卷一 医学溯源 1
养生 1
稽古 4
阴阳 17
水火 22
生克 31
运气 34
脏腑 48
经络 63
卷二 医学溯源 73
望色 73
聆音 75
辨脉 76
脚气 78
审证 99
治法 108
医则 120
病箴 129
卷三 伤寒提钩 135
伤寒 135
卷四 伤寒析疑 203
倒序 203
错简 205
传误 209
脱佚 213
衍文 217
字讹 220
注辨 225
方考 234
会通 241
问难 253
阙疑 271
卷五 杂证汇参 277
伤风 277
暑 280
湿 288
燥 296
温热 302
痧？ 322
疫 322
斑疹 342
卷六 杂证汇参 347
中风 347
类中 363
虚劳 367
血证 387
吐咳血 398
衄血 404
便血 408
溺血 412
卷七 杂证汇参 415
脾胃 415
饮食 421
噎隔反胃 429
呕吐 441
吞酸 448
呃 452
三消 456
嘈杂 463
关格 464
郁 470
疟 481
卷八 杂证汇参 481
肿胀 496
痞满 517
积聚 519
疸 526
霍乱 536
痧胀 540
卷九 杂证汇参 547
痢 547
泻 570
大便 577
小便 583
遗精 592
淋浊 599
阳痿 605
疝 608
脱肛 614
卷十 杂证汇参 617
痰 617
饮 627
咳嗽 631
喘 641
哮 648
？ 650
惊恐怔忡 653
健忘 657
不寐 659
癫狂病 665
厥 672
肝风 676
眩晕 678
汗 683
卷十一 杂证汇参 691
面 691
脑 693
须发眉 694
目 697
口 704
舌 707
齿 714
鼻 718
耳 723
咽喉 728
头痛 733
颈项强痛 739
肩背臂痛 740
心胃痛 742
腹痛 747
胁痛 753
腰腿痛 757
诸痛 761
痉 765
卷十二 杂证汇参 765
痿 773
痹 780
胸痹 792
肺痹 793
肺痿肺痈 794
诸虫 800
邪崇 807
诈病 810
补遗 812
卷十三 女科原旨 827
月经 827
求嗣 837
带下 840
崩漏 844
胎前 846
堕胎半产 865
临产 868
产后 874
杂病 895
卷十四 幼科集要 905
纲领 905
初生 917
胎证 919
杂病 929
痘科纲领 965
卷十五 痘疹精华 965
因期施治 983
证治要略 1007
馀义 1028
疹 1038
卷十六 方药备考 1047
方论 1047
药略 1092