第一卷 序例上 1
《神农本经》名例 1
历代诸家本草 5
引据古今医家书目 12
引据古今经史百家书目 16
陶隐居《名医别录》合药分剂法则 22
七方 23
采集诸家本草药品总数 25
四时用药例 26
十剂 26
五味宜忌 30
五味偏胜 31
五脏五味补泻 31
脏腑虚实标本用药式 32
六腑六脏用药气味补泻 35
第二卷 序例下 36
相反诸药 36
服药食忌 36
妊娠禁忌 36
饮食禁忌 36
药名同异 37
李东垣随症用药凡例 40
陈藏器诸虚用药凡例 42
《神农本草经》目录 42
《宋·本草》旧目录 43
病有八要六失六不治 44
《药对》岁物药品 44
第三卷 主治药上 44
心下痞满 44
项强 45
癫痫 45
暑 47
火热 47
脾胃 49
反胃 51
呕吐 53
泄泻 54
肺痿肺痈 55
疟 56
黄疸 58
咳嗽 60
寒热 63
齿衄 64
血汗 64
小便血 64
咳嗽血 66
不眠 66
多眠 67
大便燥结 67
消渴 68
遗精梦泄 70
阴痿 71
脱肛 73
痔漏 74
淤血 75
肠鸣 76
腰痛 76
第四卷 主治药下 78
头痛 78
眩晕 80
耳 81
面 83
鼻 86
音声 88
牙齿 89
疬疡癜风 92
唇 93
口舌 94
咽喉 97
跌扑折伤 99
五绝 102
胎前 102
产难 104
产后 106
阴病 108
妇人经水 109
第五卷 水部 111
诸水有毒 111
雨水 111
甘露 112
盐胆水 112
第六卷 火部 112
芦火、竹火 112
桑柴火 112
炭火 112
灯火 113
神针火 113
阳火、阴火 114
第七卷 土部 115
黄土 115
田中泥 116
井底泥 116
烟胶 116
香炉灰 116
赤土 116
第八卷 金石部 116
铁 116
铜矿石 117
铅 118
铁锈 119
金 119
银 121
第九卷 石部（一） 123
水银 123
雄黄 125
石膏 128
石炭 131
石灰 131
第十卷 石部（二） 134
石蟹 134
金刚石 134
磁石 134
河砂 136
第十一卷 石部（三） 136
食盐 136
卤碱 139
蓬砂 140
矾石 141
第十二卷 草部（一） 144
甘草 144
人参 147
天麻 153
白头翁 155
三七 156
锁阳 156
第十三卷 草部（二） 157
黄连 157
黄芩 160
防风 163
贝母 164
水仙 165
第十四卷 草部（三） 166
当归 166
芍药 168
益智子 170
薄荷 171
第十五卷 草部（四） 172
菊 172
青蒿 174
鸡冠 175
第十六卷 草部（五） 176
地黄 176
麦门冬 181
葵 182
水英 184
迎春花 184
第十七卷 草部（六） 185
大黄 185
狼牙 188
荨麻 189
第十八卷 草部（七） 189
月季花 189
何首乌 190
白英 192
木莲 192
第十九卷 草部（八） 193
蔛草 193
羊蹄 194
水藻 195
海藻 195
海带 196
泽泻 196
第二十卷 草部（九） 198
石斛 198
金星草 198
仙人掌草 199
第二十一卷 草部（十） 199
井中苔及萍蓝 199
船底苔 199
地衣草 199
桑花 200
干苔 200
第二十二卷 谷部（一） 201
稻 201
大麦 203
荞麦 204
小麦 205
第二十三卷 谷部（二） 208
稷 208
粟 209
稗 211
第二十四卷 谷部（三） 211
大豆 211
蚕豆 214
黄大豆 215
绿豆 215
豌豆 217
第二十五卷 谷部（四） 218
豆黄 218
豆腐 218
饭 219
粥 219
糕 223
酱 223
醋 224
第二十六卷 菜部（一） 226
韭 226
葱 228
蒜 231
生姜 233
胡萝卜 235
白花菜 236
第二十七卷 菜部（二） 236
荠 236
苦菜 237
黄瓜菜 238
蕨 238
薇 239
甘薯 239
芋 239
第二十八卷 菜部（三） 240
茄 240
冬瓜 242
苦瓜 244
紫菜 244
木耳 245
第二十九卷 果部（一） 247
李 247
杏 249
梅 252
桃 255
枣 261
第三十卷 果部（二） 263
山楂 263
橘 265
梨 269
柑 270
橙 271
柚 272
杨梅 273
樱桃 274
枇杷 274
银杏 275
胡桃 277
第三十一卷 果部（三） 279
荔枝 279
龙眼 281
橄榄 282
椰子 283
波萝蜜 284
无花果 284
第三十二卷 果部（四） 285
胡椒 285
第三十三卷 果部（五） 286
西瓜 286
葡萄 287
猕猴桃 288
甘蔗 289
诸果有毒 290
第三十四卷 木部（一） 290
柏 290
松 293
杉 296
丁香 296
樟脑 299
芦荟 299
第三十五卷 木部（二） 300
桐 300
柳 301
白杨 303
榆 303
第三十六卷 木部（三） 305
桑 305
酸枣 309
女贞 310
枸杞、地骨皮 311
木麻 314
第三十七卷 木部（四） 314
竹 314
河边木 318
第三十八卷 服器部 318
锦 318
麻鞋 318
布 319
绵 319
纸 319
锅盖 320
蒸笼 320
竹篮 320
鱼网 320
第三十九卷 虫部（一） 320
蜂蜜 320
蜜蜂 322
蚕 323
第四十卷 虫部（二） 326
蜻蛉 326
蛱蝶 327
蚁 327
第四十一卷 虫部（三） 327
乳虫 327
天牛 328
萤火 328
第四十二卷 虫部（四） 329
蛤蟆 329
蛙 330
蜈蚣 331
蚯蚓 332
蜗牛 334
第四十三卷 鳞部（一） 336
龙 336
蛤蚧 338
第四十四卷 鳞部（二） 339
鲤鱼 339
鲫鱼 341
鳝鱼 343
虾 344
鲍鱼 345
鱼脂 346
第四十五卷 介部（一） 346
水龟 346
鳖 348
第四十六卷 介部（二） 351
牡蛎 351
蚌 352
蛤蜊 353
海螺 354
第四十七卷 禽部（一） 355
鹤 355
鸧鸡 356
鹅 356
鵚鹜 358
第四十八卷 禽部（二） 358
鸡 358
雀 370
燕 372
第四十九卷 禽部（三） 373
乌鸦 373
驼鸟 374
鹰 374
诸鸟有毒 375
第五十卷 兽部（一） 376
狗 376
羊 380
牛 389
骡 397
诸肉有毒 397
解诸肉毒 397
第五十一卷 兽部（二） 398
狮 398
虎 398
豹 402
鹿 402
猫 408
第五十二卷 人部 410
发髲 410
爪甲 411
牙齿 411
妇人月水 412
人血 413
人精 413
人汗 414
眼泪 414
初生脐带 414