1 DNA测序简介&Stuart M.Brown 1
2测序信息学的历史&Stuart M.Brown 21
3第二代测序数据的可视化&Phillip Ross Smith， Kranti Konganti和Stuart M.Brown 34
4 DNA序列比对&Efstratios Efstathiadis 48
5用广义de Bruijn有向图算法组装基因组&D.Frank Hsu 62
6用短序列读段从头组装细菌基因组&Silvia Argimon和Stuart M.Brown 73
7基因组注释&Steven Shen 84
8使用第二代测序技术检测序列变异&Jinhua Wang， Zuojian Tang和Stuart M.Brown 96
9 ChIP-seq&Zuojian Tang， Christina Schweikert， D.Frank Hsu和Stuart M.Brown 104
10使用第二代测序进行RNA测序&Stuart M.Brown， Jeremy Goecks和James Taylor 129
11元基因组学&Alexander Alekseyenko和Stuart M.Brown 143
12 DNA测序信息学中的高性能计算&Efstratios Efstathiadis和Eric R.Peskin 149
术语表 165
索引 174