第一章 分离鼠疫耶尔森菌 1
第一节 为分离细菌应取得的样本 2
第二节 显微镜检查 6
第三节 分离鼠疫菌 8
第四节 从污染样本中分离鼠疫菌 13
第五节 通过动物接种分离鼠疫菌 14
第六节 鼠疫菌种保存方法及噬菌体增殖 17
第二章 鼠疫菌常规生物学鉴定 23
第一节 糖、醇酵解测定 23
第二节 使用固体培养基的糖、醇酵解测定 28
第三节 硝酸盐还原测定 35
第四节 营养特征测定 37
第五节 钙依赖测定 45
第六节 鼠疫菌素测定 49
第七节 色素沉着能力测定 55
第八节 抗生素敏感试验 58
第三章 检测鼠疫菌特异性抗原及鼠疫抗体 62
第一节 被动血球凝集试验 63
第二节 酶联免疫吸附试验 69
第三节 胶体金纸上色谱 75
第四节 鼠疫菌F1抗原和抗体的制备 78
第四章 检测鼠疫菌特异性核酸片段 82
第一节 核酸检测样本处理 84
第二节 普通PCR测定 88
第三节 荧光定量PCR测定 100
第四节 普通PCR和荧光定量PCR的内部对照 109
第五章 以核酸电泳为基础的鼠疫菌遗传鉴定 120
第一节 鼠疫菌质粒DNA提取 121
第二节 鼠疫菌染色体DNA提取 127
第三节 琼脂糖凝胶电泳 131
第四节 脉冲场电泳分析 136
第六章 以PCR为基础的鼠疫菌遗传鉴定 155
第一节 串联重复序列长度多态性分析 155
第二节 插入序列定位分析 169
第七章 以分子杂交为基础的鼠疫菌遗传鉴定 180
第一节 rRNA基因分型 180
第二节 核酸芯片分析 190
第八章 鼠疫菌蛋白质组鉴定 195
第一节 鼠疫菌蛋白质提取 195
第二节 聚丙烯酰胺电泳胶体制备 198
第三节 鼠疫菌全蛋白质单向聚丙烯酰胺凝胶电泳 203
第四节 双向聚丙烯酰胺凝胶电泳 207
第五节 免疫印迹实验 212
第六节 蛋白质质谱分析 216
第九章 鼠疫菌遗传特征鉴定操作及流程 219
第一节 鼠疫菌差异区段操作及流程 219
第二节 鼠疫菌单核苷酸多态性操作及流程 227
第三节 鼠疫菌插入序列位点分析操作及流程 237
第四节 鼠疫菌多位点可变数量串联重复序列操作及流程 242
第五节 鼠疫菌基因组重排特征操作及流程 248
第六节 田鼠型鼠疫菌特定突变基因筛选操作及流程 252
第十章 鼠疫实验活动风险评估 257
参考文献 274