《免疫信息学 计算机辅助预测免疫原性 典藏版》PDF下载

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  • 作  者:(英)D.R.弗劳尔主编;吴玉章译
  • 出 版 社:北京:科学出版社
  • 出版年份:2016
  • ISBN:9787030474872
  • 页数:279 页
图书介绍:应用生物技术大系和现代生命科学前沿系列图书分别被列为“十一五”和“十二五”国家重点图书出版规划项目。本丛书针对生命科学领域前沿重点发展方向以及应用生物技术领域的新成果、新思路、新方法和新技术,全面展示了其最新的发展动态,涵盖了其基础理论和主要技术方法,呈现了新的概念与理论、技术,在更深层次上阐明了生命的本质规律,给人们提供了新的认识生命本质的手段,也为生物技术服务于人类开辟了新的途径。涉及领域包括生物医药、干细胞技术、工业微生物学、蛋白质及蛋白质组、系统生物学、合成生物学、生物材料、农业生物技术、环境生物技术、海洋生物技术、生物资源与安全等领域。

1免疫信息学与计算机辅助预测免疫原性:导论 1

第1部分 数据库 10

2国际免疫遗传学信息系统(IMGT) 10

3IMGT/HLA数据库 27

4免疫多态性数据库:IPD 39

5T细胞表位查询和预测数据库:SYFPEITHI 49

6T细胞表位、MHC结合肽和TAP结合肽的搜寻及描图 61

7Bcipep数据库中B细胞表位的搜寻及描图 75

8半抗原、载体蛋白和抗半抗原抗体的检索 84

第2部分 HLA超型鉴定 95

9基于GRID/CPCA和层次聚类法的HLA超型分类 95

10HLA-A2超型的结构基础 104

11基于MHC结合肽库定义MHC超型 110

12基于肽结合凹槽静电分布图的HLA-I类等位基因分型 117

第3部分 肽与MHC结合能力的预测 123

13特征参数法预测MHC结合肽 123

14机器学习技术预测MHC结合肽 133

15人工智能方法预测T细胞表位 144

16小鼠MHC-多肽亲和力的预测 150

17 3D-QSAR模型预测MHC-多肽亲和力 164

18基于MHC分子模型预测表位肽 175

19基于支持向量机预测MHC结合肽 182

20应用SVRMHC方法预测多肽与MHC分子的结合亲和力 189

21基于结构及分子模拟预测HLA结合肽 195

22基于结构预测MHC结合肽操作指南 200

23MHC-Ⅰ及MHC-Ⅱ与肽结合的静态能分析 206

24分子动力学模拟 214

25一种预测MHC-Ⅱ类分子结合肽的迭代方法 229

26MHC-Ⅱ类分子结合肽综合预测方法 237

27基于贝叶斯神经网络的MHC-Ⅱ类分子-肽复合物非线性预测模型 244

第4部分 免疫系统其他特性的预测 253

28TAPPred法预测抗原中的TAP结合肽 253

29B细胞表位的预测方法 257

30一种MHC分子结构功能相似性分析平台:HistoCheck 263

31免疫相关性毒力因子的预测 271

索引 278