第一篇 天然产物活性成分的发现 2
第一章 真菌培养 2
第一节 微生物次级代谢产物 2
第二节 真菌的培养 4
第三节 真菌分离培养研究实例 12
第二章 提取分离方法 25
第一节 微生物活性成分的提取 25
第二节 微生物活性成分的分离 26
第三节 活性成分提取分离研究实例 33
第四节 手性分离 36
第五节 手性化合物拆分研究实例 40
第三章 天然产物的结构鉴定技术 43
第一节 常规波谱解析方法 43
第二节 量子化学计算方法 51
第三节 化学方法 60
第四节 晶体衍射方法 64
第二篇 天然产物活性的虚拟筛选 77
第一章 基于分子对接的虚拟药物筛选 77
第一节 虚拟药物筛选背景 77
第二节 靶点蛋白质结构的获得方法和途径 78
第三节 基于分子对接的虚拟筛选常用软件和天然产物数据库 81
第四节 化合物活性的实验性验证方法 84
第五节 天然产物活性成分的虚拟筛选和分子对接 86
第二章 天然产物-蛋白质共结晶技术 94
第一节 分子克隆技术和原理 94
第二节 重组蛋白的分离纯化技术及相关原理 97
第三节 蛋白质结晶技术与原理、蛋白质共结晶技术 98
第四节 研究实例:甘草次酸与11β-HSD1重组蛋白共结晶 101
第三篇 活性筛选 112
第一章 化合物活性在细胞水平的筛选及检测 112
第一节 原代及传代细胞培养 112
第二节 细胞给药处理 115
第三节 化合物的细胞毒性检测 116
第四节 细胞中相关酶活性检测 119
第五节 细胞中相关蛋白水平检测 122
第六节 细胞中相关蛋白转录水平检测 125
第七节 细胞中蛋白间相互作用水平检测 129
第八节 细胞中相关蛋白质亚细胞定位分布检测 132
第九节 FRET技术 134
第二章 活性化合物在小鼠体内作用效果及机制 137
第一节 小鼠饲养及动物模型选择 137
第二节 小鼠给药方法 149
第三节 小鼠行为学检测 153
第四节 小鼠血样及组织取材 158
第五节 小鼠脑内神经元电生理检测 160
第六节 小鼠组织中相关酶活性、蛋白质水平检测 166
第七节 组织形态学检测 166
第四篇 天然产物活性成分的全合成、仿生合成和结构修饰 180
第一章 天然产物全合成 180
第一节 天然产物的结构确认 180
第二节 天然产物结构修正 185
第三节 天然产物样品制备 190
第四节 丰富有机化学理论 197
第二章 天然产物的仿生合成 203
第一节 细胞松弛素的仿生合成 204
第二节 Hyperjaponols A—C的仿生合成 208
第三节 Homodimericin A的仿生全合成 211
第四节 天然产物paeoveitol的首次仿生合成 212
第五节 一锅法全合成具有复杂环结构的portentol 213
第三章 天然产物的结构修饰或简化 215
第一节 简化分子结构和增加代谢稳定性 215
第二节 减少手性碳原子 216
第三节 增强活性 217
第四节 改善物理化学性质 218
第五篇 天然产物生物合成 228
第一章 绪论 228
第一节 真菌天然产物合成通路研究 228
第二节 基于合成生物学的新天然产物的发现 240
第二章 真菌基因组DNA的提取 247
第三章 真菌总RNA的提取及逆转录PCR 253
第一节 真菌总RNA的提取 253
第二节 逆转录PCR(RT-PCR) 255
第四章 基因克隆及敲除盒的构建 258
第一节 基因片段扩增 258
第二节 基因敲除盒的构建 261
第五章 丝状真菌原生质体制备和转化 264
第一节 丝状真菌原生质体制备 264
第二节 基因敲除盒的原生质体转化 267
第六章 生物合成基因的异源表达 273
第一节 双酶切法表达载体构建 273
第二节 In-Fusion技术载体构建 278
第三节 Golden Gate技术构建表达载体 281
第四节 表达载体的酵母转化 283
第七章 天然产物体外酶促生物转化 287
第一节 大肠杆菌中蛋白过表达和纯化 287
第二节 酵母中蛋白过表达和纯化 290
第三节 异戊烯基转移酶(PT)生化功能的鉴定 292
第四节 化学酶法合成 295
第六篇 真菌次级代谢产物来源药物的研究开发 301
第一章 从真菌中开发新药的方式 301
第二章 真菌次级代谢产物来源的新药研究开发的阶段 306
第一节 新药研究阶段 306
第二节 新药开发阶段 307
第三章 真菌次级代谢产物来源的新药研究的方法及需注意的问题 310
第一节 真菌次级代谢产物来源的新药研究过程 310
第二节 真菌次级代谢产物新药研究中需要注意的问题 311
第四章 真菌次级代谢产物来源的新药研究的实例 313
第一节 新药芬戈莫德的研究开发 313
第二节 从土曲霉次级代谢产物中发现抗阿尔茨海默病活性的先导化合物 323