引言 1
1 普通生物学基础知识 2
1.1 细胞结构 2
1.2 细胞的遗传物质 2
1.2.1 染色质 2
1.2.2 染色体 3
1.2.3 线粒体 3
1.3 DNA分子结构 4
1.4 DNA复制 6
1.5 DNA变性与复性 6
1.6 基因 等位基因与基因突变 7
1.7 基因库 基因文库 cDNA文库 8
1.8 遗传学三定律 9
1.8.1 孟德尔第一定律——分离律 9
1.8.2 孟德尔第二定律——自由组合律 11
1.8.3 连锁和交换定律 11
主要参考文献 12
2 DNA多态性检验 13
2.1 DNA多态性分类 13
2.1.1 DNA长度多态性 13
2.1.2 DNA序列多态性 14
2.2 DNA多态性原理 14
2.2.1 DNA指纹及单位点图谱 16
2.2.2 VNTR STR 16
2.3 几个重要概念 17
2.3.1 核心序列 17
2.3.2 重复单位 重复次数 17
2.3.3 DNA探针 18
2.3.4 限制性内切酶 18
2.3.5 基因组 20
2.3.6 表现型 基因型 21
2.3.7 有丝分裂 减数分裂 21
2.3.8 斑点印迹 Southern印迹 真空转移 分子杂交 22
2.4 PCR技术 22
2.4.1 PCR反应基本原理 23
2.4.2 PCR反应体系 24
2.4.2.1 寡核苷酸引物 24
2.4.2.2 PCR缓冲液 26
2.4.2.3 脱氧核苷三磷酸 27
2.4.2.4 靶序列 27
2.4.2.5 DNA聚合酶 27
2.4.2.6 其它成份 28
2.4.3 PCR扩增条件 29
2.4.4 PCR抑制剂 29
2.4.5 减少PCR污染的因素 29
2.5 DNA多态性的电泳检测 30
2.5.1 琼脂糖凝胶电泳 31
2.5.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳 31
2.5.2.1 单链构象多态性 33
2.5.3 毛细管电泳 33
2.5.4 电泳加样液及槽缓冲液 胶缓冲液 34
2.5.5 玻璃制品硅化处理 35
2.6 DNA多态性检验策略 35
主要参考文献 37
3 法医DNA检验常用数据计算 38
3.1 单位点基础数据计算 38
3.1.1 基因频率 38
3.1.2 基因型频率 39
3.1.3 Pm 40
3.1.4 Dp 41
3.1.5 Pc 41
3.1.6 H 42
3.1.7 PIC 43
3.1.8 PE 44
3.1.9 突变率 44
3.2 DNA指纹数据计算 45
3.2.1 DNA指纹基础数据计算 45
3.2.2 DNA指纹同一性概率计算 47
3.3 亲子鉴定计算 49
3.3.1 PI 49
3.3.1.1 三联体PI计算 50
3.3.1.2 无父时PI计算 52
3.3.1.3 二联体（单亲亲子鉴定）PI计算 52
3.3.1.4 父母均不确定时PI计算 53
3.3.2 RCP 54
3.3.2.1 DNA指纹RCP计算 54
3.3.3 亲子鉴定结论分析 54
3.4 HWE检验 55
3.4.1 HWE内容 55
3.4.2 HWE法医应用 56
3.4.3 HWE显著性差异原因 57
3.5 人群比较检验 58
3.6 位点间独立性检验 61
主要参考文献 62
4 DNA染色及标记技术 65
4.1 溴化乙锭染色 65
4.2 银染色 65
4.3 同位素标记探针 66
4.4 非同位素标记探针 67
4.4.1 辣根过氧化物酶标记探针 67
4.4.2 地高辛 荧光物质及生物素标记探针或核苷酸 68
主要参考文献 69
5 生物检材DNA提取 70
5.1 有机法提取DNA 70
5.2 Chelex100法提取DNA 72
5.3 盐析法提取DNA 73
5.4 DNA提取中蛋白水解酶K及SDS EDTA作用 73
5.5 不同生物检材DNA提取 74
5.5.1 血液（斑）DNA提取 74
5.5.1.1 有机法 74
5.5.1.2 Chelex100法 75
5.5.1.3 盐析法 75
5.5.1.4 血斑DNA提取方法比较 76
5.5.2 二步法提取混合斑中精子DNA 77
5.5.2.1 精子的特性 77
5.5.2.2 二步法 77
5.5.2.3 几种不同二步法 77
5.5.3 软组织DNA提取 80
5.5.4 甲醛固定组织DNA提取 81
5.5.5 石腊包埋组织DNA提取 82
5.5.6 烟头及口腔上皮细胞DNA提取 83
5.5.7 骨骼DNA提取 84
5.5.7.1 骨骼DNA含量 84
5.5.7.2 不脱钙法提取骨骼DNA 84
5.5.7.3 脱钙法提取骨骼DNA 85
5.5.7.4 骨髓DNA提取 86
5.5.8 牙齿DNA提取 86
5.5.9 毛发DNA提取 87
5.5.9.1 毛根DNA提取 87
5.5.9.2 毛干DNA提取 88
5.5.10 指甲DNA提取 90
5.5.11 尿液DNA提取 90
5.5.12 生物检材DNA提取注意事项 91
5.6 DNA浓缩纯化 92
5.7 已扩增DNA的再利用 92
5.8 生物检材提取 送检及保存 93
主要参考文献 94
6 人DNA定量及种属检验 97
6.1 常规DNA定量方法 97
6.1.1 溴化乙锭——标准DNA浓度比较法 97
6.1.2 琼脂糖电泳 98
6.1.3 紫外分光光度计及毛细管电泳 98
6.2 D17Z1位点DNA定量及种属检验 99
6.2.1 D17Z1结构 99
6.2.2 D17Z1检验方法 99
6.2.2.1 Waye法 99
6.2.2.2 Walsh法 100
6.2.2.3 Gaensslen PCR法 102
6.3 Alu位点人DNA种属检验 103
6.3.1 Tyler法 103
6.3.2 Tamaki法 104
6.4 pH12及pH21探针检验人及灵长目DNA种属 105
6.5 28SrRNA基因人DNA种属检验 106
6.6 SON基因3'UTR检验人DNA种属 108
6.7 扩增ABO基因酶解法检验人及动物DNA种属 109
6.8 apoB人及灵长目DNA种属检验 110
6.9 线粒体DNA种属检验 110
6.9.1 复合扩增线粒体细胞色素b（cytb）及D环区序列检验人DNA 111
6.9.2 线粒体120bp扩增片段检验人DNA种属 111
6.10 STR位点人DNA种属检验 112
主要参考文献 115
7 DNA指纹检验 117
7.1 33.15 33.5及33.6探针DNA指纹图 118
7.1.1 探针结构 118
7.1.2 试剂配制 118
7.1.3 检验方法 119
7.2 HRP标记α-珠蛋白-3'HVR探针DNA指纹图 121
7.2.1 试剂配制 121
7.2.2 检验方法 122
7.3 常用多位点探针DNA指纹图基础数据 123
7.4 DNA指纹检验优缺点 124
主要参考文献 125
8 单位点图谱及VNTR位点检验 126
8.1 SLP与PCR检验VNTR位点比较 126
8.2 单位点图谱检验 127
8.2.1 试剂配制 128
8.2.2 检验方法 128
8.3 PCR-VNTR位点检验 130
8.3.1 D1S80 130
8.3.1.1 D1S80 Budowle经典检验法 130
8.3.1.2 D1S80其它检验方法 131
8.3.1.3 D1S80序列多态性 133
8.3.2 apoB 133
8.3.2.1 琼脂糖电泳检验 133
8.3.2.2 PAGE检测 134
8.3.3 D17S30 134
8.3.4 p33.6 135
8.3.5 p33.4 136
主要参考文献 137
9 MVR检验 140
9.1 MVR检验原理 140
9.2 MVR检验优缺点 141
9.3 MS32及MS31A MVR检验 143
9.3.1 探针杂交法 143
9.3.2 琼脂糖电泳EB染色法 146
9.3.3 PAGE法 146
9.4 MS32及MS31A同步检验 146
主要参考文献 147
10 STR检验 148
10.1 概述 148
10.1.1 STR等位基因构成 148
10.1.2 STR等位基因命名原则 149
10.1.3 STR分类 149
10.1.4 理想STR条件 150
10.1.5 新建STR位点的评估内容 151
10.1.6 实际办案STR位点选择 151
10.1.7 STR优点 152
10.1.8 STR缺点 152
10.1.9 STR检验检材基质对照的必要性 153
10.1.10 Stutter谱带假设 153
10.1.11 n+1谱带 154
10.2 不同STR位点检验 155
10.2.1 ACTBP2 155
10.2.2 CD4 159
10.2.3 CSF1PO 161
10.2.4 CYAR04 163
10.2.5 DHFRP2 164
10.2.6 F13A 165
10.2.7 FA31(C) 167
10.2.8 FABP 168
10.2.9 F13B 169
10.2.10 FES 171
10.2.11 FGA 173
10.2.12 FOLP23 176
10.2.13 GAB 177
10.2.14 LPL 178
10.2.15 PLA2A 179
10.2.16 TH01 180
10.2.17 TPOX 181
10.2.18 VWA 182
10.2.19 VWFⅢ 183
10.2.20 D6S366 184
10.2.21 D7S820 185
10.2.22 D8S384 187
10.2.23 D8S1179 187
10.2.24 D12S375 189
10.2.25 D12S391 190
10.2.26 D13S317 193
10.2.27 D16S539 193
10.2.28 D19S253 194
10.2.29 D19S400 195
10.2.30 D20S161 197
10.2.31 D21S11 197
10.2.32 23个STR位点基础数据 199
10.3 复合扩增 202
10.3.1 复合扩增优点 203
10.3.2 复合扩增缺点 203
主要参考文献 204
11 性染色体STR检验 207
11.1 Y STR检验 207
11.1.1 Y染色体结构 207
11.1.2 Y STR特点 207
11.1.3 DYS19 209
11.1.4 DYS288 210
11.1.5 DYS385 210
11.1.6 DYS388 211
11.1.7 DYS389 212
11.1.8 DYS390 213
11.1.9 DYS391 DYS392 DYS393 213
11.1.10 YCAⅠ YCAⅡ YCAⅢ 214
11.1.11 DXYS156Y 215
11.1.12 法医实用的Y STR位点 216
11.2 X STR检验 221
11.2.1 ARA 221
11.2.2 HPRTB 222
主要参考文献 224
12 线粒体DNA序列多态性 225
12.1 线粒体DNA结构 225
12.2 线粒体DNA特点 225
12.3 线粒体DNA序列多态性及基因型 226
12.4 线粒体DNA异质性 227
12.5 线粒体DNA测序原理 227
12.6 线粒体DNA测序方法 228
12.6.1 线粒体DNA测序引物序列 230
12.6.2 线粒体DNA两次PCR扩增测序 231
12.6.3 线粒体DNA一次PCR扩增测序 237
12.7 防止线粒体DNA测序污染方法 241
12.8 线粒体DNA测序的缺点 242
12.9 线粒体DNA序列多态性其它检验方法 242
12.10 线粒体DNA长度多态性 244
主要参考文献 245
13 HLA及PM检验 246
13.1 HLA检验 246
13.1.1 HLA DQα检验 247
13.1.1.1 反向斑点印迹法 248
13.1.1.2 斑点印迹法 251
13.1.1.3 PCR-RFLP检验 252
13.1.2 HLA-A检验 252
13.1.3 HLA DRB检验 253
13.1.3.1 PCR-SSCP法 253
13.1.3.2 SSP法 254
13.1.3.3 PCR-SSO法 254
13.2 PM检验 255
主要参考文献 258
14 ABO MN基因型检验 260
14.1 ABO基因型检验 260
14.1.1 KpnⅠ及AluⅠ内切酶分型 261
14.1.1.1 综合分析二个泳道结果判定ABO基因型 261
14.1.1.2 一个泳道内判定ABO基因型 262
14.1.2 KpnⅠ及MspⅠ内切酶分型 264
14.1.3 ABO基因型其它检验方法 265
14.1.4 ABO基因型检验优点 266
14.2 MN基因型检验 266
主要参考文献 268
15 多态性酶基因型检验 269
15.1 GPT基因型 269
15.2 ADA基因型 271
15.2.1 PCR+RFLP 271
15.2.2 ADA-STR位点检验 272
15.3 PGM1基因型 273
15.3.1 PCR+RFLP 274
15.3.2 SSCP 275
15.4 EsD基因型 276
15.5 DNaseⅠ基因型 277
主要参考文献 279
16 性别检验 280
16.1 DNA性别检验分类 280
16.2 Amelogenin基因检验 281
主要参考文献 283
17 Ladder制备 284
17.1 Ladder一般制备方法 284
17.2 从琼脂糖凝胶电泳中回收DNA片段 285
17.2.1 DEAE-纤维素膜琼脂糖电泳回收DNA片段 285
17.2.2 低熔点琼脂糖电泳回收DNA片段 285
17.2.3 从琼脂糖凝胶中回收DNA的纯化 286
17.2.3.1 DEAE-Sephacel柱层析法 286
17.2.3.2 有机溶剂抽提法 286
17.3 从PAGE中回收DNA片段 287
17.3.1 压碎浸泡法回收DNA片段 287
17.3.2 高盐溶液回收DNA片段 289
17.4 几种VNTR及STR位点Ladder制备方法 289
17.4.1 D1S80 Ladder制备 289
17.4.2 SE33 Ladder制备 291
17.4.3 VWA TH01 D21S11 HPRTB Ladder制备 291
主要参考文献 293
18 法医DNA检验发展趋势 294
18.1 建立DNA数据库 294
18.2 混合样品检验 295
18.3 DNA芯片技术在法医检验中的开发应用 295
18.4 人类基因组计划对法医DNA检验的影响 296
18.5 酶型血清型检验 296
主要参考文献 297
附录1 常用单位换算公式 298
附录2 本书中所用缓冲液 300
附录3 简明X2数值表 306