一、变化中的生物学 1
理性背景 1
古代 2
亚里斯多德 8
基督教的世界观 14
文艺复兴 19
笛卡尔 23
多样性的发现 28
自然神学 33
生命与发生 37
启蒙运动与生物学 39
巴黎——从布丰到居维叶 41
17世纪到19世纪科学的兴起 44
科学出版物 46
19世纪生物学的分裂 48
生理学进入成年期 50
达尔文主义 53
二十世纪的生物学 60
动物行为学和生态学 60
分子生物学的崛起 63
生物学史上的主要时代 68
生物学和哲学 72
现代生物学 78
二、宏观分类学，分类科学 81
多样性的范围 82
化石 91
系统学，多样性科学 93
系统学的结构 100
鉴定与分类 103
分类的作用 104
亚里斯多德 106
古代人和草药医生的植物分类 114
草药医生的分类 117
逻辑分类的下行分类 120
瑞与悌宇列弗 126
林奈以前的动物学家 133
林奈 142
林奈和高级阶元 146
属 149
林奈提出的性系统 152
布丰 156
动物分类学的复苏 160
居维叶利性状相关（correlation of characters） 161
拉马克 163
分类学性状 165
多性状分类单位（多征单位，Polythetic Taxa） 171
按经验归类的上行分类（UpwardClassification By Empirical Grouping） 172
阿丹森和多重性状的应用 178
过渡时期（1758—1859） 181
探索自祛系统（The search for a Natural system） 185
自然（界）阶梯 189
相似与同功（Affinity and Analogy） 191
实用主义与等级结构论 194
等级结构分类（Hierarchical classlfications） 197
高级阶元和分类单位的真实性 199
三、按照共同祖先分类 202
相似性（Affinity）的涵义 210
恢复连续性 211
宏观分类学的衰微 215
迫切需要新的分类方法 220
数值分类（Numerical phenetics） 222
支序分类（Cladistics） 229
支序分析 232
支序分类 236
传统的或进化分类方法 241
新的分类学性状 244
分类的认识论 249
信息检索的简易化 251
等级 251
分类单位的大小 252
对称性 254
顺序 255
系统学的现状与未来 257
多样性研究 260
四、微观分类学，关于物种的科学 268
物种分类单位与物种阶元（Species Taxon and SpeciesCategory） 271
早期的物种概念 273
本质论者的物种概念 276
林奈 279
布丰 283
唯名论的物种概念 288
达尔文的物种概念 291
生物学物种概念的萌芽 298
生物学（物）种的性质 303
新系统学 308
生物学物种概念的有效性 313
形态学的类似性（similarity；或同一性，identity） 316
边际状况或端始种 319
单亲繁殖（无性状态） 319
隔离机制的泄漏（杂交） 321
生物学物种概念在多因次（多维）物种分类单位中的运用 324
空间因次中的变异 326
种下阶元 327
多型种分类单位（polytypic species taxa） 330
时间因次中的变异 334
物种在生物学中的重要意义 339