第一部分 生物信息学理论及网络指南第一章 引言 1
1．生物信息学概念 1
2．生物分子信息 2
3．生物信息学主要研究内容 5
第二章 生物信息学数据库 17
1．三大数据库 18
2．EMBL简介 19
3．DDBJ简介 22
4．NCBI简介 24
第三章 PubMed使用指南 39
1．PubMed界面介绍 39
2．PubMed检索规则 41
3．MeSH检索 53
第四章 同源性比对－BLAST 57
1．BLAST的定义 58
2．BLAST的种类 59
3．核酸数据库比对 61
4．蛋白质数据库比对 68
第五章 蛋白质数据库检索 73
1．PIR简介 73
2．SWISS-PROT蛋白质序列数据库 84
3．TrEMBL蛋白质序列数据库 87
4．GOA集大成者-UniProt 92
第六章 基因组数据库 100
1．基因组数据库简介 100
2．Ensembl检索实例 104
第二部分 生物信息学软件的使用说明第七章 PCR引物设计 124
1．PCR引物设计原则 124
2．Primer Premier 5.0使用简介 127
3．Oligo 6.0使用简介 139
4．Primer 3使用简介 150
第八章 凝胶图像分析 154
1．凝胶图像分析原理 154
2．Gel-Pro使用简介 155
第九章 载体绘制 168
1．载体的分类和特点 168
2．绘制载体工具 170
3．Winplas使用简介 172
4．BVTech Plasmid使用简介 180
5．SimVector使用简介 187
6．质粒序列和图谱的查询 196
第十章 蛋白质的结构功能分析 197
1．序列编辑 198
2．工具栏与基本功能 199
3．ANTHEPROT 5.2分析实例 200
第十一章 多重序列比对分析 210
1．多重序列分析 210
2．ClustalX使用简介 212
第十二章 序列综合分析软件介绍 220
1．DNAMAN使用简介 220
2．CLC Sequence Viewer使用简介 246