导的树鼩非酒精性脂肪肝 458
二、罗格列酮治疗树鼩非酒精性脂肪肝 460
第三节 树鼩动脉粥样硬化 461
第二十八章 利用树鼩精原干细胞建立转基因树鼩的尝试 465
第一节 前言 465
第二节 基因编辑的分子生物学技术简介 465
一、外源基因的随机插入 465
二、基因的定点编辑技术 465
第三节 进行稳定遗传基因编辑需要的细胞种类 467
一、在1-细胞胚胎中进行基因编辑 467
二、在多能干细胞中进行基因编辑 468
三、在雄性生殖干细胞中进行基因编辑 468
第四节 树鼩基因编辑的现状分析 468
第五节 利用精原干细胞建立转基因树鼩的初步尝试 469
一、树鼩睾丸细胞的分离及精原干细胞的体外培养尝试 469
二、树鼩精原干细胞的表面分子标记的筛选 471
三、白消安处理建立精原干细胞移植受体 471
第六节 结语与展望 474