绪论 1
第一节 分子诊断学的性质、任务和特点 1
第二节 分子诊断学的历史、现状及未来 1
一、分子诊断学的历史 1
二、分子诊断学的现状 2
三、分子诊断学的未来 4
第三节 本书概要 5
一、基因的特点和鉴别标准 9
第一节 基因组的功能单位——基因 9
第一章 基因组概论 9
第一篇 基础篇 9
二、基因大小 10
第二节 基因组 10
一、基因组大小与C值矛盾 10
二、基因总数与N值矛盾 11
第三节 基因组计划 12
一、HGP的主要研究内容 12
二、其他基因组计划 12
二、基因组学研究的意义 14
第四节 基因组学 14
一、基因组学的发展趋势 14
第二章 原核生物基因组 16
第一节 原核生物基因组的一般特征 16
一、原核生物基因组的结构 16
二、原核生物的类核结构 18
第二节 质粒 19
一、质粒的结构与理化性质 19
二、质粒的命名与分类 20
三、质粒的生物学特征 21
第三节 基因转移 22
一、基因转移的方式 22
二、原核生物的转座因子 23
第三章 真核生物基因组 25
第一节 真核生物染色体基因组 25
一、真核生物染色体基因组的一般特征 25
二、单拷贝基因 26
三、重复序列 26
四、基因家族与假基因 28
五、端粒和端粒酶 29
六、基因移动 29
七、果蝇基因组概述 30
第二节 染色体外的基因组——线粒体 30
一、线粒体DNA的结构 30
二、线粒体DNA的遗传特性 31
三、线粒体病 31
一、人类基因组概貌 32
第三节 人类基因组 32
二、人类基因组的多态性及在分子诊断中的应用 33
三、人类基因组研究 34
第四章 病毒基因组 37
第一节 病毒基因组的一般特征 37
一、病毒基因组的组成和分类 37
二、病毒基因组的大小 38
三、病毒基因组的结构特点 38
一、双链DNA病毒基因组 40
二、单链DNA病毒基因组 40
第二节 DNA病毒基因组 40
第三节 RNA病毒基因组 42
一、正链RNA病毒基因组 42
二、负链RNA病毒基因组 42
三、双链RNA病毒基因组 42
第四节 逆转录病毒基因组 44
一、逆转录病毒基因组的核苷酸组成 44
二、逆转录病毒基因组的结构 44
三、逆转录病毒基因组的末端结构 44
第五章 蛋白质组学 47
第一节 蛋白质组及蛋白质组学基本概念 48
一、蛋白质组 48
二、蛋白质组学 48
第二节 蛋白质组学研究的特点 48
一、整体性 48
二、揭示生命的动态性过程 49
三、体现生命现象的复杂性 49
第三节 蛋白质组学研究的内容及所采用的主要技术 49
一、蛋白质的分离 49
二、蛋白质的鉴定 50
四、蛋白质与蛋白质的相互作用 54
三、蛋白质-核酸间相互作用的研究 54
第四节 蛋白质组学在医学中的应用 57
一、恶性肿瘤 57
二、心脏病 57
三、传染病 57
第一节 核酸分离与纯化的设计与原则 61
一、核酸分离提取的原则 61
第六章 核酸的分离与纯化 61
第二篇 技术篇 61
二、技术路线的设计 62
三、核酸的鉴定和保存 62
第二节 基因组DNA的分离与纯化 64
一、基因组DNA分离与纯化的方法 64
二、DNA片段的回收 66
第三节 质粒DNA的提取与纯化 68
一、碱裂解法 68
二、煮沸裂解法 68
五、质粒DNA的纯化 69
三、SDS裂解法 69
四、其他方法 69
第四节 RNA的分离与纯化 70
一、RNA制备的条件与环境 70
二、总RNA提取的方法 71
三、mRNA的分离与纯化 72
第七章 重组DNA技术 74
第一节 工具酶 74
一、限制性核酸内切酶 75
三、DNA聚合酶 77
二、DNA连接酶 77
四、修饰酶 78
第二节 重组DNA技术常用的载体 79
一、常用的克隆载体 79
二、常用的表达载体 83
第三节 重组DNA 83
一、目的基因的制备 84
二、载体的选择与构建 84
三、目的基因与载体的连接 85
四、重组DNA导入宿主细胞 86
五、重组子的筛选与鉴定 87
六、外源基因的表达与分离纯化 88
第四节 重组DNA技术的应用 89
一、基因诊断 89
二、基因治疗 89
三、基因工程药物、疫苗和抗体 90
四、基因敲除和转基因技术 90
第八章 临床基因扩增检验技术 93
一、PCR反应原理 94
第一节 DNA聚合酶链反应 94
二、PCR反应的设计及影响因素 95
三、扩增产物的检测和分析 97
四、PCR衍生技术 99
第二节 荧光定量PCR 101
一、荧光的基础知识 102
二、荧光定量PCR的原理 103
三、荧光定量PCR中荧光产生机制 105
一、连接酶链反应 107
四、荧光定量PCR检测仪器 107
第三节 其他基因扩增检验技术 107
二、转录依赖的扩增系统 108
三、链替代扩增 109
四、分支DNA信号放大系统 110
五、杂交捕获系统 110
第四节 PCR检测技术的临床应用 112
一、PCR在病原微生物检测中的应用 112
二、PCR在遗传病中的应用 112
三、PCR在肿瘤中的应用 114
四、其他方面的应用 115
第五节 临床基因扩增检验实验室的管理规范 115
一、临床基因扩增检验实验室的设置 115
二、临床基因扩增检验实验室的质量保证 117
第九章 核酸分子杂交技术 121
第一节 核酸分子杂交的基本原理 121
一、核酸的变性与复性 121
一、常见的核酸探针 123
二、核酸分子杂交的基本原理 123
第二节 核酸探针 123
二、核酸探针的标记 124
三、核酸探针的检测 130
第三节 核酸分子杂交技术 133
一、传统的核酸分子杂交技术 133
二、原位杂交 135
三、液相核酸分子杂交 139
第十章 核酸测序技术 142
第一节 Sanger双脱氧链终止法 142
一、基本原理 142
二、测序反应体系的组成 143
三、Sanger双脱氧链终止法的特点 144
第二节 化学测序法 144
一、基本原理 144
二、测序反应体系的组成 144
一、已知序列的确证性测序策略 146
二、未知序列的从头测序策略 146
第三节 DNA测序策略 146
三、化学法的特点 146
第四节 DNA测序新技术 149
一、焦磷酸测序技术 149
二、杂交测序法 149
三、毛细管电泳法 149
四、流动式单分子荧光检测法 150
第五节 DNA自动化测序 150
一、激光测序法引物标记系统 150
二、激光测序法终止标记系统 151
第十一章 生物芯片技术 153
第一节 生物芯片概述 153
第二节 基因芯片 154
一、基因芯片的原理 154
二、基因芯片技术 154
三、基因芯片的应用 157
第三节 蛋白质芯片 159
一、蛋白质芯片的原理与分类 159
二、蛋白质芯片的制作和检测基本流程 160
三、蛋白质芯片的应用 161
第四节 芯片实验室 163
第一节 基因变异检测技术 165
一、PCR扩增阻碍突变系统 165
第十二章 其他分子诊断检测技术 165
二、寡核苷酸连接实验 167
三、温度梯度凝胶电泳和变性梯度凝胶电泳 169
四、变性高效液相色谱法 170
五、错配接合蛋白质截短测试法 173
第二节 脉冲电场凝胶电泳 174
一、PFGE的原理 175
二、PFGE的种类 175
三、PFGE的应用 176
第三节 分子影像 177
一、分子影像探针 177
二、分子影像学技术 178
三、分子影像的应用 180
一、生物信息学的定义 182
二、生物信息学的发展历史 182
第一节 生物信息学概论 182
第十三章 生物信息学在分子诊断中的应用 182
三、生物信息学的发展趋势 183
第二节 生物信息数据库 183
一、重要生物信息中心简介 183
二、数据库检索 186
第三节 核酸数据分析 190
一、核酸序列的基础分析 190
二、开放阅读框预测 190
三、序列比对 192
四、引物设计 196
第四节 蛋白质数据分析 197
一、蛋白质基本性质分析 197
二、蛋白质功能预测 197
三、蛋白质结构预测 199
第三篇 应用篇 205
第十四章 感染性疾病的分子诊断 205
第一节 总论 205
一、感染性疾病分子诊断的策略 205
三、感染性疾病分子诊断的标本处理 206
二、感染性疾病分子诊断的常用方法 206
四、感染性疾病分子诊断的结果解释 208
五、感染性疾病分子诊断的临床应用及评价 208
第二节 病毒的基因检测 209
一、乙型肝炎病毒 209
二、丙型肝炎病毒 211
三、人类乳头瘤病毒 213
四、人类免疫缺陷病毒 215
五、单纯疱疹病毒 217
六、巨细胞病毒 219
第三节 病原菌的基因检测 221
一、结核分枝杆菌 221
二、金黄色葡萄球菌 223
三、幽门螺杆菌 225
四、O157型大肠埃希菌 227
五、淋病奈瑟菌 228
第四节 其他常见病原微生物的基因检测 230
一、沙眼衣原体 230
二、解脲脲原体 231
三、梅毒螺旋体 232
第十五章 遗传性疾病的分子诊断 235
第一节 遗传性疾病分子诊断的策略 235
一、直接诊断策略 235
二、基因多态性连锁分析 236
三、基因突变的定量诊断 236
第二节 遗传病的分子诊断 237
一、血红蛋白病 237
二、血友病 241
三、肌营养不良症 244
四、苯丙酮尿症 247
五、囊性纤维化 249
六、亨廷顿病 253
七、脆性X综合征 254
第三节 产前（包括胚胎植入前）遗传缺陷的分子诊断 256
一、染色体异常分子诊断 256
二、单基因病的产前（植入前）分子诊断 257
一、复杂性疾病分子诊断的定义和原理 259
第一节 复杂性疾病的分子诊断策略 259
第十六章 复杂性疾病的分子诊断 259
二、复杂性疾病分子诊断常用的检测标本 260
三、分子诊断的常用方法与思路 261
第二节 肿瘤的分子诊断 262
一、肿瘤的发病机制 262
二、肿瘤早期分子诊断及预后 268
三、分子检测在肿瘤筛查中的应用 274
四、肿瘤微小残留病的分子检测 274
第三节 原发性高血压 277
一、原发性高血压的分子遗传 277
二、原发性高血压的分子诊断 278
第十七章 分子诊断的其他应用 280
第一节 分子诊断在器官移植中的应用 280
一、HLA遗传学基础 280
二、组织配型中的DNA分型技术 283
三、HLA配型在器官移植中的应用 285
一、亲子鉴定 286
第二节 分子诊断在法医学鉴定中的应用 286
二、个人识别 292
第三节 分子诊断在细菌耐药基因检测及医院感染控制中的应用 293
一、在细菌耐药基因检测中的应用 294
二、在医院感染控制中的应用 300
第十八章 分子诊断实验室的质量管理及标准化 302
第一节 分子诊断实验室质量管理 302
一、质量管理体系的概念 302
二、质量管理体系的构成 302
三、质量体系四要素之间的内在联系 306
第二节 分子诊断实验的标准化 307
一、标准化 307
二、标准化组织 307
三、标准品和质控品 308
四、分子诊断测定方法的标准化 308
五、分子诊断实验标准化程序 309
参考文献 310
相关网站 315
中英文名词索引 316