第一章 肠道微生物组概论 1
第二章 宏组学在肠道微生组研究中的应用 19
第三章 肠道代谢组 26
第四章 微生物组在能量调节和新陈代谢中的作用 33
第五章 短链脂肪酸与人类健康和疾病 41
第六章 肠道定植菌对免疫系统的调节 53
第七章 肠道微生组与后抗生素时代 66
第八章 饮食、肠道微生态和人类健康 78
第九章 微生物与精准医疗 88
第十章 食管疾病与微生物组 94
第十一章 炎症性肠病与肠道微生物组 104
第十二章 肠易激综合征与肠道微生物组 115
第十三章 胃肠道恶性肿瘤与胃肠道微生物组 121
第十四章 肝脏疾病与肠道微生物组 133
第十五章 胆道疾病与肠道微生物组 153
第十六章 胰腺疾病与肠道微生物组 160
第十七章 从粪微生态移植到确定菌群治疗 171
第十八章 微生物组研究的实验设计 194
第十九章 微生物组研究进入联合时代 205
附录1 消化系统疾病相关部分微生物和寄生虫简介 209
附录2 常见细菌树状图 224