前言 1
不得已 1
小引 3
卷上 5
请诛邪教状 5
与许青屿侍御书 7
辟邪论上 16
辟邪论中 23
辟邪论下 27
邪教三图说评 30
正国体呈稿 35
中星说 39
选择议 41
摘谬十论 43
附 始信录序 47
附 尊圣学疏 49
卷下 53
孽镜 53
引 53
孽镜 55
附 金乌玉兔辩 64
见界总星图 65
镜余 71
合朔初亏时刻辩 74
日食天象验 75
一叩阍辞疏 79
二叩阍辞疏 82
三叩阍辞疏 83
四叩阍辞疏 84
五叩阍辞疏 91
不得已辩 93
自叙 95
不得已辩 96
附 『藉历法行教』辩 133
附 中国初人辩 134
历法不得已辨 137
自序 139
总略 141
辨『依西洋新法』五字并中国奉西洋正朔 142
测验为诸辨之据 144
新法历遵圣旨为无庸辩之原 145
辨光先第一摘以为新法不用诸科较正之谬 148
辨光先第二摘以为新法一月有三节气之谬 150
辨光先第三摘以为新法二至长短之谬 151
辨光先第四摘以为新法夏至日行迟之谬 152
辨光先第五摘以为新法移寅宫箕三度入丑宫之谬 155
辨光先第六摘以为新法更调觜参二宿之谬 157
汤若望辨吴明烜原刻附后 160
辨颠倒参觜 160
辨光先第七摘以为新法删除紫气之谬 161
辨光先第八摘以为新法颠倒罗计之谬 162
汤若望辨吴明烜原刻附后 162
汤若望辨吴明烜原刻附后 164
辨光先第九摘以为新法黄道算节气之谬 166
辨光先第十摘以为新法止二百年之谬 167
辨昼夜一百刻之分 167
辨光先闰月之虚妄 170
合朔初亏先后之所以然 170
交食测验七政并凌犯历疏密 173
光先欺世饰罪 176
光先计图修历以掩奸欺 177
地为圆形实证 179
辨依赤道测验 185
新旧二历疏密 189
历日自相矛盾数端 191
附录一 195
不得已题记（钱大昕） 195
不得已题记（黄丕烈） 195
不得已跋（钱绮） 196
吹网录 一则（叶廷琯） 197
不得已题记（柳诒徵） 199
影印不得已序（方豪） 199
不得已辩提要（徐宗泽） 202
题印两种不得已辨序（方豪） 203
附录二 206
故前钦天监监正杨公光先别传（萧穆） 206
故前钦天监歙县杨公神道碑（萧穆） 210
清史稿·杨光先传 213
（康熙）歙县志·人物·杨光先 215
中国天主教史人物传·利类思、安文思（方豪） 215
清史稿·南怀仁传 221
中国天主教史人物传·南怀仁（方豪） 222
附录三 237
杨光先评传（陈占山） 237