《生物基因组进化密码子的使用》PDF下载

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  • 作  者:王志坚,王芳平著
  • 出 版 社:北京:国防工业出版社
  • 出版年份:2014
  • ISBN:9787118093667
  • 页数:120 页
图书介绍:本书主要讨论了基因组中密码对的偏好使用与基因组进化之间的相关性问题。首先以110种生物基因组为样本,分析了编码序列中密码对和基因间序列中三联体对的相对模式数随频数的分布。随后分别以密码对使用的偏好性和密码对中二核苷酸频率构建系统发育树来探索两组信息参数与生物基因组进化之间的相关性。最后全面分析了厌氧性粘菌密码对的使用,讨论了其密码对偏好的可能机制。

第1章 绪论 1

1.1 引言 1

1.2 密码子研究的发展 2

参考文献 13

第2章 密码对使用研究的理论方法 20

2.1 密码对相对模式数随频数的分布和分布模型拟合理论 20

2.2 基于密码对使用偏好性的基因组相似性分析方法 24

2.3 密码对使用在DNA双链上的不对称性分析方法 26

2.4 线性相关分析 28

2.5 依赖上下文关系的密码对使用偏好性 28

参考文献 32

第3章 密码对的相对模式数分布与基因组进化 34

3.1 数据资料 34

3.2 分析方法 35

3.3 结果和讨论 36

3.4 结论 46

参考文献 47

第4章 基于密码对使用的基因组相似性研究 50

4.1 数据资料 50

4.2 分析方法 52

4.3 结果和讨论 52

4.4 总结 59

参考文献 60

第5章 DNA双链密码对使用的不对称性 62

5.1 数据资料 62

5.2 分析方法 63

5.3 结果和讨论 63

5.4 总结 66

参考文献 67

第6章 密码对的偏倚与基因组进化的线性相关分析 71

6.1 数据资料 71

6.2 分析方法 71

6.3 结果和讨论 73

6.4 总结 77

参考文献 77

第7章 密码对的使用偏好性与基因组进化 79

7.1 数据资料 80

7.2 分析方法 80

7.3 结果和讨论 80

7.4 总结 89

参考文献 89

第8章 依赖上下文关系的密码对使用偏好性 92

8.1 数据资料 93

8.2 分析方法 93

8.3 结果 94

8.4 讨论 97

参考文献 98

附录 102