第1章 表观遗传修饰 1
1.1 DNA甲基化 1
1.1.1 DNA甲基化特征 1
1.1.2 DNA甲基转移酶的分类 2
1.1.3 DNA甲基化的作用 2
1.2 组蛋白乙酰化 3
1.3 DNA甲基化和组蛋白乙酰化共同作用调节基因的表达 3
参考文献 4
第2章 组蛋白乙酰基转移酶 5
2.1 细胞内分布 5
2.2 分类 6
2.2.1 GNAT家族 6
2.2.2 MYST家族 7
2.2.3 CBP家族 7
2.2.4 TAFII250家族 8
2.3 底物特异性 8
2.3.1 组蛋白底物 9
2.3.2 非组蛋白底物 10
2.4 生物学功能 10
2.4.1 在生长发育中的功能 10
2.4.2 在胁迫应答反应中的功能 11
参考文献 13
第3章 动物组蛋白去乙酰化酶 15
3.1 分类 15
3.2 结构域 16
3.3 亚细胞定位 17
3.4 蛋白质结构 18
3.5 作用机制 19
3.6 生物学功能 20
3.6.1 与癌症形成和发展的关系 20
3.6.2 与神经系统疾病的关系 22
3.6.3 与代谢的关系 22
参考文献 23
第4章 植物组蛋白去乙酰化酶 25
4.1 分类 25
4.1.1 RPD3/HDA1亚家族 26
4.1.2 HD2亚家族 26
4.1.3 SIR2亚家族 26
4.2 底物特异性 27
4.3 亚细胞定位 28
4.4 表达模式 29
4.4.1 在不同组织中的表达 29
4.4.2 在胁迫条件下的表达 30
4.5 生物学功能 31
4.5.1 在植物生长和发育中的功能 32
4.5.2 在胁迫应答反应中的功能 34
4.5.3 在基因沉默中的功能 37
4.5.4 其他功能 38
4.6 总结 38
参考文献 39
第5章 毛果杨组蛋白去乙酰化酶 44
5.1 毛果杨HDAC的序列分析 44
5.1.1 系统进化树构建 44
5.1.2 一级结构与理化性质分析 44
5.1.3 跨膜区和二级结构分析 49
5.1.4 结构域分析 52
5.1.5 亚细胞定位分析 52
5.1.6 三级结构预测 54
5.1.7 讨论与结论 55
5.1.8 材料和方法 56
5.2 毛果杨HDAC的表达分析 57
5.2.1 HDAC在不同器官的表达 58
5.2.2 HDAC在低温胁迫下的表达 59
5.2.3 HDAC在盐胁迫下的表达 59
5.2.4 HDAC在ABA处理下的表达 62
5.2.5 讨论与结论 62
5.2.6 材料和方法 63
5.3 毛果杨HDAC基因的克隆及亚细胞定位 64
5.3.1 毛果杨HDA901基因的克隆和亚细胞定位 64
5.3.2 毛果杨HDA902基因的克隆和亚细胞定位 71
5.4 毛果杨HDAC的功能 78
5.4.1 HDAC在杨树根发育过程中的功能 78
5.4.2 HDAC在毛果杨不定芽再生中的功能 98
参考文献 100
编后记 105