1免疫信息学与计算机辅助预测免疫原性:导论 1
第1部分 数据库 10
2国际免疫遗传学信息系统(IMGT) 10
3IMGT/HLA数据库 27
4免疫多态性数据库:IPD 39
5T细胞表位查询和预测数据库:SYFPEITHI 49
6T细胞表位、MHC结合肽和TAP结合肽的搜寻及描图 61
7Bcipep数据库中B细胞表位的搜寻及描图 75
8半抗原、载体蛋白和抗半抗原抗体的检索 84
第2部分 HLA超型鉴定 95
9基于GRID/CPCA和层次聚类法的HLA超型分类 95
10HLA-A2超型的结构基础 104
11基于MHC结合肽库定义MHC超型 110
12基于肽结合凹槽静电分布图的HLA-I类等位基因分型 117
第3部分 肽与MHC结合能力的预测 123
13特征参数法预测MHC结合肽 123
14机器学习技术预测MHC结合肽 133
15人工智能方法预测T细胞表位 144
16小鼠MHC-多肽亲和力的预测 150
17 3D-QSAR模型预测MHC-多肽亲和力 164
18基于MHC分子模型预测表位肽 175
19基于支持向量机预测MHC结合肽 182
20应用SVRMHC方法预测多肽与MHC分子的结合亲和力 189
21基于结构及分子模拟预测HLA结合肽 195
22基于结构预测MHC结合肽操作指南 200
23MHC-Ⅰ及MHC-Ⅱ与肽结合的静态能分析 206
24分子动力学模拟 214
25一种预测MHC-Ⅱ类分子结合肽的迭代方法 229
26MHC-Ⅱ类分子结合肽综合预测方法 237
27基于贝叶斯神经网络的MHC-Ⅱ类分子-肽复合物非线性预测模型 244
第4部分 免疫系统其他特性的预测 253
28TAPPred法预测抗原中的TAP结合肽 253
29B细胞表位的预测方法 257
30一种MHC分子结构功能相似性分析平台:HistoCheck 263
31免疫相关性毒力因子的预测 271
索引 278