第一章 基因、基因组与基因组学 1
第一节 基因 1
一、基因概念的提出与发展 1
二、基因的化学本质 2
三、DNA的分子结构 3
四、基因的组构 5
第二节 基因组 7
一、真核生物染色体基因组的特点 8
二、原核生物染色体基因组的特点 8
三、病毒基因组的特点 9
第三节 基因组学 9
一、结构基因组学 10
二、功能基因组学 11
三、比较基因组学 12
第二章 蛋白质、蛋白质组和蛋白质组学 13
第一节 蛋白质 13
一、蛋白质的一级结构 13
二、蛋白质的空间结构 14
三、蛋白质结构与功能的关系 17
第二节 蛋白质组与蛋白质组学 18
一、蛋白质组 18
二、蛋白质组学 19
三、蛋白质组学研究的技术方法 20
四、生物信息学在蛋白质学研究中的应用 24
第三章 DNA的生物合成 25
第一节 遗传学的中心法则和DNA复制的特点 25
一、遗传学的中心法则 25
二、DNA复制的特点 25
第二节 DNA复制的酶学 27
一、DNA聚合酶 27
二、DNA的超螺旋结构及拓扑异构酶 28
第三节 DNA生物合成过程 30
一、DNA复制的起始 30
二、DNA链的延长 31
三、DNA复制的终止 31
四、其他环状DNA分子的复制 32
第四节 DNA的损伤与修复 33
一、DNA的损伤 33
二、DNA损伤的修复 34
第四章 DNA的体外扩增与测序 36
第一节 聚合酶链反应 36
一、PCR基本原理 36
二、PCR反应体系 37
三、PCR反应条件 39
四、PCR扩增产物的分析 40
五、PCR技术应用进展 41
第二节 DNA测序技术 44
一、双脱氧链末端终止法 44
二、化学降解法 47
三、DNA自动化测序 48
四、DNA测序技术的应用 49
第五章 基因表达 51
第一节 RNA的生物合成 51
一、转录体系 51
二、转录过程 55
三、转录后的加工 57
第二节 蛋白质的生物合成 62
一、蛋白质合成体系 62
二、蛋白质的生物合成过程 65
三、真核生物与原核生物蛋白质合成的异同 73
四、蛋白质生物合成后的加工和运输 74
第六章 体外转录与翻译体系的建立 79
第一节 基因的体外转录 79
一、基因体外转录的基本原理 79
二、基因体外转录的意义及应用 80
第二节 基因的体外翻译 81
一、基因体外翻译的基本原理 81
二、基因体外翻译的应用 84
第七章 基因表达调控 86
第一节 基因表达调控基本概念 86
一、基因表达的规律 86
二、基因表达的方式 87
三、与基因表达调控相关的基本概念 88
四、基因表达的调控环节 88
五、基因表达调控的意义 89
第二节 原核生物基因表达调控 89
一、原核生物基因表达调控的特点 89
二、转录水平调控 90
三、原核基因在翻译水平的调控 94
第三节 真核生物基因表达的调控 95
一、真核生物基因表达调控的特点 95
二、DNA水平的调控 96
三、转录水平的调控 96
四、转录后水平的调控 99
五、翻译水平的调控 100
六、翻译后水平调控 100
第八章 表观遗传学 101
第一节 概述 101
一、表观遗传学基本概念 101
二、表观遗传学的研究内容 102
三、表观遗传学研究的意义 102
第二节 表观遗传学作用的机制 102
一、DNA甲基化 103
二、组蛋白修饰 104
三、染色质重塑 106
四、非编码RNA的调控 107
五、其他表观遗传机制 107
第三节 表观遗传学与人类疾病 108
一、表观遗传与癌症 108
二、表观遗传学与代谢综合征 108
三、表观遗传与自身免疫性疾病 108
四、表观遗传与心血管疾病 108
第九章 基因工程 110
第一节 基因工程的工具酶 110
一、限制性核酸内切酶 110
二、其他常用的工具酶 112
第二节 基因工程的载体 113
一、常用的克隆载体 114
二、常用的表达载体 118
第三节 基因工程的基本过程 119
一、目的基因的制备及常用分离方法 119
二、载体的选择和构建 120
三、目的基因与载体DNA的体外连接 120
四、重组DNA导入受体细胞 122
五、重组体的筛选与鉴定 123
六、外源基因的表达 124
第四节 基因工程的应用 126
一、定点诱变技术 126
二、基因诊断与基因治疗 126
三、遗传病的预防 126
四、基因工程药物、疫苗及抗体 127
五、基因靶向技术和转基因技术 127
第十章 转基因技术 128
第一节 转基因动物 128
一、转基因动物的基本原理与方法 128
二、转基因动物的检测 131
三、转基因动物的应用 131
第二节 转基因植物 132
一、基本原理及方法 132
二、转基因植物的应用 133
三、转基因植物的安全性评价 133
第十一章 SiRNA与MiRNA 135
第一节 RNAi及siRNA 135
一、RNA干涉的基本过程和共同特点 136
二、RNA干涉的功能及应用 139
三、RNAi技术的基本程序 141
第二节 MicroRNA和基因沉默 143
一、miRNA 143
二、循环miRNA 147
三、miRNA的生理功能 148
四、问题和展望 149
第十二章 基因靶向技术 151
第一节 基因靶向技术基础 151
一、同源重组 152
二、胚胎干细胞分离和体外培养 152
第二节 基因靶向技术的原理和方法 153
一、基因靶向技术的原理 153
二、常用于基因敲除的分子生物学方法 153
三、利用同源重组构建基因敲除小鼠模型的步骤 155
四、条件性基因敲除与诱导性基因敲除 158
第三节 基因靶向技术应用及前景 159
第十三章 基因诊断 162
第一节 基因诊断的基本技术 162
一、核酸分子杂交 162
二、聚合酶链式反应 165
三、DNA序列测定 167
第二节 基因诊断的基本策略 167
一、点突变的检测方法 167
二、基因缺失或插入的检测方法 167
三、基因重排的检测方法 167
四、基因扩增的检测方法 168
五、基因表达异常的检测方法 168
六、DNA多态性的检测方法 168
第三节 基因诊断的应用 168
一、在遗传性疾病中的应用 169
二、在恶性肿瘤中的应用 169
三、在感染性疾病中的应用 170
四、在法医学中的应用 170
第十四章 基因治疗 172
第一节 基因治疗的基本方法和程序 172
一、基因治疗的基本方法 172
二、基因治疗的基本程序 174
第二节 基因治疗的应用研究 178
一、在遗传性疾病中的应用研究 178
二、在恶性肿瘤中的应用研究 179
三、在心脑血管疾病中的应用研究 179
四、在病毒感染性疾病中的应用研究 180