1．——质谱在蛋白质组学中的应用 1
1．1现代质谱简介 2
1．1.1 电喷雾质谱（ESI-MS） 3
1．1.2基质辅助激光诱导解吸质谱 （MALDI-MS） 4
1．2质谱在小肽与蛋白质序列测定中的应用 5
1．2.1 离子在电离或飞行中碎裂 5
1．2.2 肽和蛋白质的质谱梯状测序法 13
1．3质谱在蛋白质组学研究中的其他应用 15
2．——磷酰化氨基酸及磷酰化小肽的质谱研究 23
2．1磷酰化氨基酸及小肽的FAB-MS研究 24
2．1.1 磷酰化氨基酸的FAB-MS正、负离子裂解规律研究 24
2．1.2磷酰化小肽的FAB-MS裂解规律研究 25
2．2磷酰化氨基酸的ESI-MS裂解规律研究 26
2．2.1 磷酰化氨基酸的ESI-MS正离子裂解规律研究 26
2．2.2磷酰化氨基酸的ESI-MS负离子裂解规律研究 28
2．2.3 磷酰化氨基酸的ESI-MS负离子裂解规律验证 31
2．2.4磷酰化氨基酸的ESI-MS加钠离子裂解规律及重排反应 35
2．3磷酰化小肽定向合成中序列的质谱分析 38
3．——肽类化合物的重排机制 42
3．1 二肽类似物在质谱中的重排反应及其机制研究 42
3．1.1 高分辨质谱研究 42
3．1.2 重排机制的提出 42
3．1.3重排反应机制证明 44
3．1.4小肽质谱中脱除45 u重排反应 48
3．2二异丙氧基磷酰化氨基酸的一种重排反应 53
3．3磷酰化二肽甲酯的一种重排反应 61
4．——磷试剂辅助下均肽库的构建及其电喷雾质谱分析 69
4．1磷与肽库 69
4．1.1 均肽库的构建 69
4．1.2非极性氨基酸与三氯氧磷的反应 70
4．2 ESI-MS与肽库分析 73
4．2.1 氨基酸均肽库产物分析 73
4．2.2均肽库的肽链裂解规律 75
4．3影响均肽库的因素 76
4．3.1 均肽长度与反应时间的关系研究 76
4．3.2 20种天然氨基酸与三氯氧磷的成肽反应总结 77
4．3.3 色谱对氨基酸转化率的分析 79
4．4极性氨基酸的成肽反应 80
4．4.1 苏氨酸的成肽反应 80
4．4.2组氨酸的成肽反应 80
4．4.3 甲硫氨酸、半胱氨酸及脯氨酸的成肽反应 81
5．——电喷雾质谱在研究非共价大分子复合物中的应用 87
5．1 引言 87
5．2.1 ESI质谱特点 88
5．2此领域早期重大事情 88
5．2.2 ESI质谱在研究非共价复合物的早期应用 89
5．2.3 ESI-TOF质谱的应用 91
5．3近来的应用 92
5．3.1 ESI-MS在研究多种相互作用中的应用 92
5．3.2 小分子与蛋白作用机制研究 92
5．4影响ESI-MS分析方法的因素 97
5．4.1 影响ESI-MS分析的溶液因素 97
5．4.2影响ESI-MS分析的仪器条件因素 97
5．5液相和气相ESI-M测量的关系 99
5．5.1 液相和气相ESI-MS测量的一致性 99
5．5.2液相和气相ESI-MS测量的差异性 100
5．6抗HIV前药与蛋白的非共价键复合物的ESI-MS研究 101
5．6.1 AZTPH和d4TPH与牛胰岛素的非共价键复合物的ESI-MS研究 101
5．6.2 CAZTPH和Id4TPH与溶菌酶的非共价键复合物的ESI-MS研究 104
5．6.3 蛋白与 AZT磷酰氨基酸类（CAZTAAOMe）非共价键复合物的ESI-MS研究 107
5．7未来前景 111
6．——液相色谱－质谱联用技术 120
6．1 氨基酸五配位磷化合物的竞争反应研究 121
6．1.1 氨基酸成肽反应的HPLC-MS定性分析 121
6．1.2氨基酸成肽反应的HPLC-MS定量分析 123
6．2 HPLC-ESI-MS/MS研究磷酰化苯丙氨酸的水解反应 124
6．2.1反应产物的HPLC-MS分析 124
6．2.2水解机制推测 125
6．3 HPLC-MS分析β－兴奋剂克伦特罗 127
6．3.1 条件的选择 127
6．3.2结果 127
7．——多胺酰胺类化合物及其相关衍生物的电喷雾质谱研究 131
7．1 N－甲基咪唑多胺酰胺类化合物结构的ESI-MS/MS分析 131
7．1.1 N－甲基咪唑多胺酰胺的质谱特征 133
7．1.2特异性异构产物结构鉴定 137
7．1.3结论 138
7．2 N－甲基咪唑聚酰胺肽缀合物合成反应的电喷雾质谱跟踪 139
7．2.1 合成程序 140
7．2.2酰胺成键反应的ESI-MS跟踪检测 141
7．2.3 酰胺成键反应产物的鉴定 143
7．2.4结论 148
7．3 N－甲基咪唑和吡咯类化合物的分子内氨基催化作用 148
7．3.1 N－甲基咪唑衍生物的质谱特征 150
7．3.2 N－甲基吡咯衍生物的质谱特征 152
7．3.3结论 153
8．——质谱在生命有机磷化学中的一些应用 158
8．1 五配位磷化合物的质谱研究 158
8．1.1 氨基酸五配位磷化合物的质谱研究 159
8．1.2氨基酸－核苷五配位磷化合物的质谱研究 162
8．2核苷氨基酸缀合物的电喷雾质谱研究 163
8．2.1 腺苷酸苯丙氨酸缀合物的正离子电喷雾质谱 164
8．2.2腺苷酸苯丙氨酸缀合物的负离子电喷雾质谱 166
8．3有机磷试剂辅助氨基酸成肽反应 167
8．3.1 自组装成肽产物正离子的FABMS分析 168
8．3.2 自组装成肽反应的机制研究 169
9．——质谱在定量分析中的应用 172
10．——氨基酸增敏效应及肽序列测定的新方法 180
10．1 DIPP磷酰化对氨基酸的增敏效应 180
10．1.1 磷酰化的增敏效应 180
10．1.2增敏效应的机制 183
10．1.3加氢与加钠二聚体碎裂一致性研究 192
10．1.4磷酰化丙丙二肽气相质子亲和能研究 196
10．1.5 总结及展望 199
10．2磷酰化对肽序列测定的影响 199
10．2.1 二异丙基亚磷酸酯DIPPH磷酰化多肽 200
10．2.2 二甲基亚磷酸酯DMPH磷酰化多肽 202
10．2.3 DMPH磷酰化法测定含赖氨酸肽序列 206
10．2.4 DMPH磷酰化肽的负离子碎裂研究 209
10．2.5总结及展望 209
10．3含有磷碳键的氮端磷酰化衍生——一种新的肽序列测定的衍生化方法 211
11．——电喷雾质谱及液质联用使用注意事项 218
11．1仪器的安装、准备与维护 218
11．1.1 仪器安装的环境准备 218
11．1.2维护注意事项 219
11．1.3仪器维护练习 220
11．2 电喷雾离子阱质谱使用注意事项 221
11．2.1进样注意事项 221
11．2.2维护注意事项 221
11．3 液相色谱质谱联用注意事项 222
索引 224
附录 227