自序系统生物学面面观世纪之交的生物学基础研究 2
生命的复杂性和复杂的生命科学 7
系统生物学面面观 14
生物系统的分子构建 24
后基因组时代的病毒研究 31
“活力论”的复活 35
合成生命之梦 45
走向新的综合：生命科学领域的小科学与大科学之关系 53
生物系统的复杂性与简单性 63
论Systems Biology的译名问题 70
横看成岭纵成峰——简论系统生物学的学派 78
新时代 大科学人类基因组学的新战略：人类全基因组的随机测序 86
并非咬文嚼字——蛋白质组概念的分析 93
新时代 大科学 98
蛋白质组研究：无尽的挑战 104
两种大科学的抉择 113
“生命之书”的解读 120
走出“基因决定论”的误区 130
最小基因组与生命起源 137
编撰人类基因组的“百科全书” 144
复杂的RNA与复杂的基因组 153
向生物小分子进军 160
后基因组时代的交叉科学后基因组时代的交叉科学：从Bio-X到X biology 168
抽象的价值——数学与当代生命科学 174
他山之石，可以攻“异”——化学遗传学漫谈 182
生命世界的“第三定律” 189
创造历史的人生命科学研究人才培养战略刍议 198
科学研究的动机 208
细胞周期的调控 211
模型·问题·方法 218
科学规划三问 225
通向生命科学未来的路线图 232
创造历史的人 242