导论 1
参考文献 8
第一章 菌种分离与培养 9
实验1.1采样与保存 9
实验1.2非培养样品的分析 12
实验1.3变性梯度凝胶电泳 16
实验1.4目标菌株的富集 24
实验1.5目标菌株的分离纯化 27
实验1.6目标菌株的筛选 31
实验1.7厌氧菌的研究 35
实验1.8厌氧培养箱的使用 41
实验1.9疑似新种的确定 44
实验1.10菌株保藏 48
参考文献 51
第二章 表型分类特征 53
实验2.1革兰氏染色 54
实验2.2个体细胞特征 57
实验2.3群体菌落特征 64
实验2.4生长曲线 67
实验2.5生长温度 69
实验2.6生长pH 71
实验2.7耐受渗透压 74
实验2.8抗生素敏感性 76
实验2.9无氧呼吸的电子受体 80
实验2.10微量多项试验鉴定系统 84
参考文献 91
第三章 基因型分类特征 92
实验3.1基因组DNA的提取 92
实验3.2核酸DNA检测 95
实验3.3 16S rRNA基因的TA克隆 98
实验3.4质粒DNA的提取 101
实验3.5 16S rRNA基因测序及同源性分析 103
实验3.6系统发育特征 108
实验3.7 G+C含量的测定 113
实验3.8核酸DNA杂交 118
实验3.9亲缘关系分析 123
实验3.10芽孢基因的检测 126
实验3.11全基因组序列分析 129
参考文献 135
第四章 化学分类特征 138
实验4.1肽聚糖分析 139
实验4.2呼吸醌分析 146
实验4.3脂肪酸分析 151
实验4.4极性脂分析 158
实验4.5多胺分析 170
参考文献 172
第五章 菌种命名与发表 173
实验5.1系统分类与发育树 176
实验5.2多相分类研究 185
实验5.3菌种的命名 188
实验5.4菌种的公共保藏 191
实验5.5新菌种的发表 193
参考文献 194
附录 中英文名词和缩写 196