第1部分 基因和染色体 1
第1章 基因是DNA 2
1.1 引言 3
1.2 DNA是细菌的遗传物质 4
1.3 DNA是动物细胞的遗传物质 6
1.4 多核苷酸链含有连接碱基的糖-磷酸骨架 7
1.5 超螺旋影响DNA结构 8
1.6 DNA是双螺旋 10
1.7 DNA复制是半保留的 12
1.8 聚合酶在复制叉处作用于分开的DNA链 13
1.9 遗传信息可由DNA或RNA提供 14
1.10 核酸通过碱基配对进行杂交 16
1.11 突变改变DNA序列 18
1.12 突变影响单个碱基对或更长序列 19
1.13 突变效应可逆转 20
1.14 突变集中在热点 21
1.15 一些突变热点来自修饰的碱基 22
1.16 一些遗传因子是非常小的 23
1.17 小结 24
参考文献 25
第2章 基因编码蛋白质 27
2.1 引言 28
2.2 一个基因编码一条肽链 29
2.3 同一基因上的突变不能互补 30
2.4 突变可能引起功能的丧失或获得 32
2.5 一个基因座可有不同的突变等位基因 32
2.6 一个基因座可能会有不止一个野生型等位基因 33
2.7 DNA的互换产生重组 34
2.8 遗传密码是三联体 36
2.9 每一序列具有三种可能的阅读框 38
2.10 原核生物基因与其蛋白质呈共线性关系 39
2.11 表达一个基因的蛋白质产物需要几个过程 40
2.12 蛋白质呈反式作用而DNA上的位点呈顺式作用 42
2.13 小结 43
参考文献 43
第3章 分子生物学与遗传工程中的方法学 44
3.1 引言 45
3.2 核酸酶 46
3.3 克隆 48
3.4 克隆载体可因不同目的而专一化 51
3.5 核酸检测 54
3.6 DNA分离技术 57
3.7 DNA测序 60
3.8 PCR和RT-PCR 62
3.9 印迹方法 67
3.10 DNA微阵列 70
3.11 染色质免疫沉淀 73
3.12 基因敲除和转基因物种 74
3.13 小结 80
第4章 断裂基因 82
4.1 引言 83
4.2 断裂基因由外显子和内含子组成 84
4.3 外显子和内含子中的碱基组成是不同的 85
4.4 断裂基因的结构是保守的 86
4.5 在负选择时外显子序列保守而内含子序列变化多端 88
4.6 在正选择时外显子序列变化多端而内含子序列保守 89
4.7 基因大小的变化范围很广 90
4.8 某些DNA序列编码多种肽链 92
4.9 某些外显子与蛋白质功能域等同 95
4.10 基因家族成员具有共同的结构 96
4.11 遗传信息不完全包含在DNA之中 99
4.12 小结 100
参考文献 101
第5章 基因组概述 103
5.1 引言 104
5.2 在不同的分辨率水平绘制基因组图 105
5.3 个体基因组呈现广泛变化 106
5.4 利用RFLP和SNP绘制遗传图 108
5.5 真核生物基因组包含非重复DNA序列和重复DNA序列 109
5.6 基于外显子的保守性鉴定真核生物编码蛋白质的基因 111
5.7 基因组结构的保守性有助于鉴定基因 114
5.8 某些细胞器含有DNA 116
5.9 细胞器基因组是编码细胞器蛋白质的环状 DNA分子 118
5.10 叶绿体基因组编码多种蛋白质和RNA 120
5.11 线粒体和叶绿体是通过内共生进化来的 121
5.12 小结 122
参考文献 122
第6章 基因组序列和基因数目 125
6.1 引言 126
6.2 细菌基因总数的差异可超过一个数量级 127
6.3 现已知多种真核生物的基因总数 129
6.4 基因有多少不同的类型 131
6.5 人类基因数目少于预期 133
6.6 在基因组中基因和其他序列的分布 135
6.7 Y染色体雄性特异基因 136
6.8 有多少基因是必需的 138
6.9 真核生物约10000个基因在不同层次广泛表达 141
6.10 可以整体测出表达基因的数目 143
6.11 小结 144
参考文献 145
第7章 成簇与重复 147
7.1 引言 148
7.2 不等交换使基因簇发生重排 150
7.3 编码rRNA的基因形成包括恒定转录单位的串联重复 153
7.4 固定的交换使各个重复单元的序列保持完全相同 156
7.5 卫星DNA一般位于异染色质中 158
7.6 节肢动物卫星DNA具有很短的相同重复 160
7.7 哺乳动物卫星DNA由分级的重复序列所组成 161
7.8 小卫星序列可用于遗传作图 165
7.9 小结 167
参考文献 168
第8章 基因组进化 169
8.1 引言 170
8.2 突变和分选机制使DNA序列进化 171
8.3 通过测量 DNA序列变异可探查自然选择 173
8.4 DNA序列趋异的恒定速率就是分子钟 177
8.5 重复序列的趋异度可以度量中性替换率 181
8.6 断裂基因怎样进化 182
8.7 某些基因组非常庞大 185
8.8 形态复杂性是通过增加新的基因功能进化而来的 187
8.9 基因重复在基因组进化中的作用 189
8.10 珠蛋白基因簇由重复和趋异形成 190
8.11 假基因是无功能的基因拷贝 192
8.12 基因组多倍化（重复）在植物和脊椎动物进化中的作用 194
8.13 转座因子在基因进化中的作用 195
8.14 在突变和基因转换以及密码子使用上的偏爱性 196
8.15 小结 197
参考文献 198
第9章 染色体 201
9.1引言 202
9.2 病毒基因组包装进它们的外壳里 203
9.3 细菌基因组是一个拟核结构 206
9.4 细菌基因组是超螺旋的 208
9.5 真核生物DNA具有附着于支架的环和结构域 209
9.6 特殊序列将DNA连接在间期基质上 210
9.7 染色质可以分为常染色质和异染色质 211
9.8 染色体带型 213
9.9 灯刷染色体侧环向外延伸 214
9.10 多线染色体形成横纹 216
9.11 多线染色体在基因表达位点出现染色体疏松 217
9.12 真核生物细胞染色体是一种分离装置 218
9.13 着丝粒局部含有组蛋白H3变异体和重复DNA序列 219
9.14 酿酒酵母中的点着丝粒具有必需的DNA短序列 221
9.15 酿酒酵母中的着丝粒与蛋白质复合体结合 222
9.16 端粒具有简单重复序列 223
9.17 端粒封闭染色体末端且在减数分裂的染色体配对中起作用 224
9.18 端粒由核糖核蛋白酶合成 226
9.19 端粒是生存必需的 228
9.20 小结 229
参考文献 230
第10章 染色质 233
10.1引言 234
10.2 DNA以核小体串珠方式组织 235
10.3 核小体是所有染色质的亚单元 238
10.4 核小体是共价修饰的 243
10.5 组蛋白变异体产生可变核小体 247
10.6 核小体表面的DNA结构变化 249
10.7 核小体在染色质纤丝中的途径 252
10.8 染色质复制需要核小体的装配 254
10.9 核小体是否位于特殊位点 257
10.10 在转录过程中核小体被置换和重新装配 261
10.11 DNA酶超敏性可检测染色质结构的改变 265
10.12 绝缘子是转录不相关的结构域 267
10.13 LCR可以调控一个结构域 272
10.14小结 274
参考文献 276
第2部分 DNA复制与重组 279
第11章 复制子 280
11.1 引言 281
11.2 复制子可以是线性的或环状的 282
11.3 复制起始点可用放射自显影和电泳技术显示 284
11.4 细菌基因组通常是单一环状复制子 286
11.5 细菌起始点的甲基化调控复制起始 287
11.6 复制后起始点可以被阻断 288
11.7 古细菌染色体可包含多个复制子 290
11.8 每条真核生物细胞染色体包含多个复制子 290
11.9 从酵母中分离复制起始点 292
11.10 许可因子控制了真核生物的再复制 294
11.11 许可因子由MCM蛋白组成 295
11.12 D环维持线粒体起始点 297
11.13 小结 298
参考文献 299
第12章 染色体外复制子 301
12.1 引言 302
12.2 就复制而言线性DNA末端结构很重要 303
12.3 末端蛋白能够在病毒DNA的末端起始复制 304
12.4 滚环产生复制子的多联体 305
12.5 滚环被用来复制噬菌体基因组 307
12.6 通过细菌间的接合转移F因子 308
12.7 接合能转移单链DNA 309
12.8 植物中的细菌Ti质粒诱发冠瘿病 311
12.9 T-DNA携带感染所需的基因 313
12.10 T-DNA的转移类似于细菌接合 316
12.11 小结 318
参考文献 318
第13章 细菌复制与细胞周期的关系 320
13.1 引言 321
13.2 复制与细胞周期的关系 322
13.3 隔膜将细菌分隔成各含一条染色体的子代 323
13.4 与分裂或分离有关的基因突变影响细胞形态 324
13.5 FtsZ蛋白是隔膜形成所必需的 325
13.6 min和noc/slm基因可调节隔膜定位 327
13.7 染色体分离可能需要位点专一性重组 328
13.8 分隔涉及染色体的分开 330
13.9 单拷贝质粒有一个分隔系统 331
13.10 质粒不相容性由复制子决定 333
13.11 ColEl相容性系统受控于RNA调节物 334
13.12 线粒体如何复制和分离 337
13.13 小结 338
参考文献 339
第14章 DNA复制 341
14.1 引言 342
14.2 起始：在起始点oriC形成复制叉 344
14.3 DNA聚合酶是合成DNA的酶 346
14.4 DNA聚合酶有多种核酸酶活性 347
14.5 DNA聚合酶控制复制保真度 348
14.6 DNA聚合酶具有共同结构 350
14.7 两条DNA新链具有不同的合成模式 351
14.8 复制需要解旋酶和单链结合蛋白 352
14.9 启动DNA合成需要引发作用 353
14.10 前导链和后随链的协同合成 355
14.11 DNA聚合酶全酶由多个亚复合体组成 356
14.12 箍钳蛋白控制了核心聚合酶和DNA之间的结合 357
14.13 连接酶将冈崎片段连接在一起 360
14.14 真核生物中不同DNA聚合酶分别负责起始和延伸 362
14.15 T4噬菌体为自身提供复制装置 365
14.16 跨损伤修复需要聚合酶置换 366
14.17 小结 369
参考文献 370
第15章 同源重组与位点专一性重组 373
15.1 引言 375
15.2 同源重组发生在减数分裂中的联会染色体之间 377
15.3 双链断裂启动重组 378
15.4 基因转换导致等位基因之间的重组 380
15.5 依赖合成的链退火模型 382
15.6 非同源末端连接可修复双链断裂 382
15.7 单链退火机制在一些双链断裂处发挥作用 384
15.8 断裂诱导复制能修复双链断裂 384
15.9 减数分裂染色体由联会复合体连接 386
15.10 联会复合体在双链断裂后形成 387
15.11 配对与联会复合体的形成是两个独立过程 390
15.12 chi序列激活细菌RecBCD系统 390
15.13 链转移蛋白催化单链同化 392
15.14 Holliday连接体必须被解开 395
15.15 参与同源重组的真核生物基因 397
15.16 特化重组涉及特异位点 401
15.17 位点专一性重组涉及断裂和重接 402
15.18 位点专一性重组类似于拓扑异构酶活性 403
15.19 λ噬菌体重组发生在整合体中 405
15.20 酵母通过开关沉默基因座和活性基因座来转换交配型 406
15.21 受体MAT基因座启动单向基因转换 408
15.22 锥虫中的抗原变异运用同源重组 410
15.23 适合于实验系统的重组途径 411
15.24 小结 414
参考文献 415
第16章 修复系统 418
16.1 引言 419
16.2 修复系统校正DNA损伤 421
16.3 大肠杆菌中的切除修复系统 423
16.4 真核生物核苷酸切除修复途径 425
16.5 碱基切除修复系统需要糖基化酶 427
16.6 易错修复 430
16.7 控制错配修复的方向 431
16.8 大肠杆菌中的重组修复系统 434
16.9 重组是修复复制差错的重要机制 435
16.10 真核生物中双链断裂的重组修复 437
16.11 非同源末端连接也可修复双链断裂 438
16.12 真核生物中的DNA修复与染色质背景有关 440
16.13 RecA蛋白引发SOS系统 442
16.14 小结 445
参考文献 445
第17章 转座因子和反转录病毒 449
17.1引言 451
17.2 插入序列是简单的转座因子 452
17.3 转座可通过复制和非复制机制产生 454
17.4 转座子引起DNA重排 455
17.5 复制型转座要经过一个共整合阶段 457
17.6 非复制型转座要经过链的断裂与重接 458
17.7 玉米转座子会引起断裂与重排 460
17.8 玉米中转座子形成几个家族 462
17.9 转座因子在杂种劣育中的作用 465
17.10 P因子在生殖细胞中被活化 466
17.11 反转录病毒生命周期包括类转座事件 468
17.12 反转录病毒基因编码多聚蛋白质 469
17.13 病毒DNA由反转录产生 471
17.14 病毒DNA整合到染色体中 474
17.15 反转录病毒能转导DNA序列 475
17.16 酵母Ty因子类似反转录病毒 477
17.17 黑腹果蝇中存在多种类型的转座因子 479
17.18 反转录元件分为三类 480
17.19 Alu家族具有许多广泛分布的散在重复序列成员 482
17.20 LINE利用内切核酸酶活性产生引发末端 483
17.21 小结 485
参考文献 487
第18章 免疫系统中的体细胞重组与高变 490
18.1免疫系统：先天免疫和获得性免疫 492
18.2 先天免疫应答利用保守的识别分子与信号通路 493
18.3 获得性免疫 496
18.4 克隆选择作用扩增出可应答给定抗原的淋巴细胞 498
18.5 Ig基因由淋巴细胞内多个分散的DNA片段装配而成 500
18.6 轻链基因由一次重组事件装配而成 502
18.7 重链基因由两次有序重组事件装配而成 504
18.8 重组产生广泛的多样性 505
18.9 免疫重组需要两类共有序列 506
18.10 缺失和倒位可产生V （D） J DNA重组 507
18.11 有效重排引发等位基因排斥 508
18.12 RAG1/RAG2蛋白催化V（D）J基因区段的断开和重接 510
18.13 RNA加工可调节早期Ig重链的表达 512
18.14 由DNA重组来实现Ig的类型转换 513
18.15 CSR涉及NHEJ途径中的一些元件 515
18.16 小鼠和人类体细胞高变（SHM）产生了额外的多样性 517
18.17 SHM由AID蛋白、Ung蛋白、错配DNA修复（MMR）装置和损伤DNA合成（TLS）聚合酶介导 519
18.18 假基因参与鸟类免疫球蛋白的装配 520
18.19 B淋巴细胞记忆可以引起快速强烈的次级免疫应答 521
18.20 BCR与TCR相关 524
18.21 TCR与MHC一起发挥作用 525
18.22 主要组织相容性基因座编码一群参与免疫识别的基因 527
18.23 小结 530
参考文献 532
第3部分 转录与转录后机制 539
第19章 原核生物的转录 540
19.1引言 542
19.2 转录发生在没有配对的DNA“泡”中并根据碱基互补配对原则进行 543
19.3 转录反应的三个阶段 545
19.4 细菌RNA聚合酶由多个亚基组成 546
19.5 RNA聚合酶全酶包括核心酶和σ因子 548
19.6 RNA聚合酶如何发现启动子序列 549
19.7 全酶在识别与逃逸启动子的过程中经历了转换反应 550
19.8 σ因子通过识别启动子中的特定序列来控制与DNA的结合 552
19.9 突变可增强或降低启动子效率 554
19.10 RNA聚合酶的多个区域可与启动子DNA直接接触 555
19.11 足迹法是一种可用于鉴定RNA聚合酶-启动子和DNA-蛋白质的相互作用的高分辨率方法 558
19.12 在启动子逃逸过程中σ因子与核心RNA聚合酶之间的相互作用发生改变 560
19.13 晶体结构提示酶的移动模型 561
19.14 停滞的RNA聚合酶可以再次启动 563
19.15 细菌RNA聚合酶的终止发生在离散的位点 564
19.16 ρ因子如何工作 566
19.17 超螺旋是转录的一个重要特征 568
19.18 T7噬菌体的RNA聚合酶是一个良好的模型系统 569
19.19 σ因子的竞争能调节转录起始 570
19.20 σ因子可以组织成几个级联反应 572
19.21 芽胞形成由σ因子控制 573
19.22 抗终止可以是一个调控事件 576
19.23 细菌mRNA的生命周期 579
19.24 小结 581
参考文献 582
第20章 真核生物的转录 587
20.1 引言 588
20.2 真核生物的RNA聚合酶由多个亚基组成 591
20.3 RNA聚合酶Ⅰ有一个双向启动子 592
20.4 RNA聚合酶Ⅲ既使用下游启动子也使用上游启动子 594
20.5 RNA聚合酶Ⅱ的转录起始点 596
20.6 TBP蛋白是一种通用因子 597
20.7 启动子上基础转录装置的装配 600
20.8 转录起始后紧随启动子清除和延伸 603
20.9 增强子含有能辅助起始的双向元件 606
20.10 增强子通过提高启动子附近激活因子的浓度而起作用 607
20.11 基因表达和去甲基化有关 609
20.12 CpG岛是调控靶标 610
20.13 小结 612
参考文献 613
第21章 RNA的剪接和加工 617
21.1 引言 619
21.2 真核生物mRNA的5’端被加帽 621
21.3 细胞核内的RNA剪接连接点是各种短序列 622
21.4 剪接位点被成对解读 624
21.5 前mRNA剪接要经过一个套马索结构 625
21.6 snRNA是剪接所必需的 626
21.7 前mRNA定向到剪接途径中 628
21.8 剪接体组装途径 631
21.9 可变剪接体使用不同的snRNP加工次要类型的内含子 634
21.10 前mRNA剪接可能与Ⅱ类自我催化内含子共享剪接机制 635
21.11 暂时性和功能性的剪接与基因表达的多个步骤偶联 637
21.12 多细胞真核生物的可变剪接是普遍规律 640
21.13 剪接可被内含子和外显子的剪接增强子或沉默子所调节 643
21.14 反式剪接反应需要短序列RNA 645
21.15 经切割和多腺苷酸化产生mRNA的3’端 648
21.16 mRNA 3’端的加工对于转录终止十分关键 650
21.17 组蛋白mRNA 3’端的形成需要U7snRNA 652
21.18 tRNA剪接切割和重连是分开的两步反应 653
21.19 解折叠蛋白应答与tRNA剪接有关 656
21.20 rRNA的产生需要切割反应与短序列RNA的参与 658
21.21 小结 661
参考文献 662
第22章 mRNA的稳定性与定位 667
22.1 引言 668
22.2 信使RNA是不稳定分子 669
22.3 真核生物mRNA始终以mRNP的形式存在 671
22.4 原核生物mRNA的降解与多种酶有关 672
22.5 大部分真核生物mRNA通过两条依赖于脱腺苷酸化的途径而降解 674
22.6 其他降解途径靶向特殊 mRNA 677
22.7 专一性mRNA的半衰期由mRNA内的序列或结构所控制 679
22.8 细胞核监管系统对新合成mRNA进行缺陷检测 681
22.9 细胞质监管系统执行mRNA翻译的质量控制 683
22.10 某些mRNA能够被特异性地定位于某些细胞区域 686
22.11 小结 689
参考文献 690
第23章 催化性RNA 693
23.1 引言 694
23.2 Ⅰ类内含子通过转酯反应实现自我剪接 695
23.3 Ⅰ类内含子形成特征性二级结构 698
23.4 核酶具有各种催化活性 700
23.5 有些Ⅰ类内含子编码发起移动的内切核酸酶 703
23.6 Ⅱ类内含子可编码多功能蛋白质 705
23.7 某些自我剪接内含子需要成熟酶 706
23.8 RNA酶P的催化活性来自RNA 707
23.9 类病毒具有催化活性 707
23.10 RNA编辑发生在个别碱基 709
23.11 RNA编辑可由引导RNA指导 711
23.12 蛋白质剪接是自我催化的 713
23.13 小结 715
参考文献 716
第24章 翻译 719
24.1 引言 720
24.2 翻译过程包括起始、延伸和终止 722
24.3 特殊机制控制翻译的精确性 724
24.4 细菌中的起始反应需要30S亚基和辅助因子 725
24.5 起始反应涉及mRNA和rRNA之间的碱基配对 727
24.6 一种特殊的tRNA起始子开始了肽链的合成 728
24.7 fMet-tRNAf的使用受IF-2因子和核糖体的调节 730
24.8 小亚基扫描查找真核生物mRNA的起始位点 731
24.9 真核生物使用由许多起始因子组成的一个复合体 733
24.10 延伸因子Tu将氨酰tRNA装入A位 736
24.11 肽链转移到氨酰tRNA上 738
24.12 位移使核糖体移动 739
24.13 延伸因子选择性地结合在核糖体上 740
24.14 三种密码子终止蛋白质合成 742
24.15 终止密码子由蛋白质因子所识别 743
24.16 核糖体RNA广泛存在于两个核糖体亚基上 746
24.17 核糖体拥有一些活性中心 749
24.18 16S rRNA在翻译中起着重要作用 751
24.19 23S rRNA具有肽基转移酶活性 754
24.20 当亚基聚集在一起时核糖体结构发生改变 755
24.21 小结 756
参考文献 758
第25章 遗传密码的使用 762
25.1引言 763
25.2 相关密码子代表了化学性质相似的氨基酸 764
25.3 密码子-反密码子识别涉及“摆动” 766
25.4 tRNA由较长的前体加工而来 767
25.5 tRNA含有修饰碱基 768
25.6 修饰碱基影响反密码子-密码子配对 770
25.7 通用密码存在个别改变 772
25.8 新的氨基酸可以被插入到特定的终止密码子上 774
25.9 氨酰tRNA合成酶选择性地将氨基酸与tRNA配对 775
25.10 氨酰tRNA合成酶分为两个家族 777
25.11 合成酶利用校正功能来提高精确性 779
25.12 抑制因子tRNA使用突变的反密码子解读新密码子 782
25.13 每个终止密码子都有相应的无义抑制因子 783
25.14 抑制型可能与野生型竞争解读密码子 784
25.15 核糖体影响翻译的精确性 786
25.16 移码发生在不稳定序列上 788
25.17 其他再编码事件：翻译旁路途径和tmRNA机制可释放停滞的核糖体 790
25.18 小结 791
参考文献 792
第4部分 基因表达 794
第26章 操纵子 795
26.1 引言 797
26.2 结构基因簇是被协同调控的 800
26.3 lac操纵子是负可诱导的 801
26.4 lac阻遏物由小分子诱导物所控制 803
26.5 用顺式作用的组成性突变来鉴定操纵基因 805
26.6 用反式作用的突变来鉴定调节基因 806
26.7 lac阻遏物是由两个二聚体组成的四聚体 807
26.8 构象的变构作用可调节lac阻遏物与操纵基因的结合 809
26.9 lac阻遏物与三个操纵基因结合并与RNA聚合酶相互作用 812
26.10 操纵基因与低亲和力位点竞争性地结合阻遏物 813
26.11 lac操纵子拥有第二层控制系统：代谢物阻遏 815
26.12 trp操纵子是由三个转录单位组成的可阻遏操纵子 818
26.13 trp操纵子也由弱化作用控制 819
26.14 弱化作用可被翻译控制 821
26.15 翻译是可调控的 824
26.16 r蛋白合成的自体控制 826
26.17 小结 827
参考文献 828
第27章 噬菌体策略 831
27.1 引言 832
27.2 细胞裂解进程分为两个时期 834
27.3 细胞裂解过程受一种级联反应控制 835
27.4 两种调节事件控制细胞裂解的级联反应 836
27.5 T7噬菌体和T4噬菌体基因组显示了功能性的成簇现象 837
27.6 细胞裂解周期和溶源化都需要λ噬菌体即早期和迟早期基因 839
27.7 裂解周期依赖于pN的抗终止作用 840
27.8 λ噬菌体阻遏物维持溶源性 841
27.9 λ噬菌体阻遏物和它的操纵基因决定了免疫区 843
27.10 λ噬菌体阻遏物的DNA结合形式是二聚体 843
27.11 λ噬菌体阻遏物使用螺旋-转角-螺旋基序结合DNA 845
27.12 λ噬菌体阻遏物的二聚体协同结合操纵基因 846
27.13 λ噬菌体阻遏物维持自体调节回路 848
27.14 协同相互作用提高了调控的敏感性 849
27.15 cⅡ和cⅢ基因是建立溶源性所需的 850
27.16 弱启动子需要cⅡ蛋白的协助 851
27.17 溶源性需要一系列过程 852
27.18 裂解感染需要Cro阻遏物 854
27.19 是什么决定溶源和裂解周期之间的平衡 856
27.20 小结 857
参考文献 858
第28章 真核生物的转录调控 860
28.1 引言 861
28.2 激活因子和阻遏物的作用机制 863
28.3 DNA结合域和转录激活域是相互独立的 866
28.4 双杂交实验检测蛋白质-蛋白质的相互作用 867
28.5 激活因子和基础转录装置相互作用 868
28.6 多种类型的DNA结合域 870
28.7 染色质重塑是一个主动过程 872
28.8 核小体的结构或成分可在启动子处被改变 875
28.9 组蛋白乙酰化与转录激活相关 877
28.10 组蛋白甲基化和DNA存在联系 880
28.11 启动子激活涉及染色质的多种改变 882
28.12 组蛋白磷酸化影响染色质结构 883
28.13 基因如何开启 885
28.14 酵母GAL基因：一个用于激活和阻遏的模型 886
28.15 小结 888
参考文献 890
第29章 表观遗传效应是可遗传的 895
29.1 引言 896
29.2 异染色质从成核事件后开始传播 898
29.3 异染色质依赖于与组蛋白的相互作用 900
29.4 多梳蛋白和三胸蛋白为互相拮抗的阻遏物和激活因子 903
29.5 X染色体经受整体性变化 905
29.6 染色体凝聚由凝聚蛋白引起 909
29.7 CpG岛易于甲基化 912
29.8 DNA甲基化导致印记 915
29.9 单一中心控制着对立的印记基因 917
29.10 表观遗传效应可以遗传 918
29.11 酵母普里昂表现出不同寻常的遗传 920
29.12 在哺乳动物中普里昂可引起疾病 923
29.13 小结 924
参考文献 925
第30章 调节性RNA 931
30.1 引言 932
30.2 核酸开关可根据其所处的环境而改变其结构 933
30.3 非编码RNA可被用于调节基因表达 935
30.4 细菌含有调节RNA 937
30.5 微RNA在真核细胞中是广谱的调节物 940
30.6 RNA干扰如何工作 943
30.7 异染色质形成需要微RNA 947
30.8 小结 949
参考文献 949
词汇 952