《医学革命论》第一版自序 1
《医学革命论》第二版自序 3
《医学革命论》第三版自序 5
我国医学革命之破坏与建设 6
对于医学前途之希望 16
团结 17
在思想改造中怎样向科学学习 22
中医科学化途中存在着麻痹和恐惧问题 24
第一部分 中医理论研究与批判 26
《灵素》商兑 26
伤寒发挥 47
温热发挥 65
六气论 73
论六气六淫 77
论湿 79
痰说 83
饮说 88
非科学医的鉴别诊断 92
与中医学会论脉书 97
寸口诊脉的讨论 100
论孕脉的妄诞 107
“不可不……，不可尽……” 109
夹阴伤寒辨 114
血晕说 116
百之斋随笔 118
伪医燃犀录 132
与恽铁樵论《群经见智录》第一书 134
与恽铁樵论《群经见智录》第二书 139
《伤寒论研究》辨惑 142
驳俞鉴泉经脉血管不同说 156
答潘君骥书 159
中风辨谬 161
驳若定氏《由西医疗法的涉讼再谈到中医疗法》 166
柬陆某 168
第二部分 对中医界的批评与废止中医案 170
对于国医馆的我见 170
与陆君渊雷论《国医药学术整理大纲草案》书 173
答陆渊雷先生书 184
中华民国医药学会上五院长论国医馆书 186
旧医《上五院长书》驳议 189
对于焦易堂《为采行国医条例告国人书》之商榷 194
对于制定《国医条例》责成中央国医馆管理国医案之意见 214
废止旧医以扫除医事卫生之障碍案 217
旧医学校系统案驳议 219
致全国各省教育会书 223
致全国教育联合会电 227
致《时事新报》沧波先生书 228
再致《时事新报》沧波先生书 230
毁淫祠与医学革命 233
异哉旧医之举动 234
意志薄弱 236
医学之真伪 237
呜呼中西医院 237
论日本皇汉医学会 238
“一变至鲁”之一部旧医界 239
暗中活动 240
旧医必亡 240
不解 241
感想 242
第三部分 本草研究 244
科学的国产药物研究之第一步 244
研究国产药物刍议 253
宋元以后本草药理论概要 259
毒药辨 262
研究中药的方向和顺序 264
《社会医报》五周纪念国产药物专号征文启 269
《神农本草》三品异同考 270
读《千金方》札记 274
读《千金翼方》札记 275
评《一本堂药选》 278
苹果疗法之回顾及我们应有之努力 282
国货年中国人所应有之注意 283
第四部分 中国医学史研究 286
医史学与医学前途之关系 286
撰述医学史之我见 292
答范行准书 297
《古代疾病名候疏义》自序 302
中华旧医结核病观念变迁史 306
中国淋病医案之第一例——《左传》晋平公疾之研究 312
霍乱沿革说略 315
霍乱沿革补遗 317
麻疹言古 318
猩红热与中国旧医学 323
痢疾源流考略 328
第五部分 医疗卫生的文化批评 331
《医药评论》创刊号缘起 331
双十节之新医与社会 333
急须设法增加全国医师人数以利卫生行政之进展案 334
对于教育部第1123号批之感想 336
医学教育方针案 338
我所希望于主张医学教育者 339
全国医师联合会之最大任务 341
卫生行政之注意 342
全国医师联合会闭幕后之感想 342
今后之医育问题 343
中央卫生委员会会议 343
新医与《社会汇刊》序 344
《上海市医师公会年鉴》序 345
劝速组地方医师会启 346
时事感言 347
时疫——社会应有之觉悟 349
新节气论及旧气化论（节选） 350
对于各时疫医院的希望 351
《痢疾专刊》之所以 351
麻疹感言 352
时令病自疗的商榷 353
包天白君商榷献疑 355
鼠疫流行之噩耗 358
垃圾 358
自立 359
浙西之疫……医育 359
提倡病理解剖知识之普及 360
劝告全国医师组织“病理解剖有志会”案 361
读《余子维先生遗嘱解剖尸体记事书》后 362
闻余子维先生遗嘱解剖遗骸事敬告国人 365
与陈律师论法医剖验书 369
砭新医 371
医生相轻 371
医德 371
医分四等说 372
广告 372
箴病人 374
不能忍耐 374
不重预防 374
不肯摄养 375
畏疑新医 376
医学正俗 378
强擤鼻涕之害 378
共食制与肺痨 378
乳 379
花柳病之识别 381
不妊（节选） 382
拒毒与国民病 383
《民众医药汇刊》序 384
诊余常谈 385
病（节选） 386
新闭关主义 387
我所希望于新闻界 388
首都卫生运动大会感想 389
颂《华北医报》 390
庸医与庸官 390
醉汉心理与国人心理 391
老人心理与国民心理 391
《新医与社会》发刊词 392
提倡研究 392
《社会医报》三周年纪念征文启 393
医客 393
医学革命之真伪 394
矛盾 395
议人不议事 395
《社会医报》第二周年感言 396
《社会医报》四周年纪念征文启 397
《药理学》序 398
第六部分 序类 398
《各病注射疗法大全书》序 399
《内科全书》序 400
《外科总论》序 403
《传染病全书》序 404
医学小丛书：《肺病预防及疗养法》序 405
医学小丛书：《传染病》序 406
医学小丛书：《微生物》序 407
《近世花柳病学》序 408
《性病学》序 409
《生药学》序 410
《新纂药物学》序 411
《世界各国新药集》序 412
《临证秘典》序 413
《育儿卫生常识》序 414
《科学达生编》序 415
宋君恪三《医学辞源》序 416
附录 417
一、处理旧医实施步骤草案（余云岫 宋大仁 江晦鸣） 417
二、《余氏医述》跋一（庞京周） 420
三、有关祖父的二三事（余忾） 421
四、“执来日新药之牛耳者，舍我国而谁属哉？”（余曰封） 424
注释 427