第一章 绪论 1
参考文献 2
第二章 形态和生理遗传标记 3
第一节 毛色遗传标记 3
一、牛 3
二、水牛 4
三、猪 4
四、绵羊 5
五、山羊 5
六、马 6
七、犬 7
八、家禽的羽色遗传标记 7
第二节 形态遗传标记 10
一、牛 10
二、猪 10
三、绵羊 11
五、家禽 12
四、山羊 12
第三节 生理遗传标记 14
一、黄牛 14
二、家禽 15
三、猪的应激综合症 15
参考文献 15
第三章 染色体变异和染色体多态性 17
第一节 染色体变异 18
一、染色体数目变异 18
二、染色体的结构变异 19
三、正常个体的染色体畸变 21
第二节 染色体多态性 22
一、Ag—NORs多态性 22
二、Y染色体多态性 27
三、C带多态性 28
四、染色体多脆性位点 28
第三节 染色体多态性研究方法学 29
一、动物染色体的制备 29
二、染色体的分带技术 30
三、染色体分析方法 31
参考文献 32
第四章 血型 34
第一节 红细胞表面抗原类型 34
一、有关概念及类型的测定 34
二、牛 35
三、水牛 37
四、猪 38
五、绵羊和山羊 40
七、家禽 42
六、马 42
八、其它动物 45
第二节 白细胞抗原型 46
一、有关主要组织相容性复合体（MHC）的基础知识 46
二、牛 48
三、猪 52
四、绵羊和山羊 54
五、马 55
参考文献 56
六、家禽 56
第五章 蛋白质多态性 60
第一节 牛的蛋白质多态性 60
一、牛 60
二、水牛 67
第二节 猪的蛋白质多态性 68
第三节 绵羊和山羊的蛋白质多态性 71
一、绵羊 71
二、山羊 75
第四节 马的蛋白质多态性 76
第五节 家禽蛋白质多态性 80
一、家鸡 80
二、家鸭和番鸭 85
三、鹅 85
四、火鸡 86
五、日本鹌鹑 86
六、珠鸡 88
七、环颈雉 89
二、电泳分离 90
第六节 蛋白质多态性的测定方法 90
一、样本制备 90
三、染色 93
四、结果分析 93
五、应用 96
参考文献 96
一、RFLP及其在生物基因组中的存在 101
二、RFLP方法基本原理 101
第一节 限制性片段长度多态性 101
第六章 分子遗传标记 101
三、用异源探针进行的RFLP分析 102
第二节 畜禽的RFLP分析 114
一、畜禽主要组织相容性复合体Ⅱ类基因的RFLP 114
二、酪蛋白的RFLP 117
三、各种蛋白质的RFLP 118
四、一些重要质量性状的RFLP 118
第三节 重复序列变异 118
一、高变异小卫星和DNA指纹图 119
二、微卫星多态性 124
第四节 随机扩增多态性DNA（RAPD） 125
一、技术及原理 125
二、具体操作 125
三、遗传特点 126
四、应用 126
第五节 其他种类的DNA多态性 126
一、构像多态性 126
二、线粒体DNA（mt DNA）多态性 128
参考文献 129
第七章 群体变异与亲缘关系 133
第一节 遗传多样性 133
一、遗传标记与遗传多样性研究的历史 133
二、评价遗传多样性的统计方法 134
三、畜禽遗传多样性的研究 135
第二节 群体遗传结构与群体间关系 138
一、遗传多态性的概念 139
二、关于自然群体遗传变异的古典假说和平衡假说 139
三、分子水平遗传变异（遗传标记）维持机制——中性学说和选择学说 140
四、种群间遗传距离 141
五、畜禽种群遗传结构、变异及彼此间相互关系 142
第三节 亲缘关系确定 147
一、基本原理 147
二、排除亲子关系概率 148
三、亲子关系概率 149
四、畜禽的亲子鉴定 150
参考文献 153
第八章 基因定位与标记辅助选择 157
第一节 有关概念和方法 157
一、遗传图谱和物理图谱 157
二、遗传重组值定位 157
三、家系分析 157
四、细胞学定位 158
五、体细胞杂种定位 158
六、物理学定位 159
第二节 遗传图谱的构建 159
二、遗传图谱的构建 160
一、作图群体的建立 160
三、畜禽遗传图谱的构建 165
第三节 数量性状基因的定位 167
一、QTL定位的基本原理 167
二、遗传标记的编码 168
三、数据模式 168
四、点分析 168
五、区间分析 169
六、畜禽数量性状基因的定位 170
一、标记辅助选择（MAS）概述 171
第四节 标记辅助选择 171
二、标记辅助选择的原理 172
三、候选基因法 173
四、位置遗传分析法 174
五、标记辅助渗入 174
六、利用遗传标记操纵性状基因 175
七、遗传标记应用前景 175
参考文献 176
索引 178