第一部分 开始使用R 2
第1章 R基础 2
1.1 下载软件 2
1.2 尝试一些简单的任务 2
1.3 用户界面 5
1.4 安装包:GUI界面 6
1.5 数据结构 6
1.6 样本数据集 7
1.7 工作目录 9
1.8 将数据导入R 9
1.8.1 命令行输入 10
1.8.2 使用数据编辑器 11
1.8.3 从外部文件读取 13
1.9 获取脚本 18
1.10 用户自定义函数 20
1.11 开始令人享受的事 21
第2章 R图概述 24
2.1 图表导出 24
2.2 探索性图表和展示性图表 25
2.3 R图形系统 28
2.3.1 基本图形和网格 28
2.3.2 lattice 28
2.3.3 ggplot2 30
2.3.4 包的特殊应用程序/图表 31
2.3.5 用户自定义图表函数 31
第二部分 单变量图 34
第3章 带状图 34
3.1 一种简单的图 34
3.2 数据可以漂亮 40
3.2.1 练习3-1 43
3.2.2 练习3-2 43
第4章 点图 44
第5章 箱线图 50
5.1 箱线图 50
5.2 再次访问Nimrod 54
5.3 美化数据 56
5.3.1 练习5-1 59
5.3.2 练习5-2 59
第6章 茎叶图 60
第7章 直方图 63
7.1 简单直方图 63
7.2 带第二个变量的直方图 66
7.2.1 练习7-1 70
7.2.2 练习7-2 70
第8章 核密度图 71
8.1 密度估计 71
8.1.1 选择带宽 73
8.1.2 比较两个或多个密度图 74
8.1.3 背景不是白色的 76
8.2 累积分布函数 76
8.2.1 练习8-1 78
8.2.2 练习8-2 78
第9章 条形图 79
9.1 基础条形图 79
9.2 脊柱图 82
9.3 条形图的间距和方向 83
9.3.1 练习9-1 86
9.3.2 练习9-2 86
第10章 饼图 87
10.1 普通饼图 87
10.2 扇形图 89
10.2.1 练习10-1 90
10.2.2 练习10-2 90
第11章 地毯图 91
第三部分 双变量图 94
第12章 散点图和折线图 94
12.1 基础散点图 94
12.2 折线图 99
12.3 模板 105
12.4 增强的散点图 108
12.4.1 练习12-1 111
12.4.2 练习12-2 112
第13章 高密度图 113
第14章 Bland-Altman图 121
第15章 QQ图 128
第四部分 多变量图 136
第16章 散点图矩阵和相关性分析图 136
16.1 散点图矩阵 136
16.2 相关性分析图 141
16.3 混合定量变量和分类变量的广义对矩阵 145
第17章 三维图 149
17.1 三维散点图 149
17.2 伪色图 154
17.3 气泡图 155
17.3.1 练习17-1 160
17.3.2 练习17-2 160
第18章 协同图 161
第19章 聚类分析:树状图和热图 167
19.1 聚类分析 167
19.2 热图 172
19.2.1 练习19-1 176
19.2.2 练习19-2 176
19.2.3 练习19-3 176
第20章 马赛克图 177
第五部分 现在该做些什么 188
第21章 拓展图形化知识和R技能的资源 188
21.1 R图 188
21.2 通用绘图原则 189
21.3 学习更多关于R的知识 189
21.4 用R做统计 189
附录A 参考文献 191
附录B R的颜色 193
附录C R Commander图形用户界面 195
附录D 使用/引用的包 200
附录E 从R的外部导入数据 204
附录F 章节练习解答 209
附录G 故障排查:为什么我的代码不工作 220
附录H 本书介绍的R函数 228
关于作者 238
关于封面 238