1 基因体 1
1.1 遗传的分子基础 2
1.2 基因体序列复杂性 12
1.3 基因与基因家族 15
1.4 染色体 17
1.5 基因体 18
2 遗传图谱绘制 21
2.1 遗传图谱与物理图谱 22
2.2 遗传作图标记 23
2.3 遗传作图的方法 26
2.4 人类遗传图谱 36
3 物理图谱绘制 39
3.1 限制酶作图 40
3.2 基于选殖的基因体作图 44
3.3 萤光原位杂交 49
3.4 序列标签位点(STS)作图 50
3.5 人类基因体物理图谱 55
4 基因体定序与序列组装 59
4.1 DNA定序的方法学 60
4.2 DNA序列的组装 67
4.3 基因体定序的其他方法 72
4.4 人类基因体的定序与组装 73
5 基因体序列诠释 79
5.1 搜寻基因 80
5.2 基因功能预测 83
5.3 从基因体到细胞 94
6 基因体解剖 101
6.1 真核生物基因体解剖 102
6.2 原核生物基因体解剖 110
6.3 转座子与分散重复序列 113
6.4 串接重复序列及其分布 118
6.5 人类基因体草图序列中的合成基因 119
6.6 阿拉伯芥基因体合成基因 121
7 基因的转录调控 127
7.1 原核生物基因的转录 128
7.2 真核生物基因的转录 133
7.3 古生细菌基因的表现调控 145
7.4 DNA结合蛋白在基因转录调控中的作用 146
8 RNA的修饰与加工 155
8.1 细胞中的RNA组成分 156
8.2 mRNA的加工 157
8.3 非合成蛋白质之RNA的加工 170
8.4 RNA前体内部的化学修饰与加工 174
8.5 RNA干扰 178
9 蛋白质体 181
9.1 tRNA在蛋白质合成中的作用 182
9.2 蛋白质合成中核醣体的作用 186
9.3 蛋白质转译后加工 193
9.4 蛋白质周转 197
10 染色质结构与基因表现 205
10.1 核体的结构与基因表现 206
10.2 位置效应 210
10.3 后生遗传与基因表现 214
10.4 基因表现与染色质重建 221
11 基因体的复制 229
11.1 DNA复制的问题 230
11.2 原核生物基因体的复制 232
11.3 真核生物核基因体的复制 238
11.4 胞器基因体的复制 247
11.5 基因体复制的调控 249
12 基因体进化的分子基础 257
12.1 突变 258
12.2 重组 271
12.3 转座 278
13 基因体进化的模式 283
13.1 遗传系统的起源 284
13.2 新基因的产生 288
13.3 非合成序列的扩张 299
13.4 比较基因体学 304
14 基因体与生物进化 311
14.1 分子系统发生学 312
14.2 分子系统发生学与生物进化 316
14.3 生物新特征的产生 325
名词解释 333