南海朱先生墓表［1882年］ 1
致邓给谏铁香书［1883年12月］ 2
戒缠足会启［1883年］ 4
诰授荣禄大夫广西布政司护理巡抚康公事状［1884年12月3日］ 5
李青霞先生祠堂记［1884年］ 14
致赵砺隅书［1885年］ 15
教学通义［1885年］ 17
原教第一 20
备学第二 21
公学第三（上） 21
公学第三（中） 22
公学第三（下） 23
私学第四 24
国学第五 26
大学第六（上） 30
大学第六（下） 32
失官第七 33
亡学第八 35
六经第九 36
亡经第十 38
春秋第十一 39
立学第十二 40
从今第十三 44
尊朱第十四 45
幼学第十五 46
德行第十六 46
读法第十七 47
六艺（上）礼第十八 48
六艺（中）射御第十九 52
六艺（下）第二十 52
第二十一至二十七 53
敷教第二十八 53
言语第二十九 54
师保第三十 56
谏救第三十一 58
论幼学［1885年］ 59
石鳌苏氏族谱序［1886年前］ 61
民功篇［1886年］ 63
太昊帝庖牺氏 65
神农氏 69
黄帝 70
尧舜 77
禹 90
康子内外篇［1886年］ 95
阖辟篇 97
未济篇 99
理学篇 100
爱恶篇 100
性学篇 102
不忍篇 103
知言篇 104
湿热篇 105
觉识篇 105
人我篇 107
仁智篇 108
势祖篇 109
地势篇 109
理气篇 110
肇域篇 111
毛诗礼征［约1886年］ 113
特抄 115
授时 115
爵国 附：内官 116
州国 附：夷狄 117
田赋 附：徭役 征榷 国用 119
器械 119
宫室 121
章服 122
乐律 124
卜筮 126
耕桑 126
牧养 126
学校 127
五伦 附：夫妇 127
五伦 附：父子 128
五伦 附：老幼 128
五伦 附：君臣 128
五伦 附：朋友 129
宗族 附：姓字 129
内则 130
保傅 130
曲礼 130
养老 131
选举 附：谏净 致仕 131
昏 131
丧 133
祭 附：牺牲 迎气 133
天地 附：高禖 134
明堂 134
日月星辰 135
山川五祀 135
祈谷大雩 135
宗庙 136
禘祫 137
时享 137
荐新 137
乡 137
燕飨 附：饮食 赐予 137
射 138
聘 附：馈赠 139
朝 附：贡 139
会盟 139
巡守 139
吊唁 附：问疾 140
帝王 140
灾异 附：祥瑞 140
田猎 附：樵采 140
刑罚 附：讼狱 141
军旅 附：马政 141
万身公法书籍目录提要［约1888年前］ 143
实理公法全书［约1888年前］ 145
凡例 147
实字解 147
公字解 148
总论人类门 148
夫妇门 149
父母子女门 150
师弟门 151
君臣门 152
长幼门 153
朋友门 153
礼仪门 153
刑罚门 155
教事门 156
治事门 156
论人公法 附：论死节 论为道受苦 158
整齐地球书籍目录公论 159
公法会通［约1888年前］ 161
与洪右臣给谏书［1888年夏］ 162
与潘宫保伯寅书［1888年9月］ 163
论时务［1888年10月］ 164
与潘文勤书［1888年10月后］ 168
与徐荫轩尚书书［1888年10月后］ 171
钱币疏光绪年代作［1888年10、11月间］ 173
与幼博书［1888年11月］ 175
与曾劼刚书［1888年12月3日］ 176
报效一途急宜停止以存政体而遏乱源折 光绪十四年代屠侍御作［1888年12月7日］ 178
上清帝第一书［1888年12月10日］ 180
祭陈庆笙秀才文［1888年12月］ 185
与节闇太常书［1888年］ 186
与黄仲弢编修书［1888年］ 188
致盛伯羲祭酒书 戊子［1888年］ 189
与峄琴学士书［1888年］ 190
附：代潘侍读两浙观风文 192
笔记［1888年前后］ 193
请开清江浦铁路议 光绪十四年代作［1889年1月19日］ 220
祭张延秋侍御文［1889年1月30日］ 224
为宗社严重国势忧危乞赐面对以竭愚诚折 光绪十四年代屠侍御作［1889年1月］ 225
门灾告警请行实政而答天戒折 代屠侍御作［1889年1月］ 227
请醇亲王归政折 代屠仁守作［1889年1月］ 231
致曾劼刚袭侯书［1889年2月］ 233
祭三妹游孺人文［1889年4月17日］ 235
与沈刑部子培书［1889年9月前］ 236
与祁子和总宪书［1889年9月前］ 240
与潘伯寅宫保书［1889年9月前］ 242
与幼博书［1889年10月］ 243
陈庆笙秀才墓志［1890年10月］ 244
与某人书［1890年12月］ 245
保朝鲜策［1890年］ 246
广艺舟双楫［1890年］ 249
自叙 251
广艺舟双楫卷一 252
广艺舟双楫卷二 263
广艺舟双楫卷三 275
广艺舟双楫卷四 281
广艺舟双楫卷五 291
广艺舟双楫卷六 298
卢怀慎论［1891年前］ 306
中和说［1891年前］ 307
府兵说［1891年前］ 309
郑康成笃信谶纬辨［1891年前］ 311
孟子诗亡然后春秋作解［1891年前］ 312
与朱一新论学书牍［1891年夏、冬间］ 314
与洪右臣给谏论中西异学书［1891年］ 336
长兴学记［1891年］ 339
陈千秋跋 351
新学伪经考［1891年］ 353
秦焚六经未尝亡缺考第一 356
史记经说足证伪经考第二 361
汉书艺文志辨伪第三上 378
汉书艺文志辨伪第三下 402
汉书河间献王鲁共王传辨伪第四 416
汉书儒林传辨伪第五 419
汉书刘歆王莽传辨伪第六 428
汉儒愤攻伪经考第七 437
伪经传于通学成于郑玄考第八 441
后汉书儒林传纠谬第九说文序纠谬附 453
经典释文纠谬第十 459
隋书经籍志纠谬第十一 474
伪经传授表第十二上 482
伪经传授表第十二下 506
书序辨伪第十三 附：尚书篇目异同真伪表 521
刘向经说足证伪经考第十四 545