第1章 绪论 1
第一节 个体化医疗的发展与现状 1
第二节 临床分子诊断与个体化医疗 3
一、基因扩增技术 4
二、基因测序技术 4
三、分子杂交技术 4
第三节 分子诊断检测平台的建设 5
一、常见的分子诊断项目与分子检测平台 5
二、分子检测平台建设实践 6
第四节 分子诊断人员能力要求 7
一、职责 7
二、培训内容 8
第五节 个体化医疗的展望 8
第2章 检测项目的选择依据和平台设置 10
第一节 分子诊断的常见检测项目 10
一、病原微生物检测 10
二、肿瘤相关基因检测 12
三、常见遗传病基因检测 15
四、药物相关基因检测 18
第二节 分子诊断检测平台的设置 21
一、定性PCR检测平台 21
二、荧光定量PCR检测平台 22
三、基因芯片检测平台 22
四、Sanger测序检测平台 23
五、高通量测序检测平台 23
六、质谱检测平台 25
第三节 项目选择的基本原则及依据 25
一、基本要求 25
二、依据 30
第3章 个体化医疗分子诊断适宜技术 34
第一节 常用的个体化医疗分子诊断技术 34
一、实时荧光定量PCR技术 34
二、定性PCR技术 46
三、基因芯片技术 60
四、核酸分子杂交技术 67
五、染色体核型分析 74
六、Sanger测序技术 82
七、高通量测序技术 85
八、质谱技术 90
第二节 分子诊断技术选择的基本原则 94
一、以测序技术为基础的分子诊断技术 94
二、以扩增技术为基础的分子诊断技术 95
三、以分子杂交为基础的分子诊断技术 97
第三节 分子诊断检测技术与平台建设 98
一、实时荧光定量PCR技术 98
二、定性PCR技术 99
三、基因芯片技术 100
四、测序技术 101
五、核酸杂交技术 104
六、染色体核型分析技术 105
七、生物质谱技术 106
第4章 人员配置与要求 108
第一节 实验室人员的职责 108
一、人员配置的原则 108
二、实验室人员的资质与职责 109
第二节 分子诊断人员的培养 111
一、检验技师 111
二、检验医师 112
三、生物信息学人员 113
第5章 分子诊断分析前的质量控制 115
第一节 标本类别及采集流程 115
一、血液标本 116
二、组织标本 116
三、产前诊断标本 116
四、骨髓标本 118
五、尿液标本 118
六、粪便标本 119
七、尿道及宫颈标本 120
八、痰液标本 120
九、支气管肺泡灌洗液标本 121
十、其他标本 121
第二节 标本采集前注意事项 122
一、肿瘤组织标本 122
二、血液标本 123
三、骨髓标本 124
四、体液标本 124
第三节 标本的稳定性 125
一、外周血标本 125
二、组织标本 125
三、其他标本 126
第四节 标本运输设备与条件 127
一、运输设备 127
二、运输条件 127
第五节 标本接收与处理 128
一、标本拒收标准与妥协 128
二、细胞富集／筛选 129
三、病原体富集和浓缩方法 129
第六节 标本储存 130
一、原始标本 130
二、 DNA标本 131
三、RNA标本 131
四、分离的细胞标本 131
第6章 分子诊断分析后的质量控制 133
第一节 基因变异及临床报告 133
一、基因变异及诊断依据 133
二、临床报告前涉及的内容 152
三、临床分子诊断检测流程及注意事项 155
第二节 报告模式与案例分析 160
一、肿瘤分子诊断结果报告 160
二、遗传病分子诊断结果报告 177
三、感染性疾病分子诊断结果报告 190
四、无创产前筛查结果报告 206
五、PGD／PGS检查结果报告 217
第7章 分析前与分析后的风险评估和过程管理 245
第一节 风险评估与过程管理 245
一、风险管理 245
二、过程管理 247
第二节 分子诊断实验室的分析前风险管理 249
一、风险识别 249
二、风险评估 250
三、风险控制和风险监控 251
第三节 分子诊断实验室的分析后风险管理 252
一、风险识别 252
二、风险评估 252
三、风险控制和风险监控 253
第8章 采集用具对检验结果的影响 254
第一节 样本采集用具的选择 254
一、血液标本 254
二、体液标本 256
三、组织标本 257
四、产前诊断标本 258
第二节 样本采集用具对检验结果的影响 259
一、真空采血管 259
二、其他采集器具 261
第9章 分子诊断实验室的生物安全 263
第一节 生物安全的概念及意义 263
一、概念 263
二、重要意义 264
第二节 分子诊断实验室生物安全的基本原则 265
一、科学合理 265
二、安全首位 265
三、管理严格 265
四、远离病原体 265
五、预防为主 266
第三节 生物安全操作及管理要求 266
一、样本采集、运输和保存 266
二、样本保存 269
三、标本的影响因素及前处理 270
第四节 分子诊断实验室的污染来源及防污染措施 270
一、污染主要来源 270
二、防污染措施 271
第五节 操作规程化的安全操作要点 273
一、一级和二级生物安全防护实验室 273
二、三级生物安全防护实验室 274
第六节 生物安全技术管理要素 276
一、实验室中标本的安全操作 276
二、标本容器的选用 276
三、标本在设施内的传递 276
四、标本接收 276
五、打开包装 276
六、移液管和移液辅助器的使用 276
七、避免感染性物质的扩散 277
八、生物安全柜的使用 277
九、避免皮肤和眼睛的接触 278
十、避免感染性物质的注入 278
十一、血清的分离 278
十二、离心机的使用 278
十三、匀浆器、摇床、搅拌器和超声处理器的使用 279
第10章 分子诊断的医学伦理 281
第一节 基因伦理学 282
一、基因诊断与法律法规 283
二、医学社会学问题 284
第二节 基因诊断的伦理问题 285
第三节 基因诊断医学伦理学涉及的主要问题 288
一、产前诊断的伦理研究 288
二、基因歧视问题 292
三、基因隐私问题 293
四、人类基因诊断与检测中的知情同意权问题 294
第四节 遗传病筛查的伦理问题 295
一、遗传筛查 296
二、出生后遗传病检测 297
第五节 临床分子诊断的医学伦理学案例分析 298
一、知情同意书 298
二、家庭信息泄露、保密并有责任告诫 299
三、不充分的基因检测 299