第1章 小鼠早期胚胎细胞的命运决定 1
引言 1
胚层的建立和前干细胞程序：囊胚的形成 2
胚系的维持和干细胞程序：囊胚以外 5
第二胚层决定：ICM的细分 5
细胞信号调节PE／EPI形成 6
EPI胚层多能性的建立和调节 8
结论 9
参考文献 10
第2章 干细胞的核结构 13
引言 13
胚胎干细胞核的功能分区 13
干细胞其他核质亚区的特点 17
胚胎于细胞核特有的染色质特征 18
结论 19
参考文献 20
第3章 细胞多能性的表观遗传学调控 23
引言 23
表观遗传调控 24
胚胎干细胞的表观遗传组学 28
结论 32
参考文献 33
第4章 哺乳动物早期发育阶段常染色体复制域的莱昂化 37
引言 37
复制时序编程：对基因组结构的初步测定 38
一种在进化上相对保守的表观遗传学印记 43
复制时序作为染色体三维结构的定量指标 44
复制时序反映表观遗传特征的改变：常染色体在外胚层阶段的莱昂化 46
复制时序及细胞重编程：常染色体莱昂化的进一步证明 47
复制时序程序的维持和改变及其潜在作用 48
结论 49
参考文献 50
第5章 小鼠胚胎干细胞基因组完整性的保持 54
引言和历史观点 54
体细胞的突变频率 56
小鼠ES细胞基因组的保护 57
结论 64
参考文献 65
第6章 胚胎干细胞的转录调控 68
引言 68
胚胎干细胞可作为研究转录调控的模型细胞 69
转录因子决定胚胎干细胞的多能性 69
转录调控网络 72
转录调控网络分析技术 72
转录调控网络核心：Oct4、 Sox2和Nanog 73
扩大化的转录调控网络 75
增强体：转录因子复合体 76
信号通路参与转录网络 77
转录调控与表观遗传学调控的相互作用 78
结论 79
参考文献 79
第7章 干细胞自我更新和分化中的选择性剪接 82
引言 82
选择性剪接的概述 82
干细胞干性维持及分化中涉及的选择性剪接基因 84
基因组学方法鉴别、检测选择性剪接 86
RNA结合蛋白对选择性剪接的调控 87
结论和展望 90
参考文献 90
第8章 微小RNA调节胚胎干细胞自我更新和分化 93
引言：自我更新程序 93
胚胎干细胞 94
微小RNA的生成和功能 94
促进自我更新的ESCC miRNA 95
ESC分化过程中诱导的miRNA阻止自我更新程序 97
控制miRNA表达的调节网络 99
miRNA能促进或抑制IPS细胞分化 99
成体干细胞中的miRNA 100
肿瘤细胞中的miRNA 100
结论 101
参考文献 101
第9章 成体干细胞和多能胚胎干细胞中的端粒及端粒酶 104
引言 104
端粒及端粒酶的调节 106
端粒和端粒酶在成体干细胞中的作用 107
在体细胞核移植中端粒及端粒酶的调控 108
在iPS产生过程中端粒及端粒酶的调控 109
端粒酶活性对于产生“高”质量的iPS细胞是必需的 110
端粒重编程调控 110
结论 111
参考文献 111
第10章X染色体失活与胚胎干细胞 115
引言 115
X染色体失活中的顺势作用因子 117
X染色体失活中的反式作用因子 118
数量及选择 119
沉默与沉默的维持 123
X染色体失活与人ES细胞 126
结论 129
参考文献 130
第11章 成体干细胞及其细胞龛 137
“龛”的概念、定义与历史 137
干细胞龛成分 138
与龛功能相关的分子通路 140
细胞外基质与细胞-细胞间相互作用 141
干细胞龛动态性 142
干细胞龛衰老 143
恶性干细胞龛 143
结论 144
参考文献 145
第12章 成体干细胞的分化和迁移及其对疾病的影响 149
分化 149
间充质干细胞 152
迁移 153
结论 157
参考文献 158
第13章 脊椎动物再生模型对干细胞应用的启示 162
脊椎动物再生模型的属性 162
成熟组织再生的机制 163
结论 180
参考文献 181
第14章 成体细胞重编程获得多能性 189
引言 189
青蛙成体细胞核重编程研究 189
克隆羊“多莉”的诞生 190
改变细胞命运的因子MyoD（成肌分化抗原） 190
通过细胞融合来重编程体细胞 190
转染Sox2、 Oct3／4、 Klf4和c-Myc从而产生诱导多能干细胞 191
iPS细胞诱导的方法 192
iPS细胞产生的分子机制 193
直接重编程：来源于胰腺细胞的β细胞 193
直接重编程：来源于成纤维细胞的神经元细胞 194
可用于临床的疾病iPS细胞系 194
结论 195
参考文献 195