第1章 R基础 1
1.1安装包 1
1.2加载包 2
1.3加载分隔符式的文本文件 2
1.4从Excel文件中加载数据 4
1.5从SPSS文件中加载数据 5
第2章 快速探索数据 6
2.1绘制散点图 6
2.2绘制折线图 8
2.3绘制条形图 9
2.4绘制直方图 11
2.5绘制箱线图 13
2.6绘制函数图像 14
第3章 条形图 16
3.1绘制简单条形图 16
3.2绘制簇状条形图 19
3.3绘制频数条形图 21
3.4条形图着色 23
3.5对正负条形图分别着色 24
3.6调整条形宽度和条形间距 26
3.7绘制堆积条形图 28
3.8绘制百分比堆积条形图 31
3.9添加数据标签 33
3.10绘制Cleveland点图 37
第4章 折线图 42
4.1绘制简单折线图 42
4.2向折线图添加数据标记 44
4.3绘制多重折线图 45
4.4修改线条样式 49
4.5修改数据标记样式 50
4.6绘制面积图 52
4.7绘制堆积面积图 54
4.8绘制百分比堆积面积图 56
4.9添加置信域 58
第5章 散点图 60
5.1绘制基本散点图 60
5.2使用点形和颜色属性，并基于某变量对数据进行分组 62
5.3使用不同于默认设置的点形 64
5.4将连续型变量映射到点的颜色或大小属性上 66
5.5处理图形重叠 69
5.6添加回归模型拟合线 74
5.7根据己有模型向散点图添加拟合线 78
5.8添加来自多个模型的拟合线 81
5.9向散点图添加模型系数 84
5.10向散点图添加边际地毯 87
5.11向散点图添加标签 88
5.12绘制气泡图 92
5.13绘制散点图矩阵 94
第6章 描述数据分布 99
6.1绘制简单直方图 99
6.2基于分组数据绘制分组直方图 101
6.3绘制密度曲线 104
6.4基于分组数据绘制分组密度曲线 107
6.5绘制频数多边形 109
6.6绘制基本箱线图 110
6.7向箱线图添加槽口 112
6.8向箱线图添加均值 113
6.9绘制小提琴图 114
6.10绘制Wilkinson点图 117
6.11基于分组数据绘制分组点图 119
6.12绘制二维数据的密度图 120
第7章 注解 123
7.1添加文本注解 123
7.2在注解中使用数学表达式 126
7.3添加直线 127
7.4添加线段和箭头 129
7.5添加矩形阴影 131
7.6高亮某一元素 132
7.7添加误差线 133
7.8向独立分面添加注解 136
第8章 坐标轴 139
8.1交换x轴和y轴 139
8.2设置连续型坐标轴的值域 140
8.3反转一条连续型坐标轴 143
8.4修改类别型坐标轴上项目的顺序 144
8.5设置x轴和y轴的缩放比例 145
8.6设置刻度线的位置 147
8.7移除刻度线和标签 148
8.8修改刻度标签的文本 149
8.9修改刻度标签的外观 151
8.10修改坐标轴标签的文本 153
8.11移除坐标轴标签 154
8.12修改坐标轴标签的外观 155
8.13沿坐标轴显示直线 157
8.14使用对数坐标轴 158
8.15 为对数坐标轴添加刻度 163
8.16绘制环状图形 165
8.17在坐标轴上使用日期 169
8.18在坐标轴上使用相对时间 172
第9章 控制图形的整体外观 174
9.1设置图形标题 174
9.2修改文本外观 176
9.3使用主题 178
9.4修改主题元素的外观 180
9.5创建自定义主题 183
9.6隐藏网格线 184
第10章 图例 185
10.1移除图例 185
10.2修改图例的位置 187
10.3修改图例项目的顺序 188
10.4反转图例项目的顺序 190
10.5修改图例标题 191
10.6修改图例标题的外观 193
10.7移除图例标题 194
10.8修改图例标签 195
10.9修改图例标签的外观 198
10.10使用含多行文本的标签 199
第11章 分面 200
11.1使用分面将数据分割绘制到子图中 200
11.2在不同坐标轴下使用分面 202
11.3修改分面的文本标签 204
11.4修改分面标签和标题的外观 206
第12章 配色 207
12.1设置对象的颜色 207
12.2将变量映射到颜色上 208
12.3对离散型变量使用不同的调色板 210
12.4对离散型变量使用自定义调色板 214
12.5使用色盲友好式的调色板 215
12.6对连续型变量使用自定义调色板 217
12.7根据数值设定阴影颜色 218
第13章 其他图形 221
13.1绘制相关矩阵图 221
13.2绘制函数曲线 224
13.3在函数曲线下添加阴影 225
13.4绘制网络图 227
13.5在网络图中使用文本标签 230
13.6如何绘制热图 232
13.7绘制三维散点图 234
13.8在三维图上添加预测曲面 237
13.9保存三维图 240
13.10三维图动画 241
13.11绘制谱系图 241
13.12绘制向量场 244
13.13绘制QQ图 248
13.14绘制经验累积分布函数图 249
13.15 创建马赛克图 250
13.16绘制饼图 254
13.17创建地图 255
13.18绘制等值区域图 258
13.19创建空白背景的地图 262
13.20基于空间数据格式（shapefile）创建地图 263
第14章 输出图形用以展示 266
14.1输出为PDF矢量文件 266
14.2输出为SVG矢量文件 267
14.3输出为WMF矢量文件 268
14.4编辑矢量格式的输出文件 268
14.5输出为点阵（PNG/TIFF）文件 270
14.6在PDF文件中使用字体 272
14.7在Windows的点阵或屏幕输出中使用字体 274
第15章 数据塑形 276
15.1创建数据框 277
15.2从数据框中提取信息 277
15.3向数据框添加列 278
15.4从数据框中删除一列 279
15.5重命名数据框的列名 279
15.6重排序数据框的列 280
15.7从数据框提取子集 281
15.8改变因子水平的顺序 283
15.9根据数据的值改变因子水平的顺序 284
15.10改变因子水平的名称 285
15.11去掉因子中不再使用的水平 287
15.12在字符向量中改变元素的名称 287
15.13把一个分类变量转化成另一个分类变量 288
15.14连续变量转变为分类变量 290
15.15 变量转换 291
15.16按组转换数据 293
15.17分组汇总数据 295
15.18使用标准误差和置信区间来汇总数据 300
15.19把数据框从“宽”变“长” 303
15.20把数据框从“长”变“宽” 305
15.21把时间序列数据对象拆分成时间和数据 306
附录A ggplot2介绍 309
A.1背景知识 309
A.2若干术语和理论 313
A.3构建一幅简单图形 314
A.4打印输出 317
A.5统计变换 317
A.6主题 317
A.7结语 317