第一章 绪论 1
第一节 技术创新促进微生物学的进步与发展 1
第二节 微生物学研究技术 3
第三节 “组学”时代的微生物学 6
第二章 原核生物 11
第一节 原核生物的分类与系统学 11
第二节 细菌 15
第三节 古生菌 31
第四节 极端微生物 48
第三章 真核微生物 54
第一节 真核微生物的分类与系统发育 54
第二节 酵母菌 61
第三节 霉菌 66
第四节 蕈菌 80
第四章 无细胞结构生物——病毒 96
第一节 概述 96
第二节 噬病毒体 98
第三节 病毒生态学 105
第四节 新生病毒 113
第五章 微生物的代谢 121
第一节 微生物的代谢体系 121
第二节 代谢途径的调控 134
第三节 代谢流分析 142
第六章 微生物的遗传与育种 177
第一节 微生物基因组学 177
第二节 分子定向进化育种 196
第三节 基因组定点编辑技术 208
第七章 现代微生物生态学 228
第一节 现代微生物生态学的研究方法 228
第二节 微生物的多样性与微生物资源利用 247
第三节 微生物与生物地球化学循环 257
第四节 组学时代的微生物生态学 279
第八章 微生物的分类与鉴定 287
第一节 细菌种与物种形成 287
第二节 微生物分子鉴定技术 293
第三节 细菌鉴定实例 299
第四节 放线菌鉴定实例 309
第五节 酵母菌鉴定实例 315
第六节 真菌的分类与鉴定 320
第九章 微生物与食品 326
第一节 微生物与传统发酵食品 326
第二节 食品微生物快速检测技术 335
第三节 组学技术在食品安全中的应用 345
第四节 宏基因组学在食品工业中的应用 353
第十章 微生物与医药 360
第一节 抗生素 360
第二节 萜类化合物 370
第三节 甾体类化合物 376
第四节 微生物多糖 381
第五节 黄酮类化合物 391
第六节 生物活性肽 395
第七节 微生物产生的酶及酶抑制剂 396
第十一章 微生物与环境保护 398
第一节 环境微生物监测技术 398
第二节 微生物与水污染 405
第三节 微生物与大气污染 414
第四节 微生物对环境污染物的降解 416
第五节 微生物修复技术 435
第十二章 微生物与能源 440
第一节 生物质预处理及水解微生物 440
第二节 微生物与燃料乙醇 450
第三节 微生物与生物柴油 455
第四节 微生物与沼气发酵 462
第五节 微生物与生物制氢 470
第六节 微生物燃料电池 479
第十三章 微生物与农业 486
第一节 微生物农药 486
第二节 微生物肥料 500
第三节 微生物饲料 508
参考文献 515