第一篇 总论 2
第一章 概述 2
第一节 军团菌 2
第二节 军团菌病内容与范畴 2
一、军团菌病 2
二、军团菌病分类 3
第三节 军团菌病的危害 3
第四节 军团菌病诊断标准 4
一、诊断原则 4
二、诊断标准 4
第二章 我国军团菌病的现况与控制对策 7
第一节 军团菌病变迁 7
一、首次证明军团菌肺炎 7
二、首次证明军团菌感染引起庞蒂亚克热 7
三、军团菌病是一种新发现的疾病 8
第二节 军团菌病的现状 8
一、军团菌病国外流行概况 8
二、军团菌病国内流行概况 9
第三节 控制军团菌病的策略 10
一、对传染源的措施 10
二、切断传播途径 12
三、保护易感人群 12
第三章 军团菌病的流行病学 14
第一节 军团菌病的传播与流行 14
一、传染源 16
二、传播途径 16
三、人群易感性 16
四、发病率与病死率 17
五、季节分布 17
六、地区分布 17
七、军团菌病人群（年龄）分布特征 18
八、流行病学分类 18
九、流行因素 19
十、流行形式 19
第二节 军团菌病的流行病学调查 20
一、总体原则 20
二、调查对象 20
三、调查内容和方法 21
第四章 军团菌病流行病学与菌株分型方法 23
第一节 军团菌病流行与菌株分型 23
第二节 军团菌血清分型 25
第三节 嗜肺军团菌分子分型 26
一、脉冲场凝胶电泳分型 27
二、多位点序列分型 28
三、扩增片段长度多态性分型 29
四、随机引物扩增多态性DNA分型 30
五、嗜肺军团菌毒力岛分子分型 31
六、核糖体基因分型 31
第五章 军团菌病的预防 34
第一节 群体预防 34
一、自我防护 34
二、健康教育 34
第二节 公共环境水源军团菌监测 34
一、公共环境水源军团菌监测的总体原则 34
二、医院冷热水系统军团菌监测 36
三、冷却塔军团菌监测 39
第六章 军团菌的微生态学 43
第一节 微生态的形成 43
一、细菌的演变 43
二、微生态的构成 43
第二节 细胞内生命循环 44
一、细胞内生命循环 44
二、微生态失调 45
第二篇 军团菌 48
第七章 军团菌属 48
第一节 军团菌的一般特征 48
一、军团菌分类 48
二、亚型分布与鉴定 49
第二节 军团菌分类与命名 49
一、军团菌属 49
二、军团菌属分类命名 49
第三节 嗜肺军团菌血清学分型 54
第四节 嗜肺军团菌分子分型 56
一、扩增片段长度多态性基因分型 56
二、脉冲场凝胶电泳基因分型 57
三、基因测序分型 57
第八章 嗜肺军团菌 60
第一节 嗜肺军团菌的生命周期、生长周期和发育周期 60
一、前言 60
二、嗜肺军团的生命周期 61
三、嗜肺性军团菌生长周期 64
四、嗜肺军团菌的发育周期 65
五、结束语 68
第二节 嗜肺军团菌基因组 69
一、嗜肺军团菌基因组的一般特征 69
二、嗜肺军团菌的泛基因组 70
三、宿主—病原体相互作用——嗜肺军团菌基因组的独有特征 71
四、由基因组序列推导出的代谢相关功能 78
五、基因组中的调节和信号转导 79
六、嗜肺军团菌的比较基因组学 80
七、比较基因组学——军团菌、柯克斯体和其他胞内致病菌 82
第三节 嗜肺军团菌的分泌系统 83
一、分泌系统的概述 83
二、嗜肺军团菌蛋白跨越细胞质膜（内膜）的途径 85
三、嗜肺军团菌的分泌系统 87
四、主要效应蛋白及其作用 90
第四节 嗜肺军团菌毒力岛、毒力因子 95
一、毒力岛基因结构及其致病性 95
二、毒力因子基因结构及其致病性 97
三、毒力岛与毒力因子致病机制 99
第九章 其他常见致病性军团菌种 104
第一节 博兹曼军团菌 104
一、生物学特性 104
二、致病性 105
三、细菌培养与鉴定 105
第二节 长滩军团菌 106
一、生物学特性 106
二、致病性 106
三、细菌培养与鉴定 108
第三节 菲氏军团菌 108
一、生物学特性 108
二、致病性 109
三、细菌培养与鉴定 109
第四节 海伦山军团菌 110
一、生物学特性 110
二、致病性 111
三、细菌培养与鉴定 111
第五节 杜氏军团菌 112
一、生物学特性 112
二、致病性 113
三、细菌培养与鉴定 113
第六节 麦氏军团菌 114
一、生物学特性 114
二、致病性 115
三、细菌培养与鉴定 116
第七节 约旦军团菌 117
一、生物学特性 117
二、致病性 118
三、细菌培养与鉴定 118
第八节 沃氏军团菌 119
一、生物学特性 119
二、致病性 120
三、细菌培养与鉴定 121
第九节 哈氏军团菌 122
一、生物学特性 122
二、致病性 122
三、细菌培养与鉴定 123
第十节 马氏军团菌 124
一、生物学特性 124
二、致病性 124
三、细菌培养与鉴定 125
第十一节 伯明翰军团菌 126
一、生物学特性 126
二、致病性 126
三、细菌培养与鉴定 127
第十二节 辛辛那提军团菌 128
一、生物学特性 128
二、致病性 128
三、细菌培养与鉴定 129
第十三节 戈氏军团菌 130
一、生物学特性 130
二、致病性 131
三、细菌培养与鉴定 131
第十四节 图森军团菌 132
一、生物学特性 133
二、致病性 133
三、细菌培养与鉴定 134
第十五节 茴芹军团菌 135
一、生物学特性 135
二、致病性 135
三、细菌培养与鉴定 136
第十六节 兰辛军团菌 138
一、生物学特性 138
二、致病性 138
三、细菌培养与鉴定 139
第十七节 红荧光军团菌 140
一、生物学特性 140
二、致病性 141
三、细菌培养与鉴定 141
第十八节 巴黎军团菌 142
一、生物学特性 142
二、致病性 143
三、细菌培养与鉴定 143
第十九节 橡树岭军团菌 144
一、生物学特性 145
二、致病性 145
三、细菌培养与鉴定 146
第二十节 圣灵军团菌 147
一、生物学特性 147
二、致病性 147
三、细菌培养与鉴定 148
第二十一节 昆氏军团菌 149
一、生物学特性 149
二、致病性 149
三、细菌培养与鉴定 150
第二十二节 吉斯特军团菌 151
一、生物学特性 151
二、致病性 151
三、细菌培养与鉴定 152
第三篇 军团菌病 158
第十章 军团菌病的临床 158
第一节 军团菌病的临床特点 158
一、军团菌肺炎临床表现 159
二、临床特征 160
三、军团菌病的病原体 160
四、易感因素 161
第二节 军团菌病的治疗 162
一、治疗原则——军团菌诊断标准及处理原则WS195—2001 162
二、治疗策略 163
三、治疗方案 164
四、其他 165
第三节 军团菌病的实验室诊断方法 166
一、实验室检查 166
二、诊断和鉴别诊断 171
第四节 军团菌病的影像学诊断 173
第五节 医院和社区获得性军团菌肺炎——同一疾病的2个方面 177
第六节 军团菌病死亡的危险因素 178
第七节 军团菌病潜伏期、发病期和初期的症状 179
第八节 用左氟沙星和阿奇霉素成功治疗重症军团菌病 180
第九节 各种抗生素体外抗军团菌活性 181
一、抗生素体外抗军团菌活性 181
二、相关文献报道 183
第十节 体内抗嗜肺军团菌活性研究 185
一、细胞内抗嗜肺军团菌药物有效浓度测定 185
二、大环内酯类和氟喹诺酮类药物对细胞内嗜肺军团菌的作用 187
三、其他 188
第十一节 并发症和预后 189
一、并发症 189
二、预后 189
第十二节 嗜肺军团菌与非嗜肺军团菌社区获得性肺炎的临床对比分析 189
第十一章 军团菌病的诊断 194
第一节 PCR法诊断军团菌病 194
一、引物设计和合成 194
二、试验方法 195
三、应用 197
第二节 实时PCR结合微量凝集试验早期诊断军团菌感染 202
第三节 反向斑点杂交法快速检测嗜肺军团菌 203
第四节 酶标法和荧光定量PCR检测儿童下呼吸道嗜肺军团菌感染 204
第五节 环介导等温扩增法检测军团菌 205
一、方法简介 205
二、应用 205
第六节 各方法的实际应用 209
第十二章 军团菌病的临床流行病学 212
第一节 军团菌病血清流行病学调查与现场杀菌的初步观察 212
第二节 嗜肺军团菌与非嗜肺军团菌所致社区获得性肺炎的临床对比分析 214
第三节 长滩军团菌引起的感染 216
第四节 旅行相关军团菌病 217
第五节 新生儿军团菌病 221
一、国外流行情况 222
二、国内流行情况 222
第六节 老年军团菌肺炎的相关危险因素分析 223
第七节 重症军团菌肺炎病例分析 225
一、12例重症军团菌肺炎回顾性分析 225
二、重症军团菌肺炎16例临床分析 227
第八节 军团菌分子分型方法在流行病学调查中的应用 228
一、脂肪酸分型 228
二、核糖体基因分型法 229
三、基于电泳的分子指纹图谱技术 229
四、直接测序分型技术（SBT） 230
第九节 MLVA方法在军团菌分子分型中的应用评价 231
第十节 扩增片段长度多态性分析在军团菌分型中的应用 232
第十一节 中国分离嗜肺军团菌株脉冲场凝胶电泳分型及其数据库的建立 234
第十二节 嗜肺军团菌血清1型菌株流行情况 238
一、嗜肺军团菌血清1型及分子分型研究 238
二、LP1菌株随机扩增多态性DNA指纹图谱研究 239
三、我国九省（市、区）82株嗜肺军团菌血清1型菌株的序列分型 239
四、嗜肺军团菌血清1型环境分离株的脂肪酸成分分析及其应用 241
第十三节 中欧军团菌病流行情况 242
第十四节 西班牙军团菌流行情况 243
第十五节 日本军团菌病流行情况 247
第十六节 韩国军团菌的分布 250
一、军团菌的血清学分布情况 251
二、军团菌地理分布分析 251
三、军团菌种属与设施类型 251
第十七节 新加坡环境监测和分子分型研究 253
第十八节 美国及其他国家军团菌病流行情况 253
一、美国 253
二、其他国家 254
第十九节 国内军团菌病流行情况 254
一、暴发流行 254
二、抗体水平研究 256
第二十节 澳门地区公共场所军团菌的检出和脂肪酸分型研究 257
一、采样和军团菌的检测 258
二、结果 260
三、讨论 264
第二十一节 在患者和环境水中军团菌基因型的分布和相关性 266
第二十二节 军团菌活菌检测 268
第二十三节 军团菌病的暴发、监测和预防 271
一、LD的暴发 271
二、LD监测 272
三、流行病学研究 272
四、预防 273
第十三章 军团菌病与机体免疫 278
第一节 先天性免疫与获得性免疫 278
一、引言 278
二、军团菌免疫原 278
三、嗜肺军团菌的固有免疫反应 279
四、嗜肺军团菌感染的适应性免疫 280
五、军团菌感染的获得性免疫反应 281
六、军团菌抗原的加工和提呈 281
七、免疫机制 282
八、结论 285
第二节 军团菌的先天免疫 286
一、Toll样受体在军团菌免疫中的作用 288
二、军团菌感染后产生的细胞因子 289
三、活化的巨噬细胞限制军团菌生长 290
四、未来研究方向 291
第三节 军团菌的先天免疫和Toll样受体 291
一、简介 292
二、军团菌结构 292
三、结论 295
第四节 抗军团菌的免疫活化 295
一、前言 295
二、天然抗原的免疫刺激 296
三、儿茶素的抗菌与抗病毒效应 296
四、天然产物对细胞因子的调节 297
五、军团菌感染后儿茶素在树突状细胞产生细胞因子方面的作用 297
六、军团菌感染后儿茶素在树突状细胞产生共刺激分子方面的作用 297
第四篇 军团菌病实验室诊断技术 300
第十四章 痰液常规检查 300
第一节 痰液采集与性状检验 300
一、痰液采集 300
二、性状检查 300
第二节 显微镜检查 301
一、痰液细菌涂片检查 301
二、细胞学检查 301
第十五章 军团菌尿抗原测定 302
第一节 免疫层析法检测尿军团菌抗原 302
一、基本原理 302
二、试剂盒组成 303
三、试验方法 303
四、质量控制 303
五、结果报告 304
六、临床意义 304
七、试验注意事项 304
第二节 酶联免疫吸附试验检测军团军尿抗原 305
一、工作原理 305
二、试剂制备 305
三、尿抗原ELISA检测程序 306
第十六章 军团菌抗原和抗体测定 309
第一节 直接免疫荧光法检测军团菌抗原 309
一、基本原理 309
二、荧光抗体制备 309
三、试验方法 310
四、结果判断 310
第二节 间接免疫荧光法检测军团菌抗体 310
一、基本原理 310
二、细菌抗原制备 310
三、羊抗人IgG、IgM荧光抗体制备 311
四、试验方法 311
五、临床意义 311
第三节 酶联免疫吸附试验检测军团菌IgG、IgM抗体 312
一、试验原理 312
二、试剂组成和配制 312
三、操作步骤 314
四、结果判断 314
五、临床意义 314
第四节 军团菌抗体检测商售试剂盒的应用 315
一、方法原理 315
二、试剂组成 315
三、标本要求 316
四、试验前准备 316
五、操作步骤 316
六、结果判定 317
七、诊断意义 317
八、注意事项 318
第五节 乳胶凝集试验快速鉴定嗜肺军团菌 318
一、基本原理 319
二、样本收集和准备 319
三、试验方法 319
四、注意事项 320
五、试剂保存 320
第六节 微量凝集试验测定嗜肺军团菌抗体 320
一、抗原制备 320
二、微量凝集试验 321
三、诊断意义 321
第十七章 军团菌分离培养与鉴定 323
第一节 标本采集与运送 323
一、临床标本采集 323
二、环境水样采集 323
三、标本运输 324
第二节 标本处理原则和方法 325
一、标本处理原则 325
二、临床标本处理方法 326
三、水样标本处理方法 326
第三节 分离培养与初步鉴定 327
一、军团菌选择性分离培养基 327
二、接种 328
三、孵育培养 328
四、初步鉴定 329
第四节 生化试验鉴定 329
一、基本原理 329
二、试验方法 329
三、军团菌属生化试验特征 333
四、利用碳源反应鉴定军团菌种 338
第五节 细胞脂肪酸成分分析 341
一、基本原理 341
二、试验方法 342
三、临床应用 343
第六节 血清型鉴定 349
一、军团菌家兔免疫血清制备 349
二、乳胶凝集试剂的制备及其应用 351
三、协同凝集试验试剂的制备及其应用 353
第十八章 抗菌药物敏感性试验 357
第一节 准则 357
一、药敏试剂和方法标准化 357
二、药敏试验质量控制和质量评价 359
三、药敏试验报告规则与药敏折点判断 359
第二节 抗菌药物敏感性试验方法 360
一、基本原理 360
二、试验方法 360
三、军团菌药敏试验现状 364
第十九章 分子生物学技术在军团菌病诊断中应用 369
第一节 分子生物学技术研究现状 369
一、探针杂交技术的发展概况 369
二、聚合酶链反应技术的发展概况 370
三、基因测序分型研究现状 371
第二节 分子生物学技术在军团菌检测中应用 373
一、探针杂交技术在军团菌快速检测中应用 373
二、PCR在军团菌病快速诊断中应用 374
三、基因测序在军团菌病诊断中应用 375
第二十章 核酸杂交技术在军团菌病诊断中应用 378
第一节 地高辛标记探针检测嗜肺军团菌 378
一、基本原理 378
二、DNA探针的设计与标记 378
三、靶DNA制备 379
四、DNA结合于硝酸纤维膜上 379
五、探针与靶DNA杂交 379
六、杂交结果检测 380
七、结果判定 380
八、临床应用 380
第二节 反向斑点杂交检测嗜肺军团菌 381
一、基本原理 381
二、PCR引物和探针的设计 381
三、DNA提取 382
四、DNA的生物素标记 382
五、PCR扩增及DNA探针的纯化 382
六、反向杂交与结果判断 382
七、PCR-微孔板反向杂交 382
八、临床应用 383
第三节 聚合酶链反应结合探针杂交检测军团菌 384
一、基本原理 384
二、引物设计和合成 385
三、DNA提取 385
四、探针标记 385
五、PCR扩增 386
六、扩增产物的杂交检测 386
七、临床应用 388
第四节 荧光原位杂交在军团菌检测中应用 389
一、基本原理 389
二、试验方法 390
三、临床应用 393
第二十一章 聚合酶链反应（PCR）在军团菌检测中应用 396
第一节 概述 396
一、随机扩增多态性DNA技术（RAPD） 396
二、扩增片段长度多态性技术（AFLP） 397
三、脉冲场凝胶电泳（PFGE） 398
四、聚合酶链反应—直接测序分型（PCR—SBT） 398
第二节 常规PCR在军团菌病诊断中应用 399
一、基本原理 399
二、标本采集、运送与处理 400
三、试验菌株 400
四、PCR试验 401
五、临床应用 403
第三节 PCR酶切分型检测军团菌和嗜肺军团菌 403
一、基本原理 403
二、引物设计 404
三、试验菌株 404
四、主要试剂和仪器 406
五、基因组DNA提取 406
六、PCR扩增 406
七、酶切试验 406
八、特异性试验 406
九、结果判断 406
十、临床应用 408
第四节 巢式PCR酶切分型检测军团菌和嗜肺军团菌 409
一、基本原理 409
二、引物设计 410
三、标本采集与处理 410
四、DNA提取 410
五、PCR程序 410
六、快速酶切分型 411
七、特异性和敏感性 411
八、临床应用 412
第五节 扩增片段长度多态性分型检测嗜肺军团菌 413
一、基本原理 413
二、嗜肺军团菌AFLP分型试验方法 414
三、临床应用 416
第六节 实时荧光PCR检测军团菌和嗜肺军团菌 418
一、基本原理 418
二、引物和探针设计 418
三、试验方法 421
四、临床实际应用 423
第七节 荧光共振能量转移PCR检测嗜肺军团菌 425
一、基本原理 426
二、试验方法 426
三、临床实际应用 427
第八节 嗜肺军团菌毒力岛基因组PCR分型鉴定 430
一、毒力岛和毒力基因及其致病性 430
二、试验方法 431
三、临床实际应用 433
第九节 基因测序在军团菌分型鉴定中应用 435
一、嗜肺军团菌SBT基因测序分型 435
二、军团菌属基因测序分型 438
三、多位点（MLSA）测序分型 439
第二十二章 培养基和常用试剂配制 443
第一节 培养基制备一般准则 443
一、培养基制备基本要求 443
二、质量控制 444
第二节 军团菌常用培养基和生化反应试剂 444
一、军团菌选择性培养基 444
二、生化试验培养基 447
三、非军团菌选择性培养基 449
四、军团菌运送培养基 450
五、军团菌痰消化液（0.1%DTT） 451
第三节 常用试剂和染色液制备 451
一、酸缓冲液 451
二、磷酸盐缓冲液（PBS） 452
三、ELISA常用溶液配制 452
四、探针杂交试剂的配制 452
五、革兰染色法 453
六、复红染色 454
七、鞭毛染色法 454
八、不完全福氏佐剂配制 454
九、麦氏标准比浊管 455
十、离心力换算 456
附录 军团菌常用缩略语和名词中英文对照 458