第一章 三亚珊瑚礁概况 1
第一节 自然地理概况 1
第二节 社会经济概况 2
第三节 三亚珊瑚礁国家级自然保护区简况 4
第四节 三亚珊瑚礁海洋环境概况 5
第二章 三亚珊瑚礁生物多样性调查研究历史、内容与方法 9
第一节 我国三亚海域造礁石珊瑚研究的历史背景 9
第二节 2006年三亚珊瑚礁生物多样性的现状调查 10
第三章 三亚珊瑚礁的生物多样性 18
第一节 珊瑚礁生物多样性现状信息 18
第二节 其他礁栖生物的多样性 25
第三节 生物多样性现状小结 31
第四章 生物多样性热点分析 32
第一节 生物多样性热点的现状 32
第二节 生物多样性热点的变化 38
第五章 三亚珊瑚礁存在的问题与对策 42
第一节 生物多样性现状信息反映的问题 42
第二节 生物多样性现状调查主要结果与局限性 42
第三节 三亚珊瑚礁区主要利益相关者的知识和认知水平改变情况的调查 45
第六章 三亚珊瑚礁自然保护区珊瑚礁监测与管理 56
第一节 三亚珊瑚礁自然保护区生物多样性长期监测简易规程与方案 56
第二节 三亚珊瑚礁地理信息系统（GIS）与数据库建设 72
附录 87
附录1 2006年三亚现状调查造礁石珊瑚详细的种类和站位分布 87
附录2 2006年三亚现状调查浮游植物种类和站位分布 91
附录3 2006年三亚现状调查浮游动物种类和站位分布 96
附录4 2006年三亚现状调查珊瑚礁鱼类种类和站位分布 99
附录5 三亚国家级珊瑚礁自然保护区调查问卷 103
参考文献 105